TCAIM

TCAIM
TCAIM
식별자
에일리어스TCAIM, C3orf23, TOAG-1, TOAG1, T세포활성화억제제, 미토콘드리아, T세포활성화억제제, 미토콘드리아
외부 IDMGI: 1196217 HomoloGene: 45481 GeneCard: TCAIM
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

285343

382117

앙상블

ENSG00000179152

ENSMUSG000046603

유니프로트

Q8N3R3

Q66JZ4

RefSeq(mRNA)

NM_001013405

RefSeq(단백질)

NP_001013423

장소(UCSC)Chr 3: 44.34 ~44.41 MbChr 9: 122.63 ~122.67 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

TCAIM은 인간에서[5][6] TCAIM 유전자(T세포 활성화 억제제, 미토콘드리아)에 의해 암호화되는 단백질이다.


진

이 유전자는 3번 염색체, 3p21.31 위치에 있으며 길이는 71,333개입니다.아래의 그림은 그림 1.2와 같다.TCAIM 단백질의 길이는 496이고 무게는 57925Da이다.그것은 네 가지 다른 등각 형태로 존재한다.TCAIM은 다른 종들 사이에서 보존성이 높지만, 알려진 기능을 가진 단백질 계열에 대한 상동성은 [7]발견되지 않았다.

성적표

8개의 스플라이스된 엑손이 번갈아 존재하며, 4개의 트랜스크립트 배리언트를 부호화합니다.1차 전사물인 3520 bp는 인간 아이소폼 1이 직교 단백질과 높은 동일성을 가지며 직교 단백질 사이에서 잘 보존된다.X1 전사체에는 11개의 엑손이 포함되어 있으며,[8] 이 엑손은 496개의 아미노산 잔류물인 폴리펩타이드를 생성한다.

C3orf23의 게놈 콘텍스트 그림.이 세그먼트는 염색체 3의 약 150,000개의 염기쌍을 묘사합니다.녹색 선이 있는 빨간색 다이아몬드는 전사의 시작을 나타냅니다.C3orf23은 상류유전자와 같은 방향으로 전사되며, 하류유전자와 반대방향으로 전사된다.

단백질

일반 속성

소유물 프로테인자 절단단백질 숙성 단백질
아미노산 길이 496 470 470
등전점 8.7 8.5 8.2-8.6
분자량 58 kdal 55kdal ~55-57

등전점은 인간 단백질의 평균(6.81)[9]보다 유의하게 크다.

구조.

오른쪽에 보이는 것은 단백질의 예측된 3차 구조입니다.그것은 대부분 여러 코일 영역과 단백질의 길이에 걸쳐 분산된 가닥을 가진 긴 알파 헬리크로 구성되어 있습니다.단백질의 끝은 N- 및 C- 끝의 반대쪽 코일 영역으로 구성됩니다.

ITASSER 소프트웨어에 [10]의해 생성된 TCAIM의 제3차 구조를 예측.

표현

TCAIM은 [11]체내 대부분의 조직에서 적당히 발현된다(50~75%).그러나 TCAIM mRNA 발현에 대한 질병 상태의 영향을 논의하는 NCBI GEO에 대한 연구는 HPV 음성 조직에 비해 HPV 양성 조직에서 단백질 발현이 실제로 증가했음을 발견했다.또 다른 연구는 TCAIM 발현이 2형 당뇨병과 인슐린 저항성을 가진 개인에서 증가했다는 것을 발견했다.TCAIM의 표현은 다양한 [12]경우에서 특정 질병 상태에 따라 달라지는 것으로 보인다.

인체 [11]내 TCAIM 발현.

세포내 현지화

단백질은 미토콘드리아 [13]기질에 위치하는 미토콘드리아 신호 펩타이드를 포함한다.EXPASY 현지화 소프트웨어를[14] 통한 분석 결과 이 결과가 확인되었습니다.인간 단백질의 높은 등전점은 미토콘드리아 기질의 높은 pH로 인해 미토콘드리아 국부화에 대한 추가 증거를 제공한다.

번역 후 수정

균열 부위

단백질은 처음에 N 말단에서 26개의 아미노산을 제거하기 위해 분해된다.이것은 미토콘드리아에 [13]국소화된 후 신호 펩타이드를 나타낸다.

인산화

오른쪽 그림과 같이 예측된 인산화 부위가 다수 있습니다.세린 잔기는 트레오닌 또는 티로신 잔기보다 인산화 과정을 거칠 가능성이 높다.

TCAIM 인산화 사이트.[15]

O결합 배당체화

오른쪽에는 예측된 o링크 사이트가 다수 표시되어 있습니다.지금까지 [when?]실험적으로 밝혀진 것은 없다.

TCAIM O-연결 글리코실화 부위.[16]

호몰로지와 진화

호몰로그

호모 사피엔스 TCAIM과 다니오 레리오(제브라피쉬) 호몰로그의 정렬은 SDSC 워크벤치를 사용하여 수행되었다.두 맞춤법 사이에는 약 55%의 동일성이 있으며 전체 정렬 점수는 1817입니다.두 개의 맞춤법은 시퀀스 전체에서 일관되게 유사합니다.두 유전자의 차이는 두 배열 전체에 흩어져 있는 보존되지 않은 반보존 잔류물의 무작위적인 세그먼트에 기인한다.이러한 차이는 두 [17]유기체 간의 비관련성 때문일 수 있다.

시토크롬 C 및 피브리노겐과 비교한 TCAIM의 진화.

진화사

TCAIM은 시토크롬 C보다 훨씬 빠르게 분화했지만 [18]피브리노겐보다는 약간 느렸다.

기능.

기능에 대해서는 많이 알려져 있지 않다; 이 단백질이 T세포의 아포토시스(apoptosis)에 역할을 할 수 있다고 추측된다.TCAIM은 미토콘드리아를 [19]통한 선천적 면역 시그널링에 역할을 할 수 있다.

임상적 의의

연구는 Vogel 등에 의해 수행되었다.그들은 이전에 TCAIM이 내성이 발달하는 이식 환자의 이식편과 조직에서 매우 높게 발현되고 단백질이 미토콘드리아에 국소화된다는 것을 발견했다.이 연구에서 TCAIM은 CD11c(+) 수지상 [19]세포와 상호작용하며 CD11c(+) 수지상 세포에 의해 조절된다는 것을 발견했다.Hendrikson et. el.의 또 다른 기사는 TCAIM에 대해 간략히 언급하고 있다.그들은 핵으로 인코딩된 미토콘드리아 유전자의 유전자 변형이 에이즈 [7]진행에 영향을 미친다는 것을 발견했다.세 번째 기사는 TCAIM(미토콘드리아 유전자와 함께)[20]이 환자에게 동종이식을 받아들일 수 있는지 거부할 수 있는지를 예측하는 지표로 사용될 수 있다는 증거를 찾는 또 다른 연구이다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000179152 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000046603 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T, Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG, Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (Dec 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
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  14. ^ "ExPASy: SIB Bioinformatics Resource Portal - Categories".
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외부 링크

추가 정보