작은 카잘체 특이 RNA 6
Small Cajal body specific RNA 6| 작은 카잘체 특이 RNA 6 | |
|---|---|
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| 식별자 | |
| 기호. | 스카나6 |
| Alt. 기호 | U88 |
| Rfam | RF00478 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 진, snRNA, snoRNA, scaRNA |
| 도메인 | 진핵생물 |
| 가세요 | GO:0006396 GO:0005730 |
| 그렇게 | SO:0000275 |
| PDB 구조 | PDBe |
소형 카할 신체 특이 RNA 6(SCARNA6 또는 U88)은 카할 신체에서 발견되는 작은 핵소체 RNA로, U5 스플라이소좀 RNA의 유사 유리화(우리딘에서 의사우리딘으로의 이성화)에 관여하는 것으로 여겨진다.
scaRNA는 카잘체에 위치하여 전사된 스플라이소좀 RNA U1, U2, U4, U5 및 U12의 변형을 이끄는[1] 작은 핵소립 RNA의 특정 클래스이다.
U88은 피브릴린과 Gar1p 모두와 관련되어 있으며 카잘 [1]체내에서 코일린과 함께 국부적으로 발견된다.H/ACA 상자와 C/D 상자 보존 도메인으로 구성된다는 점에서 특이 안내 RNA입니다.U5 snRNA의 [1]잔류물 U41의 2'-O-메틸화를 유도할 것으로 예상된다.
U88은 또한 다른 인간 snoRNA scaRNA U87 및 마우스 호몰로그 [2]MBI-46과도 밀접한 관련이 있다.인간 게놈에서 U88과 U87 scaRNA는 모두 동일한 숙주 [1][3]유전자를 공유합니다.
레퍼런스
- ^ a b c d Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (June 2002). "Cajal body-specific small nuclear RNAs: a novel class of 2'-O-methylation and pseudouridylation guide RNAs". The EMBO Journal. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093/emboj/21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
- ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (June 2001). "RNomics: an experimental approach that identifies 201 candidates for novel, small, non-messenger RNAs in mouse". The EMBO Journal. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093/emboj/20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
- ^ Lestrade L, Weber MJ (January 2006). "snoRNA-LBME-db, a comprehensive database of human H/ACA and C/D box snoRNAs". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093/nar/gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
외부 링크
- Rfam의 작은 Cajal 신체 특이 RNA 6 페이지
- snoRNABase에서의 SCARNA6 엔트리
