DAP3
DAP3| DAP3 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| Aliases | DAP3, DAP-3, MRP-S29, MRPS29, bMRP-10, 죽음 연관 단백질 3, S29mt. | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM:602074 군사 지리 정보:1929538 HomoloGene:3404 GeneCards:DAP3. | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| 맞춤법 | |||||||||||||||||||||||||
| 종. | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레즈 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 장소(UCSC) | Chr 1: 155.69 ~155.74 Mb | Chr 3: 88.83 ~88.86 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키데이터 | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
28S 리보솜 단백질 S29, 미토콘드리아는 사망 관련 단백질 3(DAP3)로도 알려져 있으며,[5][6][7][8] 사람에게서 1번 염색체의 DAP3 유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.이 유전자는 미토콘드리아 리보솜(미토콘드리아 리보솜)의 28S 서브유닛 단백질을 암호화하고 번역, 세포호흡, 아포토시스 [7][8][9][10]등에 핵심적인 역할을 한다.또한 DAP3는 암 발병과 관련이 있지만 [10][11][12]일부 암을 억제하는 동시에 일부 암을 돕는 것으로 관찰되었다.
구조.
DAP3 유전자는 작은 미토리보솜 서브유닛의 [9][12][13][14]하부 영역에 위치한 46 kDa 단백질을 암호화한다.이 단백질은 GTP와 결합하는 P-루프 모티브와 미토콘드리아에 [9][11][12][13]대한 현지화를 담당하는 고도로 보존된 17-잔류 표적 배열을 포함한다.이 단백질의 많은 인산화 부위는 GTP 결합 [9]모티브 주위에 고도로 보존되고 군집화된다.
인간 EST에서 5' UTR [7][14]영역에서 크게 다른 여러 스플라이스 변형이 관찰되었다.이 유전자의 유사유전자는 1번과 [7]2번 염색체에서도 발견된다.
기능.
DAP3는 미토콘드리아 [7][8][9]기질에 위치하는 28S 서브유닛 단백질이다.미토리보솜의 일부로서 DAP3는 미토콘드리아 게놈에 코드된 13개의 ETC 복합단백질 번역에 관여하고, 결과적으로 세포호흡 [7][8][9][10]조절에 관여한다.사망관련단백질(DAP) 패밀리의 멤버로서 DAP3는 종양괴사인자 알파, Fas배위자 및 감마인터페론과 [7][8][11][12][13]같은 아포토시스 인자와의 상호작용을 통해 외인성 아포토시스 경로를 개시하기 위해 미토콘드리아 밖에서 발견될 수도 있다.또한 DAP3는 IPS-1 인자와 상호작용하여 카스파아제 3, 8, 9를 활성화하여 세포외 아포토시스의 [12][13]일종인 아노이키스를 일으킨다.또한 DAP3는 산화적 스트레스 반응, 활성산소종(ROS) 생산, 궁극적으로는 미토콘드리아 항상성의 [10][11][13]매개로 확장되기 때문에 미토콘드리아 단편화의 매개에 의해 아포토시스에 기여할 수 있다.DAP3는 생명에 필수적이며, 배아에서 DAP3의 결실은 [14]치명적이다.단, DAP3 및 그 아포토시스 활성은 AKT 인산화로 [12][13]억제할 수 있다.
임상적 의의
전술한 바와 같이 사망관련단백질3(DAP3)은 세포호흡 및 아포토시스 조절역할을 한다.반대편과 세포호흡은 세포사 경로의 중요한 요소이며 허혈-재액류 [15][16][17]손상에서 근본적인 기계적 역할을 한다.
정상적인 태아학적 과정, 세포 손상(심장발작과 뇌졸중 중 허혈 재유입 손상 등) 중 또는 암 발병과 과정 중에 세포 수축, 혈장막 블리징, 핵 응축 및 DNA와 핵의 단편화를 포함한 구조적 변화를 겪는다.그 후 식세포에 의해 빠르게 제거되는 아포토시스 체내로의 단편화가 일어나 염증 [18]반응을 방지한다.그것은 특징적인 형태학적, 생화학적, 분자적 변화에 의해 정의된 세포 사멸의 한 형태이다.이것은 처음에 "수축 괴사"로 묘사되었고, 이 용어는 조직 동역학에서 유사분열과 반대되는 역할을 강조하기 위해 아포토시스로 대체되었다.아포토시스 후기에 세포 전체가 파편화되어 핵 및 또는 세포질 요소를 포함하는 다수의 혈장막 결합 아포토시스체를 형성한다.괴사의 초미세 구조적인 모습은 매우 다르며, 주요 특징은 미토콘드리아 팽창, 혈장막 파괴, 세포 붕괴이다.아포토시스는 많은 생리학적, 병리학적 과정에서 발생한다.그것은 프로그램된 세포사로서 배아 발달 중에 중요한 역할을 하며, "원하지 않는" 세포를 제거하기 위한 메커니즘으로 작용하는 다양한 정상적인 인볼루션 과정을 수반한다.
DAP3는 수많은 암에 관련되어 있다.연구에 따르면 DAP3 발현이 B세포 림프종, 비소세포 폐암, 두경부암, 유방암, 위암, 대장암의 종양세포에서 낮은 편에서 존재하지 않는 경향이 있으며, 이는 유전자 프로모터의 [11][12]과메틸화에 의한 것일 수 있다.또한 DAP3 발현은 암 예후 개선과 양의 상관관계가 있어 단백질은 전사망 기능을 [11][12]통해 암 진행을 억제하는 것으로 나타났다.그 결과,[11] DAP3는 화학요법과 같은 치료 치료의 효과를 감시하는 잠재적 바이오마커 역할을 할 수 있다.그러나 교아세포종 멀티폼(GBM)과 흉선종과 같은 다른 암에서는 DAP3 발현이 상향 [10][14]조절된 것으로 확인되었다.따라서 다양한 암에서 DAP3의 특정 역할은 추가 [17]연구가 필요하다.
상호 작용
DAP3는 다음 제품과 상호 작용하는 것으로 나타났습니다.
- 델레[12]
- IPS-1,[12]
- AKT,[12]
- PKA,[14]
- PKC,[14]
- NOA1,[8][14]
- FADD,[19]
- 글루코콜티코이드 [20]수용체
- 열충격단백질 90kDa 알파(세포산), 부재 A1 [20]및
- TNFRSF10A[19]
레퍼런스
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000132676 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000068921 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Kissil JL, Deiss LP, Bayewitch M, Raveh T, Khaspekov G, Kimchi A (Nov 1995). "Isolation of DAP3, a novel mediator of interferon-gamma-induced cell death". The Journal of Biological Chemistry. 270 (46): 27932–6. doi:10.1074/jbc.270.46.27932. PMID 7499268.
- ^ Kissil JL, Kimchi A (September 1997). "Assignment of death associated protein 3 (DAP3) to human chromosome 1q21 by in situ hybridization". Cytogenetics and Cell Genetics. 77 (3–4): 252. doi:10.1159/000134587. PMID 9284927.
- ^ a b c d e f g "Entrez Gene: DAP3 death associated protein 3".
- ^ a b c d e f Tang T, Zheng B, Chen SH, Murphy AN, Kudlicka K, Zhou H, Farquhar MG (Feb 2009). "hNOA1 interacts with complex I and DAP3 and regulates mitochondrial respiration and apoptosis". The Journal of Biological Chemistry. 284 (8): 5414–24. doi:10.1074/jbc.M807797200. PMC 2643507. PMID 19103604.
- ^ a b c d e f Miller JL, Koc H, Koc EC (Feb 2008). "Identification of phosphorylation sites in mammalian mitochondrial ribosomal protein DAP3". Protein Science. 17 (2): 251–60. doi:10.1110/ps.073185608. PMC 2222727. PMID 18227431.
- ^ a b c d e Jacques C, Fontaine JF, Franc B, Mirebeau-Prunier D, Triau S, Savagner F, Malthiery Y (Jul 2009). "Death-associated protein 3 is overexpressed in human thyroid oncocytic tumours". British Journal of Cancer. 101 (1): 132–8. doi:10.1038/sj.bjc.6605111. PMC 2713694. PMID 19536094.
- ^ a b c d e f g Jia Y, Ye L, Ji K, Zhang L, Hargest R, Ji J, Jiang WG (Jan 2014). "Death-associated protein-3, DAP-3, correlates with preoperative chemotherapy effectiveness and prognosis of gastric cancer patients following perioperative chemotherapy and radical gastrectomy". British Journal of Cancer. 110 (2): 421–9. doi:10.1038/bjc.2013.712. PMC 3899757. PMID 24300973.
- ^ a b c d e f g h i j k Wazir U, Jiang WG, Sharma AK, Mokbel K (Feb 2012). "The mRNA expression of DAP3 in human breast cancer: correlation with clinicopathological parameters". Anticancer Research. 32 (2): 671–4. PMID 22287761.
- ^ a b c d e f Miyazaki T, Shen M, Fujikura D, Tosa N, Kim HR, Kon S, Uede T, Reed JC (Oct 2004). "Functional role of death-associated protein 3 (DAP3) in anoikis". The Journal of Biological Chemistry. 279 (43): 44667–72. doi:10.1074/jbc.M408101200. PMID 15302871.
- ^ a b c d e f g Han MJ, Chiu DT, Koc EC (Apr 2010). "Regulation of mitochondrial ribosomal protein S29 (MRPS29) expression by a 5'-upstream open reading frame". Mitochondrion. 10 (3): 274–83. doi:10.1016/j.mito.2009.12.150. PMC 2844934. PMID 20079882.
- ^ Gracia-Sancho J, Casillas-Ramírez A, Peralta C (Aug 2015). "Molecular pathways in protecting the liver from ischaemia/reperfusion injury: a 2015 update". Clinical Science. 129 (4): 345–62. doi:10.1042/CS20150223. PMID 26014222.
- ^ Ekert PG, Vaux DL (Dec 2005). "The mitochondrial death squad: hardened killers or innocent bystanders?". Current Opinion in Cell Biology. 17 (6): 626–30. doi:10.1016/j.ceb.2005.09.001. PMID 16219456.
- ^ a b Kissil JL, Kimchi A (Jun 1998). "Death-associated proteins: from gene identification to the analysis of their apoptotic and tumour suppressive functions". Molecular Medicine Today. 4 (6): 268–74. doi:10.1016/s1357-4310(98)01263-5. PMID 9679246.
- ^ Kerr JF, Wyllie AH, Currie AR (Aug 1972). "Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics". British Journal of Cancer. 26 (4): 239–57. doi:10.1038/bjc.1972.33. PMC 2008650. PMID 4561027.
- ^ a b Miyazaki T, Reed JC (Jun 2001). "A GTP-binding adapter protein couples TRAIL receptors to apoptosis-inducing proteins". Nature Immunology. 2 (6): 493–500. doi:10.1038/88684. PMID 11376335. S2CID 6923467.
- ^ a b Hulkko SM, Wakui H, Zilliacus J (Aug 2000). "The pro-apoptotic protein death-associated protein 3 (DAP3) interacts with the glucocorticoid receptor and affects the receptor function". The Biochemical Journal. 349 (3): 885–93. doi:10.1042/bj3490885. PMC 1221218. PMID 10903152.
추가 정보
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Hulkko SM, Wakui H, Zilliacus J (2000). "The pro-apoptotic protein death-associated protein 3 (DAP3) interacts with the glucocorticoid receptor and affects the receptor function". Biochem. J. 349 (Pt 3): 885–93. doi:10.1042/bj3490885. PMC 1221218. PMID 10903152.
- Morgan CJ, Jacques C, Savagner F, Tourmen Y, Mirebeau DP, Malthièry Y, Reynier P (2001). "A conserved N-terminal sequence targets human DAP3 to mitochondria". Biochem. Biophys. Res. Commun. 280 (1): 177–81. doi:10.1006/bbrc.2000.4119. PMID 11162496.
- Cavdar Koc E, Ranasinghe A, Burkhart W, Blackburn K, Koc H, Moseley A, Spremulli LL (2001). "A new face on apoptosis: death-associated protein 3 and PDCD9 are mitochondrial ribosomal proteins". FEBS Lett. 492 (1–2): 166–70. doi:10.1016/S0014-5793(01)02250-5. PMID 11248257.
- Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (2001). "The small subunit of the mammalian mitochondrial ribosome. Identification of the full complement of ribosomal proteins present". J. Biol. Chem. 276 (22): 19363–74. doi:10.1074/jbc.M100727200. PMID 11279123.
- Miyazaki T, Reed JC (2001). "A GTP-binding adapter protein couples TRAIL receptors to apoptosis-inducing proteins". Nat. Immunol. 2 (6): 493–500. doi:10.1038/88684. PMID 11376335. S2CID 6923467.
- Suzuki T, Terasaki M, Takemoto-Hori C, Hanada T, Ueda T, Wada A, Watanabe K (2001). "Proteomic analysis of the mammalian mitochondrial ribosome. Identification of protein components in the 28 S small subunit". J. Biol. Chem. 276 (35): 33181–95. doi:10.1074/jbc.M103236200. PMID 11402041.
- Kenmochi N, Suzuki T, Uechi T, Magoori M, Kuniba M, Higa S, Watanabe K, Tanaka T (2001). "The human mitochondrial ribosomal protein genes: mapping of 54 genes to the chromosomes and implications for human disorders". Genomics. 77 (1–2): 65–70. doi:10.1006/geno.2001.6622. PMID 11543634.
- Berger T, Kretzler M (2002). "Interaction of DAP3 and FADD only after cellular disruption". Nat. Immunol. 3 (1): 3–5. doi:10.1038/ni0102-3b. PMID 11753396. S2CID 35379239.
- Hulkko SM, Zilliacus J (2002). "Functional interaction between the pro-apoptotic DAP3 and the glucocorticoid receptor". Biochem. Biophys. Res. Commun. 295 (3): 749–55. doi:10.1016/S0006-291X(02)00713-1. PMID 12099703.
- Berger T, Kretzler M (2002). "TRAIL-induced apoptosis is independent of the mitochondrial apoptosis mediator DAP3". Biochem. Biophys. Res. Commun. 297 (4): 880–4. doi:10.1016/S0006-291X(02)02310-0. PMID 12359235.
- Zhang Z, Gerstein M (2003). "Identification and characterization of over 100 mitochondrial ribosomal protein pseudogenes in the human genome". Genomics. 81 (5): 468–80. doi:10.1016/S0888-7543(03)00004-1. PMID 12706105.
- Mukamel Z, Kimchi A (2004). "Death-associated protein 3 localizes to the mitochondria and is involved in the process of mitochondrial fragmentation during cell death". J. Biol. Chem. 279 (35): 36732–8. doi:10.1074/jbc.M400041200. PMID 15175341.
- Hirota T, Obara K, Matsuda A, Akahoshi M, Nakashima K, Hasegawa K, Takahashi N, Shimizu M, Sekiguchi H, Kokubo M, Doi S, Fujiwara H, Miyatake A, Fujita K, Enomoto T, Kishi F, Suzuki Y, Saito H, Nakamura Y, Shirakawa T, Tamari M (2004). "Association between genetic variation in the gene for death-associated protein-3 (DAP3) and adult asthma". J. Hum. Genet. 49 (7): 370–5. doi:10.1007/s10038-004-0161-4. PMID 15179560.
- Miyazaki T, Shen M, Fujikura D, Tosa N, Kim HR, Kon S, Uede T, Reed JC (2004). "Functional role of death-associated protein 3 (DAP3) in anoikis". J. Biol. Chem. 279 (43): 44667–72. doi:10.1074/jbc.M408101200. PMID 15302871.
- Sasaki H, Ide N, Yukiue H, Kobayashi Y, Fukai I, Yamakawa Y, Fujii Y (2004). "Arg and DAP3 expression was correlated with human thymoma stage". Clin. Exp. Metastasis. 21 (6): 507–13. doi:10.1007/s10585-004-2153-3. PMID 15679048. S2CID 23560519.
외부 링크
- PDBe-KB는 인간 28S 리보솜 단백질 S29, 미토콘드리아(DAP3)에 대한 PDB에서 사용 가능한 모든 구조 정보의 개요를 제공한다.
