소형 카잘체특이RNA
Small Cajal body-specific RNA| 작은 카잘체 특이 RNA 1 | |
|---|---|
 소형 카할체 특이 RNA 1의 2차 구조 예측 | |
| 식별자 | |
| 기호. | 스카나1 |
| Rfam | RF00553 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 유전자, snRNA, snoRNA, scaRNA |
| 도메인 | 척추뼈 |
| PDB 구조 | PDBe |
소형 카할 체특이적 RNA(scaRNA)는 작은 핵 RNA(snoRNA)의 한 종류로, 작은 핵 리보핵단백질(snRNPs) 또는 스너플(snurps)의 생물 형성에 관여하는 핵 기관(세포 하위 기관)인 카할 체에 특이적으로 국재한다.ScaRNA는 전사된 RNA 중합효소 II의 변형(메틸화 및 유사유도릴화)을 유도한다.
최초로 확인된 scaRNA는 U85였습니다.[1]이는 C/D 박스와 H/ACA 박스의 snoRNA 복합체라는 점에서 일반적인 snoRNA와 달리 의사유리지일화와 2'-O-메틸화를 모두 유도할 수 있습니다.모든 scaRNA가 복합 C/D 및 H/ACA 박스 snoRNA인 것은 아니며, 대부분의 scaRNA는 구조 및 기능적으로 snoRNA와 구별할 수 없으며, 핵에서 리보솜 RNA(RNA) 변형을 지시한다.
드로소필라스카RNA
여러 연구에서 드로소필라에서 [1][2][3][4][5]scaRNA가 확인되었다.연구 중 하나는 여러 Drosophila scaRNA가 Cajal [4]몸이 없는 돌연변이 파리의 핵생물에서 똑같이 잘 기능할 수 있다는 것을 보여주었다.추가 연구에서 scaRNA pugU6-40은 CB가 아닌 핵에서 변형이 일어나는 U6 snRNA를 표적으로 하며 pugU1-6 및 pug U2-55는 2 RNA: snRNA 및 28s rRNA를 [5]안내하는 것으로 나타났다.
소형 카잘체특이RNA1
분자생물학에서, 스몰 카할 신체 특이적 RNA 1(SCARNA1 또는 ACA35로도 알려져 있음)은 카할 신체에서 발견되는 작은 핵소체 RNA이며 잔류 U89에서 U2 스플라이세오솜 RNA의 유사유도화에 관여하는 것으로 여겨진다.
scaRNA1은 단백질로 변환되지 않은 유전자의 기능적 산물인 비코드 RNA이다.그러한 RNA 분자는 보통 중요한 2차 구조나 리간드 결합 모티브를 포함하고 세포 [6]내의 많은 중요한 생물학적 과정에 관여한다.
scaRNA1은 예측된 헤어핀-힌지-헤어핀-꼬리 구조를 가지며, 보존된 H/ACA-box 모티브를 가지며, GAR1 [7]단백질과 관련되어 있으므로 snoRNA의 H/ACA 박스 클래스에 속한다.
레퍼런스
- ^ a b Jády BE, Kiss T (February 2001). "A small nucleolar guide RNA functions both in 2′-O-ribose methylation and pseudouridylation of the U5 spliceosomal RNA". The EMBO Journal. 20 (3): 541–551. doi:10.1093/emboj/20.3.541. PMC 133463. PMID 11157760.
- ^ Tortoriello G, Accardo MC, Scialò F, Angrisani A, Turano M, Furia M (May 2009). "A novel Drosophila antisense scaRNA with a predicted guide function". Gene. 436 (1–2): 56–65. doi:10.1016/j.gene.2009.02.005. PMID 19230845.
- ^ Tycowski KT, Shu MD, Kukoyi A, Steitz JA (April 2009). "A conserved WD40 protein binds the Cajal body localization signal of scaRNP particles". Molecular Cell. 34 (1): 47–57. doi:10.1016/j.molcel.2009.02.020. PMC 2700737. PMID 19285445.
- ^ a b Deryusheva S, Gall JG (December 2009). "Small Cajal body-specific RNAs of Drosophila function in the absence of Cajal bodies". Molecular Biology of the Cell. 20 (24): 5250–5259. doi:10.1091/mbc.E09-09-0777. PMC 2793299. PMID 19846657.
- ^ a b Deryusheva S, Gall JG (December 2013). "Novel small Cajal-body-specific RNAs identified in Drosophila: probing guide RNA function". RNA. 19 (12): 1802–1814. doi:10.1261/rna.042028.113. PMC 3884663. PMID 24149844.
- ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (June 2002). "Cajal body-specific small nuclear RNAs: a novel class of 2′-O-methylation and pseudouridylation guide RNAs". The EMBO Journal. 21 (11): 2746–2756. doi:10.1093/emboj/21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (July 2004). "Human box H/ACA pseudouridylation guide RNA machinery". Molecular and Cellular Biology. 24 (13): 5797–5807. doi:10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC 480876. PMID 15199136.
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