아르마딜로 반복
Armadillo repeat아르마딜로 반복 영역 | |||||||||
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![]() 베타 카테닌의 5아르마딜로 영역의 구조.[1] | |||||||||
식별자 | |||||||||
기호 | 팔 | ||||||||
Pfam | PF00514 | ||||||||
Pfam 씨 | CL0020 | ||||||||
인터프로 | IPR000225 | ||||||||
스마트 | SM00185 | ||||||||
프로사이트 | PS50176 | ||||||||
SCOP2 | 3bct / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00020 | ||||||||
멤브라노메 | 350 | ||||||||
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아르마딜로 반복은 많은 단백질에서 발견되는 약 40개의 잔여물의 특징적이고 반복적인 아미노산 배열의 이름이다.아르마딜로 반복을 포함하는 단백질은 전형적으로 몇 개의 반복된 복제품을 포함한다.[2][3]각각의 아르마딜로 반복은 머리핀 구조를 형성하는 알파 나선형으로 구성된다.알파 솔레노이드 구조로 알려진 반복 양식의 여러 복사본.
아르마딜로 반복을 포함하는 단백질의 예로는 β-카테닌, α-importin,[4] 플라코글로빈,[5] 아데노마성대장균(APC)[6] 등이 있다.
아르마딜로라는 용어는 아르마딜로 반복이 처음 발견된 초파리 드로소필라에서 β-카테닌 유전자의 역사적 이름에서 유래한다.이전에는 β-카테닌이 카데린 세포 접착 단백질을 시토스켈레톤에 연결하는 데 관여하는 단백질로 믿었지만, 최근의 연구는 β-카테닌이 알파-카테닌의 호모디메르화를 조절하고, 이는 다시 분기와 번들링에 작용한다는 것을 보여준다.[7]그러나 아르마딜로 반복은 다른 기능을 가진 광범위한 단백질에서 발견된다.이러한 유형의 단백질 영역은 배아 발달 중 WNT 신호를 변환하는 데 중요하다.
구조
아르마딜로 반복의 3차원 접힘은 베타 카테닌의 결정 구조에서 처음 관찰되었는데, 여기서 12 탠덤 반복은 단위당 3개의 나선형으로 알파 나선형의 슈퍼히릭을 형성한다.[1]원통형 구조는 양전하를 띤 홈이 특징이며, 이는 아마도 베타-카테닌의 알려진 상호작용 파트너의 산성 표면과 상호 작용하는 것으로 추정된다.[8]
참조
- ^ a b Huber AH, Nelson WJ, Weis WI (September 1997). "Three-dimensional structure of the armadillo repeat region of beta-catenin". Cell. 90 (5): 871–82. doi:10.1016/S0092-8674(00)80352-9. PMID 9298899. S2CID 18612343.
- ^ Peifer M, Berg S, Reynolds AB (1994). "A repeating amino acid motif shared by proteins with diverse cellular roles". Cell. 76 (5): 789–91. doi:10.1016/0092-8674(94)90353-0. PMID 7907279. S2CID 26528190.
- ^ Groves MR, Barford D (1999). "Topological characteristics of helical repeat proteins". Current Opinion in Structural Biology. 9 (3): 383–9. doi:10.1016/S0959-440X(99)80052-9. PMID 10361086.
- ^ Herold A, Truant R, Wiegand H, Cullen BR (October 1998). "Determination of the functional domain organization of the importin alpha nuclear import factor". J. Cell Biol. 143 (2): 309–18. doi:10.1083/jcb.143.2.309. PMC 2132842. PMID 9786944.
- ^ McCrea PD, Turck CW, Gumbiner B (November 1991). "A homolog of the armadillo protein in Drosophila (plakoglobin) associated with E-cadherin". Science. 254 (5036): 1359–61. Bibcode:1991Sci...254.1359M. doi:10.1126/science.1962194. PMID 1962194.
- ^ Hirschl D, Bayer P, Müller O (March 1996). "Secondary structure of an armadillo single repeat from the APC protein". FEBS Lett. 383 (1–2): 31–6. doi:10.1016/0014-5793(96)00215-3. PMID 8612785. S2CID 36190869.
- ^ 누스, 로엘, 그리고 한스 클레버스."Wnt/THB²-카테닌 신호, 질병 및 신흥 치료 양식."셀, 169권, 번호 6, 2017년 6월 1일 페이지 985–999, doi:10.1016/j.cell.2017.05.016.
- ^ "Armadillo (IPR000225)". InterPro. EMBL-EBI.
외부 링크
- 진핵 선형 모티브 리소스 모티브 클래스 TRG_NLS_Bipartite_1
- 진핵 선형 모티브 리소스 모티브 클래스 TRG_NLS_MonoCore_2
- 진핵 선형 모티브 리소스 모티브 클래스 TRG_NLS_MonoExtC_3
- 진핵 선형 모티브 리소스 모티브 클래스 TRG_NLS_MonoExtN_4
- 미국 국립 의학 도서관의 Armadillo+Domain+단백질(MesH)
- PROSITE에서 아르마딜로/플라코글로빈 암 반복