합성 생물학 오픈 언어

Synthetic Biology Open Language

SBOL([1]Synthetic Biology Open Language)은 소프트웨어 패키지 간에 합성 생물학적 설계를 교환하기 위해 제안된 데이터 표준이다.[2]2008년부터 SBOL Developers Group이[3] 개발하고 있다.이 집단은 가능한 한 많은 이해관계를 포함하고 단일 기업의 지배를 피하기 위해 개방적이고 민주적인 방식으로 표준을 개발하는 것을 목표로 한다.이 그룹은 또한 합성 생물학의 분야가 이러한 발전을 반영함에 따라 시간이 지남에 따라 설계 표준을 개발하고 개선하는 것을 목표로 한다.null

SBOL 비주얼이라고 불리는 그래픽 모델링 언어도 SBOL 디자인을 시각화하기 위해 만들어졌다.[4]

SBOL(Synthetic Biology Open Language) 표준 시각 기호: 프로모터, 프라이머 바인딩 사이트, cds, 제한 사이트 등

릴리스

버전 날짜
1.0 2011년 11월
1.1 2012년 10월
2.0 2015년 7월
2.1.0 2016년[5] 10월

참조

  1. ^ "The Synthetic Biology Open Language (SBOL)".
  2. ^ Galdzicki, Michal; Clancy, Kevin P; Oberortner, Ernst; Pocock, Matthew; Quinn, Jacqueline Y; Rodriguez, Cesar A; Roehner, Nicholas; Wilson, Mandy L; Adam, Laura; Anderson, J Christopher; Bartley, Bryan A; Beal, Jacob; Chandran, Deepak; Chen, Joanna; Densmore, Douglas; Endy, Drew; Grünberg, Raik; Hallinan, Jennifer; Hillson, Nathan J; Johnson, Jeffrey D; Kuchinsky, Allan; Lux, Matthew; Misirli, Goksel; Peccoud, Jean; Plahar, Hector A; Sirin, Evren; Stan, Guy-Bart; Villalobos, Alan; Wipat, Anil; Gennari, John H; Myers, Chris J; Sauro, Herbert M (6 June 2014). "The Synthetic Biology Open Language (SBOL) provides a community standard for communicating designs in synthetic biology". Nature Biotechnology. 32 (6): 545–550. doi:10.1038/nbt.2891. PMID 24911500.
  3. ^ https://sbolstandard.org/development/gov/
  4. ^ Quinn, Jacqueline Y.; Cox, Robert Sidney; Adler, Aaron; Beal, Jacob; Bhatia, Swapnil; Cai, Yizhi; Chen, Joanna; Clancy, Kevin; Galdzicki, Michal; Hillson, Nathan J.; Le Novère, Nicolas; Maheshwari, Akshay J.; McLaughlin, James Alastair; Myers, Chris J.; P, Umesh; Pocock, Matthew; Rodriguez, Cesar; Soldatova, Larisa; Stan, Guy-Bart V.; Swainston, Neil; Wipat, Anil; Sauro, Herbert M. (3 December 2015). "SBOL Visual: A Graphical Language for Genetic Designs". PLOS Biology. 13 (12): e1002310. doi:10.1371/journal.pbio.1002310. PMC 4669170. PMID 26633141.
  5. ^ Beal, Jacob; Cox, Robert Sidney; Grünberg, Raik; McLaughlin, James; Nguyen, Tramy; Bartley, Bryan; Bissell, Michael; Choi, Kiri; Clancy, Kevin; MacKlin, Chris; Madsen, Curtis; Misirli, Goksel; Oberortner, Ernst; Pocock, Matthew; Roehner, Nicholas; Samineni, Meher; Zhang, Michael; Zhang, Zhen; Zundel, Zach; Gennari, John H.; Myers, Chris; Sauro, Herbert; Wipat, Anil (2016). "Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.1.0". Journal of Integrative Bioinformatics. 13 (3): 291. doi:10.1515/jib-2016-291. PMID 28187407.