제61조
Sec61| SecE/Sec61γ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||
| 기호 | 세크 | ||||||||
| Pfam | PF00584 | ||||||||
| 인터프로 | IPR001901 | ||||||||
| 프로사이트 | PS01067 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhz / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| OPM단백질 | 1rhz | ||||||||
| |||||||||
| SecG/Sec61β, 고고-eukaryotic | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||
| 기호 | Sec61_베타 | ||||||||
| Pfam | PF03911 | ||||||||
| 인터프로 | IPR016482 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhz / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| SecG, 박테리아 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||
| 기호 | 세크지 | ||||||||
| Pfam | PF03840 | ||||||||
| 인터프로 | IPR004692 | ||||||||
| OPM단백질 | 5와우 | ||||||||
| |||||||||
원핵생물에서 SecYEG라고 불리는 sec61은 생명의 모든 영역에서 발견되는 막 단백질 복합체다.반투명의 핵심 성분으로서 진핵생물의 내소성 망막과 원핵생물의 세포 밖으로 단백질을 운반한다.3개의 다른 서브유닛(히터트리메릭), SecY(α), SecE(γ), SecG(β)로 막을 통과하는 도넛 모양의 모공이다.그것은 ER로 들어가거나 나가는 전송을 차단하는 플러그라고 불리는 지역을 가지고 있다.이 플러그는 초기 폴리펩타이드의 소수성 영역이 심이라고 불리는 다른 영역과 상호작용할 때 교체되어 폴리펩타이드의 ER 루멘으로의 변환이 가능하다.[1]
구조
SecY/Sec61α 기공 구조에 관한 지식의 대부분은 고고학 버전의 X선 결정학적 구조에서 온다.[2]큰 SecY 하위 유닛은 2개의 절반인 트랜스 메모리 세그먼트 1-5와 트랜스 메모리 세그먼트 6-10으로 구성된다.그것들은 세포외 측면에서 트랜스 메모리 세그먼트 5와 6 사이의 루프에 의해 연결된다.SecY는 전면(측문)에서 측면으로 열 수 있다.SecE는 대부분의 종에서 단일 스패닝막 단백질이다.그것은 SecY의 뒤에 앉아, SecY의 두 반쪽을 감싸고 있다.Secβ(SecG)는 필수적이지 않다.그것은 SecY의 측면에 위치하며 그것과 거의 접촉하지 않는다.곁눈으로 보면 이 채널은 모래시계 모양으로 비어 있는 세포질 깔때기와 플러그라고 불리는 작은 나선형으로 채워진 세포외 깔때기가 있다.막의 중앙에는 측면 사슬을 안쪽으로 투영하는 소수성 아미노산의 모공 링에서 형성된 구조물이 있다.단백질 번역을 하는 동안 플러그를 밖으로 옮기고, 세포질 깔때기에서 세포외 깔때기인 모공 링을 거쳐 세포외 공간으로 폴리펩타이드 체인을 이동시킨다.막단백질의 소수성 세그먼트는 횡문을 통해 지질을 통해 옆으로 빠져나와 막간 신장 세그먼트가 된다.[2]
택슨으로
박테리아 SecYG 채널은 암호화된 단백질의 신호 시퀀스뿐만 아니라 번역을 주도하는 ATPase인 SecA와 상호작용한다.SecY는 419~492개 아미노산 잔류물의 일체형 플라즈마 막막 단백질로, 일반적으로 10개의 트랜섬브레인(TM), 6개의 세포질, 5개의 세포질 영역을 포함하고 있다.[3]
세카 대신 진핵성 반투명콘은 ER-루메날 샤페론 BiP를 사용해 번역을 추진할 수 있다.[citation needed]
고고학적 반투명체의 이해도가 낮다.호몰로그가 발견되었기 때문에 SecDF-YajC와 YidC를 박테리아처럼 사용할 수 있다.ATPase는 아직 확인되지 않았다.[4]
종별별
인간 단백질:
싹트기 효모에는 두 가지 동음이의 복합체가 있는데, 필수적인 복합체는 Sec61이라고 하고, 비 필수 복합체는 Ssh1이라고 한다.Ssh1은 Sec61과 마찬가지로 리보솜에 도킹한다.[5]
참고 항목
참조
- ^ Osborne AR, Rapoport TA, van den Berg B (2005). "Protein translocation by the Sec61/SecY channel". Annual Review of Cell and Developmental Biology. 21: 529–50. doi:10.1146/annurev.cellbio.21.012704.133214. PMID 16212506.
- ^ a b Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (January 2004). "X-ray structure of a protein-conducting channel". Nature. 427 (6969): 36–44. Bibcode:2004Natur.427...36B. doi:10.1038/nature02218. PMID 14661030. S2CID 4360143.
- ^ Ito K (September 1992). "SecY and integral membrane components of the Escherichia coli protein translocation system". Molecular Microbiology. 6 (17): 2423–8. doi:10.1111/j.1365-2958.1992.tb01417.x. PMID 1406280.
- ^ Calo, D; Eichler, J (March 2011). "Crossing the membrane in Archaea, the third domain of life". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. 1808 (3): 885–91. doi:10.1016/j.bbamem.2010.03.020. PMID 20347718.
- ^ Harty C, Römisch K (March 2013). "Analysis of Sec61p and Ssh1p interactions in the ER membrane using the split-ubiquitin system". BMC Cell Biology. 14: 14. doi:10.1186/1471-2121-14-14. PMC 3618304. PMID 23497013.
- 알버트, 브루스 외세포의 분자생물학.갈랜드, 2002년ISBN 0-8153-3218-1
