키루스 초티아

Cyrus Chothia
키루스 초티아

Cyrus Chothia ISMB 2015.jpg
2015년 ISMB 콘퍼런스에서 사이러스 초치아.
태어난
키루스호미쵸티아

(1942-02-19)19[1] 1942년 2월 19일
죽은2019년 11월 26일(2019-11-26) (77세)[2]
교육앨리언스 스쿨[3]
모교
수상
과학 경력
기관
논문콜린거성 신경 수용체에서 활성하는 일부 분자의 결정 구조 (1973)
박사학위 자문위원피터 J. 폴링[7]
기타학술고문마이클 레빗[8]
프레데릭 M. 리차드[8]
박사과정 학생
기타 저명한 학생아서 레스크 (포스트닥)
웹사이트www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/group-leaders/emeritus/cyrus-chothia

키루스 호미 초티아(Cyrus Homi Chothia, 1942년 2월 19일 ~ 2019년 11월 26일)[1] FRS[21][2] 영국 생화학자로, 케임브리지[22][23] 대학 의학연구회(MRC) 분자생물학연구소(LMB)의 명예 과학자였으며, 케임브리지 울프슨 칼리지의 명예교수였다.[21][24][25][26][27][28][29]

교육

조티아는 앨리언스 학교에서 교육을 받은 [3]뒤 1965년 더럼 대학교에서 과학 학사 학위를 받고 공부했다.[1] 그 후 조티아는 1967년 비르크벡 대학에서 과학 석사 학위를, 리누스 폴링 [31]아들인 피터 폴링[위키다타]의 감독하에 유니버시티 칼리지 런던[30] 박사 학위를 취득했다.

연구 및 경력

그의 박사 Chothia가 분자생물학 연구소에서 3년 동안 일한 후. 그 후 그는 바이즈만 과학[32][33] 연구소에서 마이클 레빗[8] 함께 일했고 이어 파리의 파스퇴르 연구소에서 조엘 재닌과 2년 동안 함께 일했다.[34]

1976년 조티아는 런던대학과 LMB에서 일하기 위해 영국으로 돌아왔다. 그는 아서 레스크[6][35] 함께 단백질이 구조의 변화에 의해 돌연변이에 적응한다는 것을 보여주었다.

1992년에 그는 대부분의 단백질은 소수의 가족에서 오는 도메인으로 만들어질 것을 제안했다.[36] 그는 알렉세이 머진, 스티븐 브레너, 팀 허버드와 협력하여 알려진 모든 단백질 구조에 대한 주기율표[37][38]단백질의 구조 분류 데이터베이스(SCOP)를 만들었다. 줄리안 고흐[17] 함께 그는 알려진 구조의 단백질 서열과 관련된 단백질 서열을 식별하기 위해 히든 마코프 모델을 사용하는 슈퍼 패밀리 데이터베이스[39] 만들었다.

그는 활동 기간 동안 Chothia 알렉스 Bateman,[9]스티븐 E. Brenner,[13]마크 벤더 Gerstein,[14]줄리언 Gough,[16]사라 Teichmann,[18]Bissan Al-Lazikani,[41][42][43]비안 고가 Apic,[44]사만다 Barré[표창 필요한][45]매튜 Bashton,[46][47][48][49]댄 Bolser,[50]마이클 Bremang,[51]포함 completion[40]에 19성공적인 박사 과정의 학생들이 감독했다.베르나르 드 Bono,[52][53]엠마 Ganley(힐 née)[54][55][56]마틴 Madera,[57][58]Siarhei Maslau,[59]수잔은 매체를 이용.r,[60][61][62] 종박([63][64][65]일명 종박), 라지쿠마르 사시다란,[66][67] 크리스틴 보겔.[68][69]

수상 및 명예

조티아는 2000년에 왕립학회 회원으로 선출되었다.[1] 그의 당선 증명서와 솔직담백한 내용은 다음과 같다.

Chothia 박사는 단백질의 아미노 시퀀스가 어떻게 그들의 구조, 기능, 진화를 결정하는지 보여주었다. 그들의 구조 규칙성의 분석으로부터, 그는 현재 일반적으로 사용되고 있는 단백질 구조의 분류를 개발했다. 그의 단백질 진화 그림은 단백질이 어떻게 분화하여 새로운 기능을 얻는가를 암시한다. 그는 그들의 겉보기에 약간 다른 구조들로 구성된 그들의 겉보기에 제한되어 있는 면역글로빈이 어떻게 거의 무제한의 다양한 항원을 인식할 수 있는지를 이해하는데 도움을 주었다.[70]

2015년 초티아는 국제 계산생물학회(ISCB)[71] 회원으로 선출돼 단백질 구조를 이해하기 위해 계산법을 사용한 공로를 인정받아 원로과학자상으로부터 ISCB 성취상을 받았다.[4][72]

데이비드 하우슬러, 마이클 워터맨과 함께, 조티아는 생물정보학 분야에 기여한 공로로 2015년데이비드 상을 받았다.[5]

참조

  1. ^ a b c d Anon (2014). "Chothia, Cyrus Homi". Who's Who. ukwhoswho.com (online Oxford University Press ed.). A & C Black, an imprint of Bloomsbury Publishing plc. doi:10.1093/ww/9780199540884.013.10866. (구독 또는 영국 공공도서관 회원 필요) (필요한 경우)
  2. ^ a b "Cyrus Chothia (1942–2019)". Retrieved 27 November 2019.
  3. ^ a b "Dan David Prize Awarded to Dr Cyrus Chothia". Alleyn's School. Archived from the original on 23 March 2015.
  4. ^ a b "ISCB Cyrus Chothia, Curtis Huttenhower, and Larry Hunter Named 2015 ISCB Award Winners". Archived from the original on 11 February 2015.
  5. ^ a b "Wikipedia co-founder Jimmy Wales among 2015 Dan David Prize winners". Retrieved 13 February 2015.
  6. ^ a b Lesk, A.; Chothia, C. (1980). "How different amino acid sequences determine similar protein structures: The structure and evolutionary dynamics of the globins". Journal of Molecular Biology. 136 (3): 225–270. doi:10.1016/0022-2836(80)90373-3. PMID 7373651.
  7. ^ a b 수학계보 프로젝트 키루스 초티아
  8. ^ a b c "Cyrus H. Chothia, Chemistry Tree". Archived from the original on 27 February 2015.
  9. ^ a b Bateman, Alexander George (1997). Evolution of the structure and function of the immunoglobulin superfamily (PhD thesis). University of Cambridge.
  10. ^ "Dr Alex Bateman – Wellcome Trust Sanger Institute". Archived from the original on 25 February 2012.
  11. ^ Bateman, A; Eddy, S. R.; Chothia, C (1996). "Members of the immunoglobulin superfamily in bacteria". Protein Science. 5 (9): 1939–41. doi:10.1002/pro.5560050923. PMC 2143528. PMID 8880921.
  12. ^ Bateman, A; Chothia, C (1995). "Outline structures for the extracellular domains of the fibroblast growth factor receptors". Nature Structural Biology. 2 (12): 1068–74. doi:10.1038/nsb1295-1068. PMID 8846218. S2CID 20501031.
  13. ^ a b Brenner, Steven Elliot (1996). Molecular propinquity : evolutionary and structural relationships of proteins. lib.cam.ac.uk (PhD thesis). University of Cambridge. EThOS uk.bl.ethos.596888.
  14. ^ a b Gerstein, Mark Bender (1992). Protein recognition : surfaces and conformational change (PhD thesis). University of Cambridge.
  15. ^ Gerstein, M.; Chothia, C. (1991). "Analysis of protein loop closure. Two types of hinges produce one motion in lactate dehydrogenase". Journal of Molecular Biology. 220 (1): 133–149. doi:10.1016/0022-2836(91)90387-L. PMID 2067013.
  16. ^ a b Gough, Julian John Thurstan (2002). Hidden Markov models and their application to genome analysis in the context of protein structure (PDF) (PhD thesis). University of Cambridge. EThOS uk.bl.ethos.599547. Archived from the original (PDF) on 11 March 2015.
  17. ^ a b "Dr. Julian Gough's home page at the University of Bristol". Archived from the original on 25 February 2012.
  18. ^ a b Teichmann, Sarah Amalia (1999). Genome evolution : analysing proteomes with new methods (PhD thesis). University of Cambridge.
  19. ^ Park, J; Teichmann, S. A.; Hubbard, T; Chothia, C (1997). "Intermediate sequences increase the detection of homology between sequences". Journal of Molecular Biology. 273 (1): 349–54. doi:10.1006/jmbi.1997.1288. PMID 9367767.
  20. ^ Teichmann, S. A.; Park, J; Chothia, C (1998). "Structural assignments to the Mycoplasma genitalium proteins show extensive gene duplications and domain rearrangements". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (25): 14658–63. Bibcode:1998PNAS...9514658T. doi:10.1073/pnas.95.25.14658. PMC 24505. PMID 9843945. open access
  21. ^ a b "Wolfson College: Emeritus Fellow Dr Cyrus Chothia MA MSc FRS". Archived from the original on 25 February 2012.
  22. ^ "Cyrus Chothia: The protein origins of biological complexity, LMB Emeritus". Archived from the original on 25 February 2012.
  23. ^ "Structural genomics and protein structure". Mrc-lmb.cam.ac.uk. Archived from the original on 14 February 2015. Retrieved 24 June 2014.
  24. ^ DBLP 서지학 서버의 키루스 초티아
  25. ^ "cyrus chothia". Google Scholar. Retrieved 24 June 2014.
  26. ^ Chothia, C.; Lesk, A. M.; Tramontano, A.; Levitt, M.; Smith-Gill, S. J.; Air, G.; Sheriff, S.; Padlan, E. A.; Davies, D.; Tulip, W. R.; Colman, P. M.; Spinelli, S.; Alzari, P. M.; Poljak, R. J. (1989). "Conformations of immunoglobulin hypervariable regions". Nature. 342 (6252): 877–883. Bibcode:1989Natur.342..877C. doi:10.1038/342877a0. PMID 2687698. S2CID 4241051.
  27. ^ Lewis, T. E.; Sillitoe, I; Andreeva, A; Blundell, T. L.; Buchan, D. W.; Chothia, C; Cozzetto, D; Dana, J. M.; Filippis, I; Gough, J; Jones, D. T.; Kelley, L. A.; Kleywegt, G. J.; Minneci, F; Mistry, J; Murzin, A. G.; Ochoa-Montaño, B; Oates, M. E.; Punta, M; Rackham, O. J.; Stahlhacke, J; Sternberg, M. J.; Velankar, S; Orengo, C (2015). "Genome3D: Exploiting structure to help users understand their sequences". Nucleic Acids Research. 43 (Database issue): D382–6. doi:10.1093/nar/gku973. PMC 4384030. PMID 25348407.
  28. ^ Chothia, C; Gough, J; Vogel, C; Teichmann, S. A. (2003). "Evolution of the protein repertoire". Science. 300 (5626): 1701–3. Bibcode:2003Sci...300.1701C. doi:10.1126/science.1085371. PMID 12805536. S2CID 27681885.
  29. ^ 사이러스 초치아의 출판물스코푸스 도서목록 데이터베이스에 의해 색인화되었다. (필요한 경우)
  30. ^ Chothia, Cyrus (1973). The crystal structures of some molecules active at cholinergic nerve receptors. proquest.com (PhD thesis). University College London.
  31. ^ Chothia, C.; Pauling, P. (1969). "On the conformations of hallucinogenic molecules and their correlation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 63 (4): 1063–1070. Bibcode:1969PNAS...63.1063C. doi:10.1073/pnas.63.4.1063. PMC 223427. PMID 4311249.
  32. ^ Chothia, C.; Levitt, M.; Richardson, D. (1977). "Structure of proteins: Packing of alpha-helices and pleated sheets". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 74 (10): 4130–4134. Bibcode:1977PNAS...74.4130C. doi:10.1073/pnas.74.10.4130. PMC 431889. PMID 270659.
  33. ^ Levitt, M.; Chothia, C. (1976). "Structural patterns in globular proteins". Nature. 261 (5561): 552–558. Bibcode:1976Natur.261..552L. doi:10.1038/261552a0. PMID 934293. S2CID 4154884.
  34. ^ Sweet, R.; Wright, H.; Janin, J.; Chothia, C.; Blow, D. (1974). "Crystal structure of the complex of porcine trypsin with soybean trypsin inhibitor (Kunitz) at 2.6-A resolution". Biochemistry. 13 (20): 4212–4228. doi:10.1021/bi00717a024. PMID 4472048.
  35. ^ Lesk, A.; Chothia, C. (1980). "Solvent accessibility, protein surfaces, and protein folding". Biophysical Journal. 32 (1): 35–47. Bibcode:1980BpJ....32...35L. doi:10.1016/S0006-3495(80)84914-9. PMC 1327253. PMID 7248454.
  36. ^ Chothia, Cyrus (1992). "One thousand families for the molecular biologist". Nature. 357 (6379): 543–4. Bibcode:1992Natur.357..543C. doi:10.1038/357543a0. PMID 1608464. S2CID 4355476.
  37. ^ Hubbard, T.; Murzin, A.; Brenner, S.; Chothia, C. (1997). "SCOP: A structural classification of proteins database". Nucleic Acids Research. 25 (1): 236–239. doi:10.1093/nar/25.1.236. PMC 146380. PMID 9016544.
  38. ^ "UK government grants awarded to Cyrus Chothia". Research Councils UK. Archived from the original on 15 October 2014.
  39. ^ Gough, J.; Chothia, C. (2002). "SUPERFAMILY: HMMs representing all proteins of known structure. SCOP sequence searches, alignments and genome assignments". Nucleic Acids Research. 30 (1): 268–272. doi:10.1093/nar/30.1.268. PMC 99153. PMID 11752312.
  40. ^ Alex Bateman (2015). "Cyrus Chothia's academic family tree". twitter. Archived from the original on 15 July 2015.
  41. ^ Al-Lazikani, Bissan (1999). Canonical structures of immunoglobulins and T cell receptors (PhD thesis). University of Cambridge.
  42. ^ "Dr Bissan Al-Lazikani Team leader". The Institute of Cancer Research. Archived from the original on 5 March 2015.
  43. ^ Al-Lazikani, B; Lesk, A. M.; Chothia, C (2000). "Canonical structures for the hypervariable regions of T cell alphabeta receptors". Journal of Molecular Biology. 295 (4): 979–95. doi:10.1006/jmbi.1999.3358. PMID 10656805.
  44. ^ Apic, Gordana (2003). Evolution of multidomain proteins in genomes. lib.cam.ac.uk (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 894594841. EThOS uk.bl.ethos.619919.
  45. ^ Barré, Samantha; Greenberg, Andrew S.; Flajnik, Martin F.; Chothia, Cyrus (1994). "Structural conservation of hypervariable regions in immunoglobulins evolution". Nature Structural Biology. 1 (12): 915–920. doi:10.1038/nsb1294-915. ISSN 1072-8368. PMID 7773781. S2CID 39728494.
  46. ^ Bashton, Matthew (2004). Functional analysis of domain combinations (PhD thesis). University of Cambridge.
  47. ^ "Dr Matthew Bashton: Research Associate: INSTINCT project". Archived from the original on 5 March 2015.
  48. ^ Bashton, M; Chothia, C (2002). "The geometry of domain combination in proteins". Journal of Molecular Biology. 315 (4): 927–39. doi:10.1006/jmbi.2001.5288. PMID 11812158.
  49. ^ Bashton, M; Chothia, C (2007). "The generation of new protein functions by the combination of domains". Structure. 15 (1): 85–99. doi:10.1016/j.str.2006.11.009. PMID 17223535.
  50. ^ Bolser, Daniel Murray (2007). The surfaces involved in the formation of protein complexes (PhD thesis). University of Cambridge.
  51. ^ Bremang, Michael Anthony (2012). The mouse protein repertoire : studies on alternative splicing, function and quality (PhD thesis). University of Cambridge.
  52. ^ de Bono, Bernard (2004). Immunoglobulin superfamily proteins in human and mouse (PhD thesis). University of Cambridge.
  53. ^ de Bono, B. (2003). "Exegesis: a procedure to improve gene predictions and its use to find immunoglobulin superfamily proteins in the human and mouse genomes". Nucleic Acids Research. 31 (21): 6096–6103. doi:10.1093/nar/gkg828. ISSN 1362-4962. PMC 275470. PMID 14576296.
  54. ^ Hill, Emma Elizabeth (2002). Evolution of protein families: genome sequences and three dimensional structures (PhD thesis). University of Cambridge.
  55. ^ "Emma Hill's Homepage". University of California, Berkeley. Archived from the original on 13 July 2006.
  56. ^ "Emma Ganley (née Hill) PLOS staff". PLOS. Archived from the original on 24 April 2015.
  57. ^ Madera, Martin (2005). Hidden Markov models for detection of remote homology (PhD thesis). University of Cambridge.
  58. ^ Madera, M. (2004). "The SUPERFAMILY database in 2004: additions and improvements". Nucleic Acids Research. 32 (90001): 235D–239. doi:10.1093/nar/gkh117. ISSN 1362-4962. PMC 308851. PMID 14681402.
  59. ^ Maslau, Siarhei (2007). Formation of the small molecule metabolism of Escherichia coli (PhD thesis). University of Cambridge.
  60. ^ Miller, G. S. P. (1987). Computer display and manufacture of 3-D models (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 59769936.
  61. ^ Miller, Susan; Janin, Joël; Lesk, Arthur M.; Chothia, Cyrus (1987). "Interior and surface of monomeric proteins". Journal of Molecular Biology. 196 (3): 641–656. doi:10.1016/0022-2836(87)90038-6. ISSN 0022-2836. PMID 3681970.
  62. ^ Miller, Susan; Lesk, Arthur M.; Janin, Joël; Chothia, Cyrus (1987). "The accessible surface area and stability of oligomeric proteins". Nature. 328 (6133): 834–836. Bibcode:1987Natur.328..834M. doi:10.1038/328834a0. ISSN 0028-0836. PMID 3627230. S2CID 4349684.
  63. ^ Park, Jong Hwa (1997). Genome sequence analysis and methods (PhD thesis). University of Cambridge.
  64. ^ 구글 스콜라(Google Scholar)가 지수화한 사이러스 초티아 출판물
  65. ^ "Jong Bhak's home page: An entrepreneur and a scientist". jongbhak.com. Archived from the original on 20 December 2014.
  66. ^ Sasidharan, Rajkumar (2004). Protein evolution : the selection of acceptable mutations (PhD thesis). University of Cambridge.
  67. ^ Sasidharan, R.; Chothia, C. (2007). "The selection of acceptable protein mutations". Proceedings of the National Academy of Sciences. 104 (24): 10080–10085. Bibcode:2007PNAS..10410080S. doi:10.1073/pnas.0703737104. ISSN 0027-8424. PMC 1891269. PMID 17540730.
  68. ^ Vogel, Christine (2004). A domain perspective on the evolution of the protein repertoire (PhD thesis). University of Cambridge.
  69. ^ Vogel, Christine; Chothia, Cyrus (2006). "Protein Family Expansions and Biological Complexity". PLOS Computational Biology. 2 (5): e48. Bibcode:2006PLSCB...2...48V. doi:10.1371/journal.pcbi.0020048. ISSN 1553-734X. PMC 1464810. PMID 16733546. open access
  70. ^ "EC/2000/04: Chothia, Cyrus". London: Royal Society. Archived from the original on 31 August 2015. Retrieved 18 November 2013.
  71. ^ Fogg, C. N.; Kovats, D. E. (2015). "Message from the ISCB: 2015 ISCB Accomplishment by a Senior Scientist Award: Cyrus Chothia". Bioinformatics. 31 (13): 2238–9. doi:10.1093/bioinformatics/btv218. PMID 26002905.
  72. ^ "Meet the ISCB Fellows Class of 2015". Archived from the original on 20 February 2015. Retrieved 15 February 2015.

문서에는 CC BY 4.0 라이센스에 따라 사용할 수 있는 텍스트가 포함되어 있다.