USP4

USP4
USP4
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스USP4, UNP, Unph, 유비퀴틴특이펩티드가수분해효소4
외부 IDOMIM: 603486 MGI: 98905 HomoloGene: 20716 GeneCard: USP4
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_19943
NM_001251877
NM_003363

NM_011678
NM_001311157

RefSeq(단백질)

NP_001238806
NP_003354
NP_955475

NP_001298086
NP_035808

장소(UCSC)Chr 3: 49.28 ~49.34 MbChr 9: 108.23 ~108.27 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

유비퀴틴특이단백질가수분해효소(USP4)는 다수의 단백질 [5]기질로부터 유비퀴틴을 분리하는 효소이다.명명법이 표준화되기 전에는 USP4는 UNP로 알려져 있었으며 [6]포유동물에서 확인된 최초의 탈유화효소 중 하나였다.생쥐와 사람에서 USP4 단백질은 22엑손[7][8][9]포함한 유전자에 의해 암호화된다.

이 단백질은 시스테인 펩티드가수분해효소 C19의 구성원이다.탈유비퀴틴화효소로서 [10]유비퀴틴-프롤린 결합을 분해하는 능력이 있는 것은 이례적이다.이러한 특성은 효소의 활성 부위의 구조적 유연성을 반영할 수 있으며, 다양한 결합의 유비퀴틴 사슬을 절단하는 능력을 설명할 수 있다.USP4는 NF-δB, TGF-β, Wnt/β-카테닌, p53스플라이세오솜 경로를 포함한 다수의 세포 신호 전달 경로에서 중요한 기능의 기질을 가진다.다른 기질에는 아데노신 A2A 수용체와 Ro52(TRIM21) 단백질이 포함된다.

USP4는 기능성 핵국재신호(NLS) QPQKKKK772 핵수출신호([11]NES) VEVYLLELKL을142 가진 핵세포질 셔팅 단백질이다.이러한 신호는 각각 세포질에서 핵으로 USP4의 전이를 시작하며 그 반대도 마찬가지입니다.핵 USP4 풀에 대한 세포질의 비율은 세포 유형, 세포 주기의 위상 및 단백질 [11]발현 수준에 따라 달라집니다.

상호 작용

USP4는 종양억제제 pRb 단백질 및 포켓 관련 단백질 p107[12]p130과 상호작용하는 으로 나타났다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000114316 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000032612 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Gray D (2012). "Chapter 462". In Rawlings & Salvesen (ed.). Handbook of Proteolytic Enzymes (3rd ed.). Elsevier. ISBN 9780123822192.
  6. ^ Gupta K, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Gray DA (August 1993). "Unp, a mouse gene related to the tre oncogene". Oncogene. 8 (8): 2307–10. PMID 8336951.
  7. ^ Di Fruscio M, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (May 1998). "Genomic structure of Unp, a murine gene encoding a ubiquitin-specific protease". Biochim. Biophys. Acta. 1398 (1): 9–17. doi:10.1016/s0167-4781(98)00035-9. PMID 9602026.
  8. ^ Puente XS, Sanchez LM, Overall CM, Lopez-Otin C (July 2003). "Human and mouse proteases: a comparative genomic approach". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–558. doi:10.1038/nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
  9. ^ "Entrez Gene: USP4 ubiquitin specific peptidase 4 (proto-oncogene)".
  10. ^ Gilchrist CA, Gray DA, Baker RT (December 1997). "A ubiquitin-specific protease that efficiently cleaves the ubiquitin-proline bond". J. Biol. Chem. 272 (51): 32280–5. doi:10.1074/jbc.272.51.32280. PMID 9405433.
  11. ^ a b Soboleva, Tatiana A.; Jans, David A.; Johnson-Saliba, Melanie; Baker, Rohan T. (2004-10-18). "Nuclear-Cytoplasmic Shuttling of the Oncogenic Mouse UNP/USP4 Deubiquitylating Enzyme". Journal of Biological Chemistry. 280 (1): 745–752. doi:10.1074/jbc.m401394200. ISSN 0021-9258. PMID 15494318.
  12. ^ Blanchette, Paola; Gilchrist, Catherine A; Baker, Rohan T; Gray, Douglas A (September 2001). "Association of UNP, a ubiquitin-specific protease, with the pocket proteins pRb, p107 and p130". Oncogene. 20 (39): 5533–5537. doi:10.1038/sj.onc.1204823. ISSN 0950-9232. PMID 11571651.

추가 정보

외부 링크

  • PDBUniProt: Q13107(유비퀴틴 카르복실 말단 가수분해효소 4)에서 PDB에 이용 가능한 모든 구조 정보의 개요.