100K 병원체 게놈 프로젝트

100K Pathogen Genome Project
영국 10만 게놈 프로젝트와 혼동하지 말자.
100K 병원체 게놈 프로젝트
프로젝트 유형학술적, 공공적, 사적 협력 관계
기간2012년 7월 –
웹사이트100kgenomes.org

100K 병원체 게놈 프로젝트는 2012년 7월 바트 바이머(UC 데이비스)가 학술·공공·민간 파트너십으로 시작한 프로젝트다.[1]감염성 미생물 10만종의 게놈의 염기서열을 분석하여 공중보건, 발생검출, 세균병원체 검출 등에 활용할 수 있는 세균 게놈 염기서열 데이터베이스를 만드는 것을 목표로 한다.이렇게 되면 식인성 질환의 진단이 빨라지고 전염병 발생도 짧아진다.[2]

100K 병원체 게놈 프로젝트는 감염성 미생물 10만 마리의 게놈을 염기서열화하는 민관협력 프로젝트다.100K 게놈 프로젝트는 병원균을 식별하고 그 기원을 더 빨리 추적하기 위한 검사 개발 로드맵을 제공할 것이다.

프로젝트 시작 시 발표된 파트너는 UC 데이비스, 애질런트테크놀로지스, 미국 식품의약국 등이며, 미국 질병통제예방센터와 미국 농무부가 협력자로 지목되었다.프로젝트가 진행됨에 따라, 파트너십은 이러한 창립 파트너를 포함하거나 대체하는 방향으로 발전해 왔다.100K 병원체 게놈 프로젝트는 IBM/Mars 식품안전 컨소시엄이 메타게놈 시퀀스에 대해 선정했다.[citation needed]

100K 병원체 게놈 프로젝트는 대상 미생물의 게놈을 조사하기 위해 고투과 차세대 염기서열분석(NGS)을 진행하고 있으며, 소수의 미생물에 대해 전체 게놈 염기서열을 실시해 참조 게놈으로 사용하고 있다.대부분의 박테리아 변종은 염기 게놈으로 배열되어 조립될 것이지만, 이 프로젝트는 또한 100K 바이오프로젝트에서 다양한 장내 병원균을 위한 폐쇄형 게놈을 생산했다.[3]

이 전략은 중요한 병원체 특성과 관련된 유전자 바이오마커 집합을 식별하기 위해 전세계적인 협업을 가능하게 한다.이 5년간의 미생물 병원체 프로젝트는 각 병원체의 게놈에 대한 시퀀스 정보를 포함하는 무료 공공 데이터베이스를 만들 것이다.완성된 유전자 배열은 국립보건원(NIH)의 국립생명공학정보센터(NCBI)의 공개 데이터베이스에 저장될 예정이다.[4]이 데이터베이스를 사용하여 과학자들은 먹이사슬에서 질병을 일으키는 박테리아를 통제하는 새로운 방법을 개발할 수 있을 것이다.

참조

  1. ^ Burton, Thomas (12 July 2012). "FDA Aims to Track Food-Borne Bacteria's Genetic Codes". Wall Street Journal. Retrieved 16 July 2018.
  2. ^ Curtis Allen (12 July 2012). "FDA, UC Davis, Agilent Technologies and CDC to create publicly available food pathogen genome database". U.S. Department of Health and Human Services. Archived from the original on 2 December 2016. Retrieved 2 December 2016.
  3. ^ "100K Food Pathogen Project". U.S. National Library of Medicine. Retrieved 1 December 2016.
  4. ^ "100K Genome Project Launched to Sequence Genomes of Foodborne, Waterborne Pathogens". Genomeweb LLC. 12 July 2012. Archived from the original on 2 December 2016. Retrieved 2 December 2016.

외부 링크