ATG3

ATG3
자포세포증 관련 단백질 N단말기
식별자
기호오토파기_n
PfamPF03986
인터프로IPR007134
자가포모세포증 관련 단백질 활성 사이트 도메인
식별자
기호Autophagy_act_c
PfamPF03987
인터프로IPR007135
자포세포증 관련 단백질 C-단자
식별자
기호오토파기_Cterm
PfamPF10381
인터프로IPR019461

분자생물학에서 자가포기 관련 3(Atg3)은 LC3 지질화 과정을 위한 E2 효소다.[1] 그것은 자기소개를 위해 필수적이다. 초단백질 복합체인 Atg16L 복합체는 복수의 Atg12-Atg5 접합체로 구성된다. Atg16L은 LC3 지질 반응에서 E3과 같은 역할을 한다. 활성화된 중간중간 LC3-Atg3(E2)는 지질이 이루어지는 현장에 모집된다.[2]

atg3는 atg8과 phosphatyletanolamine(PE)의 결합을 촉매로 만든다. atg3에는 알파/베타폴드가 있으며, 핵심 부위는 위상학적으로 표준 E2 효소와 유사하다. atg3는 코어 영역에 두 개의 영역이 삽입되어 있고, 또 다른 영역은 코어 영역에서 30A까지 돌출되어 있는 긴 알파헬리컬 구조를 가지고 있다.[3] 그것은 Cys-288과 atg8의 C-단자 글리 사이의 중간 티오에스터 결합을 통해 atg8과 상호작용한다. 또한 E1 유사 atg7 효소의 C-단자영역과도 상호작용한다.

자포세포 분열은 세포질 단백질을 라이소솜/바쿠올레로 운반하는 것을 담당하는 기아에 의한 과정이다. atg3는 위상학적으로 표준 E2 효소와 유사한 유비퀴틴과 같은 수식어다.[4] Atg8과 인산염다닐타놀라민의 결합을 촉진한다.[5]

atg3는 세 개의 영역, 즉 N-단자 영역, 촉매 영역, C-단자 영역으로 구성된다. 촉매 영역은 HPC 모티브 내에 시스틴 잔류물을 포함하며, 이는 자기소포좀 단지의 Apg5 하위 단위를 인식하기 위한 투입 활성 현장 잔류물이다.[6] 작은 C-단자 영역은 자포자충 콤플렉스의 안정성을 위해 뚜렷한 결합 영역이 될 가능성이 높다.[7] 매우 독특한 보존 FLKF 시퀀스 모티브를 가지고 있다.

참조

  1. ^ Fujita N, Itoh T, Omori H, Fukuda M, Noda T, Yoshimori T (May 2008). "The Atg16L complex specifies the site of LC3 lipidation for membrane biogenesis in autophagy". Mol. Biol. Cell. 19 (5): 2092–100. doi:10.1091/mbc.E07-12-1257. PMC 2366860. PMID 18321988.
  2. ^ Noda T, Fujita N, Yoshimori T (May 2008). "The Ubi brothers reunited". Autophagy. 4 (4): 540–1. doi:10.4161/auto.5973. PMID 18398292.
  3. ^ Yamada Y, Suzuki NN, Hanada T, Ichimura Y, Kumeta H, Fujioka Y, Ohsumi Y, Inagaki F (March 2007). "The crystal structure of Atg3, an autophagy-related ubiquitin carrier protein (E2) enzyme that mediates Atg8 lipidation". J. Biol. Chem. 282 (11): 8036–43. doi:10.1074/jbc.M611473200. PMID 17227760.
  4. ^ Tanida I, Tanida-Miyake E, Komatsu M, Ueno T, Kominami E (April 2002). "Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p". J. Biol. Chem. 277 (16): 13739–44. doi:10.1074/jbc.M200385200. PMID 11825910.
  5. ^ Schlumpberger M, Schaeffeler E, Straub M, Bredschneider M, Wolf DH, Thumm M (February 1997). "AUT1, a gene essential for autophagocytosis in the yeast Saccharomyces cerevisiae". J. Bacteriol. 179 (4): 1068–76. doi:10.1128/jb.179.4.1068-1076.1997. PMC 178799. PMID 9023185.
  6. ^ Mizushima N, Yoshimori T, Ohsumi Y (December 2002). "Mouse Apg10 as an Apg12-conjugating enzyme: analysis by the conjugation-mediated yeast two-hybrid method". FEBS Lett. 532 (3): 450–4. doi:10.1016/S0014-5793(02)03739-0. PMID 12482611. S2CID 37247321.
  7. ^ Mizushima N, Yoshimori T, Ohsumi Y (May 2003). "Role of the Apg12 conjugation system in mammalian autophagy". Int. J. Biochem. Cell Biol. 35 (5): 553–61. doi:10.1016/S1357-2725(02)00343-6. PMID 12672448.
이 글에는 공용 도메인 PfamInterPro의 텍스트가 포함되어 있다: IPR007134
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