팀 허버드

Tim Hubbard
팀 허버드
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태어난
티머시 존 필립 허바드
모교
로 알려져 있다.
과학 경력
필드
기관
논문새로운 단백질의 설계, 표현 및 특성화 (1988)
박사학위 자문위원톰 블런델
웹사이트

티머시 존 필립 허바드 킹스 칼리지 런던 생물정보학 교수, 게노믹스 잉글랜드 유전체 분석 책임자, 영국 케임브리지 웰컴 트러스트 생거 연구소 명예 교수다.[7][8][9][10][11][12][13]

교육

허바드는 캠브리지 대학에서 교육을 받았고 1985년 자연과학 학사(생물화학)를 받았다.그는 계속해서 런던의 Birkbeck College Crystalography 부서에서 단백질 디자인에 관한 연구를 하였고, 1988년[14] 톰 블런델의 감독으로 박사학위를 받았다.

연구 및 경력

Hubbard의 연구 관심사는 생물정보학, 계산생물학, 게놈정보학이다.[6]WTSI에 재직하는 동안 그는 이러한 연구 분야에서 몇 명의 성공적인 박사과정 학생들을 감독했다.[15][16][17][18][19][20]

일본에서의 EU 과학 연수 프로그램 (1989-90)에 따라 오사카의 단백질 공학 연구소에서 박사 후 펠로우십을 한 후, 그는 캠브리지로 돌아와, 단백질 공학 센터인 의학 연구 위원회 (MRC)의 제네카 펠로우가 되었다.1997년에 그는 인간 게놈 분석 책임자가 되기 위해 웰컴 트러스트 생거 연구소에 들어갔다.팀은 2007년부터 2013년까지 정보학 책임자로 일했으며, 그 때 건강 프로그램을 위한 유전체학 전달에 관여하면서 영국 NHS의 전문 고문으로 보조되었다.[21]

Hubbard는 2013년 10월 King's의 생물정보학 교수로 임명되었다.[22]그의 연구는 Nature,[23][24][25] Journal of Molecular Biology,[1][26] Nucleic Acids Research,[3][4] Genome Biology,[2] Nature Methods,[27] Nature Reviews Cancer[28] and Bioformatics를 포함한 주요 동료 과학 학술지에 게재되었다.[29]그의 연구는 의학연구위원회(MRC)와 생명공학생명과학연구위원회(BBSRC)의 지원을 받았다.[30]

참조

  1. ^ a b Murzin, A. G.; Brenner, S.; Hubbard, T.; Chothia, C. (1995). "SCOP: A structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures" (PDF). Journal of Molecular Biology. 247 (4): 536–540. doi:10.1016/S0022-2836(05)80134-2. PMID 7723011. Archived from the original (PDF) on 2012-04-26.
  2. ^ a b Harrow, J; Denoeud, F; Frankish, A; Reymond, A; Chen, C. K.; Chrast, J; Lagarde, J; Gilbert, J. G.; Storey, R; Swarbreck, D; Rossier, C; Ucla, C; Hubbard, T; Antonarakis, S. E.; Guigo, R (2006). "GENCODE: Producing a reference annotation for ENCODE". Genome Biology. 7 Suppl 1: S4.1–9. doi:10.1186/gb-2006-7-s1-s4. PMC 1810553. PMID 16925838.
  3. ^ a b Hubbard, T.; Barker, D.; Birney, E.; Cameron, G.; Chen, Y.; Clark, L.; Cox, T.; Cuff, J.; Curwen, V.; Down, T.; Durbin, R.; Eyras, E.; Gilbert, J.; Hammond, M.; Huminiecki, L.; Kasprzyk, A.; Lehvaslaiho, H.; Lijnzaad, P.; Melsopp, C.; Mongin, E.; Pettett, R.; Pocock, M.; Potter, S.; Rust, A.; Schmidt, E.; Searle, S.; Slater, G.; Smith, J.; Spooner, W.; Stabenau, A. (2002). "The Ensembl genome database project". Nucleic Acids Research. 30 (1): 38–41. doi:10.1093/nar/30.1.38. PMC 99161. PMID 11752248.
  4. ^ a b Farrell, C. M.; O'Leary, N. A.; Harte, R. A.; Loveland, J. E.; Wilming, L. G.; Wallin, C.; Diekhans, M.; Barrell, D.; Searle, S. M. J.; Aken, B.; Hiatt, S. M.; Frankish, A.; Suner, M. -M.; Rajput, B.; Steward, C. A.; Brown, G. R.; Bennett, R.; Murphy, M.; Wu, W.; Kay, M. P.; Hart, J.; Rajan, J.; Weber, J.; Snow, C.; Riddick, L. D.; Hunt, T.; Webb, D.; Thomas, M.; Tamez, P.; Rangwala, S. H. (2013). "Current status and new features of the Consensus Coding Sequence database". Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D865–D872. doi:10.1093/nar/gkt1059. PMC 3965069. PMID 24217909.
  5. ^ Moult, J; Hubbard, T; Fidelis, K; Pedersen, J. T. (1999). "Critical assessment of methods of protein structure prediction (CASP): Round III". Proteins. Suppl 3: 2–6. doi:10.1002/(sici)1097-0134(1999)37:3+<2::aid-prot2>3.3.co;2-u. PMID 10526346.
  6. ^ a b Google Scholar에 의해 색인화된 Tim Hubbard 출판물
  7. ^ a b "Genomics England publishes results of its annotation assessment". Genomics England. 2014. Archived from the original on 2015-01-12.
  8. ^ 트위터의 팀 허버드
  9. ^ Hubbard, Scopus 서지컬 데이터베이스에 의해 색인화된 Tim J P의 출판물.(필요한 경우)
  10. ^ ACM 디지털 라이브러리의 Tim J P Hubbard 저자 프로필 페이지
  11. ^ DBLP 서지학 서버의 Tim J. P. Hubbard
  12. ^ Hopkin, Karen (2009-10-01). "Tim Hubbard: Genome Guru". The Scientist. Archived from the original on 2014-03-04.
  13. ^ 유럽 퍼브메드 센트럴의 팀 허버드 출판물
  14. ^ Hubbard, Tim (1988). The design, expression and characterisation of a novel protein (PhD thesis). University of London. Archived from the original on 2015-05-19.
  15. ^ Brosch, Markus (2010). Development of computational methods for analysing proteomic data for genome annotation (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 890149364.
  16. ^ Down, Thomas Alexander (2004). Computational localization of promoters and transcription start sites in mammalian genomes (PhD thesis). University of Cambridge.
  17. ^ Doğruel, Mutlu (2008). Motif based computational identification of protein subcellular localisation (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 890154619.
  18. ^ Mattison, Jenny (2009). Analysis of genome-wide, cancer-associated mutation datasets in mouse and human (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 890152898.
  19. ^ Piipari, Matias (2011). Inference and classification of eukaryotic cis-regulatory motifs (PhD thesis). University of Cambridge.
  20. ^ Pocock, Matthew Richard (2004). Computational analysis of genomes (PhD thesis). University of Cambridge. OCLC 890159072.
  21. ^ "Wellcome Trust Sanger Institute Honorary Faculty - Dr Tim Hubbard". Archived from the original on 2015-03-23.
  22. ^ "Professor Tim Hubbard, King's College London". Archived from the original on 2014-02-23.
  23. ^ ENCODE Project Consortium, Birney E, Stamatoyannopoulos JA, Dutta A, Guigó R, Gingeras TR, Margulies EH, Weng Z, Snyder M, Dermitzakis ET; et al. (2007). "Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project". Nature. 447 (7146): 799–816. Bibcode:2007Natur.447..799B. doi:10.1038/nature05874. PMC 2212820. PMID 17571346.{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크)
  24. ^ Lander, E. S.; Linton, M.; Birren, B.; Nusbaum, C.; Zody, C.; Baldwin, J.; Devon, K.; Dewar, K.; Doyle, M.; Fitzhugh, W.; Funke, R.; Gage, D.; Harris, K.; Heaford, A.; Howland, J.; Kann, L.; Lehoczky, J.; Levine, R.; McEwan, P.; McKernan, K.; Meldrim, J.; Mesirov, J. P.; Miranda, C.; Morris, W.; Naylor, J.; Raymond, C.; Rosetti, M.; Santos, R.; Sheridan, A.; et al. (Feb 2001). "Initial sequencing and analysis of the human genome" (PDF). Nature. 409 (6822): 860–921. Bibcode:2001Natur.409..860L. doi:10.1038/35057062. ISSN 0028-0836. PMID 11237011.
  25. ^ Birney, E; Bateman, A; Clamp, M. E.; Hubbard, T. J. (2001). "Mining the draft human genome". Nature. 409 (6822): 827–8. Bibcode:2001Natur.409..827B. doi:10.1038/35057004. PMC 2658632. PMID 11236999.
  26. ^ Park, J; Teichmann, S. A.; Hubbard, T; Chothia, C (1997). "Intermediate sequences increase the detection of homology between sequences". Journal of Molecular Biology. 273 (1): 349–54. doi:10.1006/jmbi.1997.1288. PMID 9367767.
  27. ^ Engström, P. R. G.; Steijger, T.; Sipos, B.; Grant, G. R.; Kahles, A.; Alioto, T.; Behr, J.; Bertone, P.; Bohnert, R.; Campagna, D.; Davis, C. A.; Dobin, A.; Engström, P. R. G.; Gingeras, T. R.; Goldman, N.; Grant, G. R.; Guigó, R.; Harrow, J.; Hubbard, T. J.; Jean, G. R.; Kahles, A.; Kosarev, P.; Li, S.; Liu, J.; Mason, C. E.; Molodtsov, V.; Ning, Z.; Ponstingl, H.; Prins, J. F.; Rätsch, G. (2013). "Systematic evaluation of spliced alignment programs for RNA-seq data". Nature Methods. 10 (12): 1185–91. doi:10.1038/nmeth.2722. PMC 4018468. PMID 24185836.
  28. ^ Futreal, P. A.; Coin, L; Marshall, M; Down, T; Hubbard, T; Wooster, R; Rahman, N; Stratton, M. R. (2004). "A census of human cancer genes". Nature Reviews Cancer. 4 (3): 177–83. doi:10.1038/nrc1299. PMC 2665285. PMID 14993899.
  29. ^ Reeves, G. A.; Eilbeck, K.; Magrane, M.; O'Donovan, C.; Montecchi-Palazzi, L.; Harris, M. A.; Orchard, S.; Jimenez, R. C.; Prlic, A.; Hubbard, T. J. P.; Hermjakob, H.; Thornton, J. M. (2008). "The Protein Feature Ontology: A tool for the unification of protein feature annotations". Bioinformatics. 24 (23): 2767–2772. doi:10.1093/bioinformatics/btn528. PMC 2912506. PMID 18936051.
  30. ^ "UK Government Grants awarded to Tim Hubbard". Research Councils UK. Archived from the original on 2015-04-09.