디코드 유전학

deCODE genetics
deCODE 유전학, Inc.
유형사설
산업유전학
설립됨1996
본부레이캬비크, 아이슬란드
주요인
Kari Stefancsson, CEO
수익USD 77M(2015년)
직원수
190
부모암겐(2012 - 현재)
웹사이트www.decode.com

deCODE 유전학(Iicelandic: Islandic: Islensk erfðagreining)은 아이슬란드 레이캬비크에 본사를 둔 바이오의약품 기업이다. 이 회사는 인구유전학 연구를 이용하여 일반적인 질병과 관련된 인간 게놈의 변이를 확인하고, 이러한 발견을 "질병을 식별, 치료, 예방하는 새로운 방법을 개발하기 위한"[2] 목적으로 카리 스테판손에[1] 의해 1996년에 설립되었다.

2019년 현재, 아이슬란드의 성인 인구의 3분의 2이상 회사의 연구 efforts,[3]에 이"인구 접근"대규모 정밀 의약품 및 전 세계 국가 게놈 프로젝트에 대한 롤 모델을 참여하고 있었다.[4]deCODE 아마 인류 유전학의 발견, 주요 과학에 발표된 것으로 알려졌다. 저널과 국제 언론에 널리 보도된. 그러나 그것은 또한 대규모 과학 연구에 대한 공공의 참여, 개인 및 보건 시스템 전반에 걸친 DNA 기반 질병 위험 검사 개발, 기초 과학과 공공에 대한 민간 부문 참여와 파트너십의 새로운 모델을 통해 정밀 의학의 실현에 보다 광범위하게 선구적인 기여를 했다.알쓰[5]

2012년부터 암겐의 독립 자회사로 활동하면서 그 능력과 발견이 참신한 약품의 발견과 개발에 직접 이용되고 있다. 이 사례는 다른 제약 및 생명공학 회사의 유전체학과 정밀치료에 대한 투자를 촉진하는 데 도움이 되었다.[6]

아이슬란드와 인구 접근법

1996년 Stefansson이 하버드 의대에서 종신 재직권을 떠나 아이슬란드로 돌아와 유전체학 기업을 발견했을 때, 그의 사고방식은 거의 모든 것이 입증되지 않았거나 논쟁의 여지가 있었다. 당시, 몇몇 희귀병의 원인들 - 종종 작은 가족을 연구함으로써 발견될 수 있는 단일 유전자의 변형 -이 발견되기 시작하고 있었다.[7] 그러나 심장병이나 제2형 당뇨병과 같이 행동 및 환경적 위험요인이 잘 알려진 공통/복잡한 질병에 중요한 유전적 요소가 있다는 것은 보편적으로 받아들여지지 않았으며, 설사 있다고 해도 DNA를 판독하는 기초적인 기술을 통해 그러한 변형이 발견될 수 있을지는 알 수 없었다.[8]

Stefansson은 이러한 것들이 존재하고 식별될 수 있다고 확신했지만, 오직 산업적인 규모로 일해야만 했다. 이 용어가 일반적으로 사용되기 10년 전, deCODE의 전제는 이것이 빅데이터 문제라는 것이었다: 라이프스타일 및 기타 요소와의 동적 상호작용에서 위험에 영향을 미치는 변형을 찾는 것은 가족 차원의 연구가 아니라 공중 보건의 규모에 대한 연구를 필요로 할 것이다. 미지의 영역에서의 발견 벤처로서, 전략은 가능한 한 많은 데이터를 모으고 질의하는 것이었다. 즉, 수만 명의 사람들이 공헌한 DNA, 넓고 깊은 의료 및 건강 데이터, 그리고 결정적으로 이 모든 참여자들을 연결하는 포괄적인 족보들.[9] 요컨대, 이것은 연구에 참여할 의향이 있는 사람들과, 가장 흔한 질병의 의미 있는 수의 사례와 많은 족보 데이터를 가진 현대적인 건강관리 시스템을 필요로 했다. 당시 27만 명이 거주하던 스테판손의 모국인 아이슬란드는 이 묘사에 누구보다 잘 맞는다.[10]

1996년 미국 벤처 캐피털에 1200만 달러의 자금을 지원받아 deCODE는 실험실을 설립하고 운영을 시작했다.[11] 처음 몇 년 안에 그것은 수만 명의 참가자들을 모집하고 유전자형을 만들었다. 국가 계보 데이터베이스 구축에 빠른 진전을 이루었고, 정부가 감독하는 신원 암호화를 통한 새로운 프라이버시 보호 시스템을 개발했으며, 스위스 제약 회사인 로슈와 획기적인 파트너십을 체결했으며, 소수의 조건에서 퍼팅 질병 유전자를 매핑했다.[12]

과학을 입증하기 시작함과 동시에, 이 회사는 전국 보건 서비스 기관의 의료 기록 사본을 포함하는 연구 데이터베이스인 아이슬란드 보건 부문 데이터베이스(또는 줄여서 IHD)를 만들자는 제안으로 큰 논란을 일으켰다.[13] 1998년 12월, 아이슬란드 의회는 deCODE의 로비를 통해, 이 건강 데이터베이스를 만들고 상업적 연구와 국가 건강 시스템을 지원하기 위해 기업의 권리를 공개 입찰하는 것을 허용한 보건 부문 데이터베이스에 관한 법률을 통과시켰다.[14] 그 직후 의회는 회사가 성공적인 데이터베이스 구축에 성공한 후 decCODE에 대한 권리를 부여했다.[15] IHD의 공공연한 상업적 목표와 개인이 선택하지 않는 한 의료 기록 데이터를 포함시킬 것을 제안하는 대중과 의회의 폭넓은 지지를 받고 있는 IHD는 다수의 외국 생명윤리학자들뿐만 아니라 국내 및 국제 언론에서 행해진 격렬한 반대를 촉발시켰다.[16] 비록 IHD가 만들어지지는 않았지만, 그 토론은 특히 그 발견을 상업화하려는 분명한 목표를 가진 과학 기업에 사회 전체를 참여시키는 것에 관련된 정치적 난제를 강조했다.[17] 그것은 또한 deCODE와 그 접근법이 인간 게놈을 이해하기 위한 세계적인 노력에서 지엽적인 호기심에서 가장 유명한 기업 중 하나로 발전하도록 했다.[18]

게놈 오브 더 네이션

2000년 6월 빌 클린턴과 토니 블레어가 인간 게놈 서열의 첫 번째 초안을 완성했다고 발표했을 때,[19] deCODE는 수십 개의 질병에 대한 유전자 탐색과 첫 발견을 발표하기 위해 분주하게 움직이고 있었다.[20] 이 회사는 당시 가장 확장성이 뛰어난 DNA 판독 기술인 마이크로 위성 유전자형을 사용하여 유전체를 따라 수백 개의 지점에 고도로 가변적이고 따라서 유용한 표지를 배치하고 측정했다. 족보와 함께 분석하여, 이것은 특정 질병을 가진 사람들이 공통의 조상으로부터 물려받은 경향이 있는 특정 염색체의 영역을 본국으로 되돌리는 것을 가능하게 했다.[21] 이 지역들 내에서는 유전자나 질병과 관련된 일련의 변종들이 더 미세한 정의 방법과 도구를 사용하여 나중에 발견될 수 있다는 생각이 들었다.[22]

그러나 이러한 초기 출판물의 주요 의의는 분석과 접근법의 시사적인 힘이었다. 많은 분야와 대중의 관심은 미래 연구를 위한 참고 자료로 사용할 하나의 전체 게놈의 완전한 염기서열을 생성하기 위해 공적 자금 지원을 받는 HGP(Human Genome Project)와 민간 기업 Celera 사이의 경쟁에 집중되었다. 이것은 원시 데이터를 생성하고 조립하기 위한 기술적 난제였다. 이와는 대조적으로 deCODE는 유전자를 통해 수만 개의 게놈의 변이를 분석하는 전략을 발전시켜, 게놈의 특성을 정보를 복제하고 전송하는 수단으로 활용하고 있었다. 2002년 디코드사가 5000개의 미세 위성 표지로 구성된 게놈의 유전자 지도를 발표했을 때 유전학의 위력은 온전한 시야에 들어왔다. 이 유전자는 계보를 통해 모든 염색체에 걸쳐 정확하게 명령을 내릴 수 있게 되었다. 이 지도는 2003년 공개 참조 게놈 서열을 수정하고 완성하는 데 결정적인 역할을 해 HGP 어셈블리의 정확도를 93%에서 99%[23]로 향상시켰다.

이 접근방식의 한 가지 핵심은 대중 참여였다. 초기부터 deCODE의 질병 연구에 참여하도록 요청된 사람들의 90% 이상이 그렇게 하기로 동의했다.[24] 참여는 자발적이지만 사소하지는 않다. 데이터 수집 센터에 가서 혈액을 뽑고, 설문지에 답하고, 특정 질병과 관련된 임상 검사와 검사를 받아야 한다.[25] 2003년까지 10만 명 이상의 사람들이 deCODE의 3개의 일반적인 질병 연구 프로그램에 참여하기 위해 자원했다.[26] 이 숫자는 2007년까지 13만 명으로 증가했고, 2018년에는 16만 명 이상이 되었다.[27] 이는 전체 성인 시민의 3분의 2에 해당한다. 이들 참가자 중 약 6만 명의 게놈은 2019년까지 직접 염기서열 분석됐으며 매달 수천 명이 더 염기서열 분석 중이다.[28]

deCODE의 작업의 두 번째이자 독특한 기둥은 족보들이다. 1990년대 초 가족에 기반한 연구를 통해 BRCA1과 BRCA2 유방암 유전자를 발견하게 된 유전학자 메리 클레어 킹은 deCODE가 설립된 지 얼마 되지 않아 "전 국민의 계보를 추적하는 능력이 현대 의학의 보물 중 하나가 될 수 있을 것"[29]이라고 예측했다. 1997년에 deCODE는 지역 소프트웨어 회사인 Fridrik Skulason enf와 제휴를 맺어 포괄적이고 전산화된 국가 계보 데이터베이스 구축에 박차를 가했다. 그것은 1703년 인구 조사와 교구 기록을 통해 최초의 송아지 가죽 기록과 사가스에서부터 현대 국가 등록부에 이르기까지 가능한 모든 자료를 끌어냈다.[30]

2000년대 초까지 그들은 오늘날 여전히 한 나라의 가장 포괄적인 계보를 만들었다. 1703년(유네스코가 세계 최초로 명목 국민총조사로 인정한 것)까지 사실상 완전한 기록을 통해 모든 살아있는 시민을 하나로 연결하며, 9세기 국가 정착 이전까지 이어진다. 데이터베이스 연구 버전에서는 개인의 신원이 DNA와 의료 데이터에 사용되는 것과 동일한 익명화 시스템을 통해 암호화되므로 데이터가 상호 연관될 수 있다.[31] 그리고 2003년에 deCODE는 아이슬란드인의 책(Book of Islanders)이라고 불리는 공개 데이터베이스 온라인 버전을 시작했다. 아이슬란드 사회보장번호를 가진 사람이라면 누구나 암호를 요청하고 가계도를 조사하여 그 나라 누구와도 가장 가까운 가족관계를 볼 수 있다. 첫 달 동안, 인구의 3분의 1 이상이 비밀번호를 요청했었다.[32] 2020년까지 20만 명 이상의 등록 사용자와 90만 명 이상의 링크드 가입자를 보유했는데, 이는 지금까지 살아온 아이슬란드 사람들의 대다수를 구성한다. 하루 평균 전체 시민의 2%에 가까운 6000명 가까운 사람들이 데이터베이스와 상담한다.[33]

본질적으로 거대한 대가족인 나라에서 구성원들이 어떻게 연관되어 있는지에 대해 그에 상응하는 관심이 높은 이슬렌다복은 국민생활의 상수가 되었고 deCODE의 작업으로 일상적이고 직접적인 사회참여 수단이 되었다. 그러나 과학적인 관점에서, 그것의 연구 프로젝트에서 모든 참여자들의 정확한 계보 관계를 이해하는 능력은 deCODE의 게놈과 의료 데이터 세트가 그 어느 곳에서도 가장 크고 가장 강력한 컬렉션에 속하도록 보장하면서 발견 기업으로서 확실한 이점을 주었다.[34]

DNA를 판독하는 기술의 연속적인 발전으로 족보들은 그들로부터 생성될 수 있는 데이터의 양뿐만 아니라 데이터로부터 정보를 추출할 수 있는 힘을 증폭시켰다.[35] 마이크로 위성 시대에는 참가자들이 우연히가 아니라 하강으로 게놈의 특정 마커와 세그먼트를 공유한다는 것을 확인할 수 있었다. 게놈 전체에서 수십만 개의 단문자 변형(SNP)을 측정할 수 있는 유전자형 칩의 2000년대 중반에 등장하면서, deCODE 통계학자들은 게놈의 정확한 위상 세그먼트 - 세그먼트의 부모적 원천을 이해하기 위해 - 그리고 나서 전체 포퓰라 전체에서 일부 사람들에게 측정된 유전자형을 귀속시킬 수 있었다.티온[36]

이것은 어떤 연구의 규모와 힘을 효과적으로 배가시킨다. 일루미나가 전체 게놈을 경제적으로 배열할 수 있는 기계를 판매하기 시작했을 때, deCODE는 수천 명의 아이슬란드인을 직접 배열할 수 있었고, 그 다음 사실상 전체 인구에 대한 전체 게놈 배열(WGS) 데이터를 귀속시킬 수 있었다. 이는 세계 최대 규모의 단일 WGS 데이터 모음 중 하나로, 분석 결과는 2015년 네이처 제네틱스 특별판에 실렸다.[37] 그 이후로 수만 명이 더 많은 사람들을 직접 염기서열화함으로써 전례 없는 규모의 더 희귀한 변종들에 대한 일상적인 검색을 가능하게 했다.[38]

발견과 과학적 공헌

일반적으로 게놈 연구와 발견 조직으로서의 deCODE의 세계적인 명성은 2000년대 중반 SNP 유전자형 칩이 등장하면서 시작되었다.[39] 이러한 도구는 게놈 전반에 걸친 연관성 연구(GWAS)에 세계적인 붐을 일으켰다. GWAS는 게놈 전체를 스캔하여 특정 질병에 걸린 사람들이 한 가지 버전의 SNP를 가지는 경향이 있는 반면, 영향을 받지 않은 사람들은 다른 버전을 갖는 경향이 있는 경향이 있는 것을 확인했다. 일반적인 질병에서 약물 반응과 같은 많은 특성이나 표현형식과 마찬가지로, 그 차이는 인과적 확실성 중 하나가 아니라 인구 평균 대비 위험 증가 또는 감소된 위험을 나타내는 통계적 확률을 나타낸다. 그러므로 수천 명의 질병 환자들과 이상적으로 영향을 받지 않는 친척들, 그리고 수배 더 많은 통제 대상자들로부터 대규모 연구를 수행하고 그 결과의 데이터를 분석하는 능력은 프리미엄이다.[40]

decode의 방대한 DNA, 의료 및 계보 데이터를 수집하여 함께 채굴하고 반복적인 질의와 귀책 작업을 통해 더욱 풍부하게 할 수 있었다. 2003년 이후, 회사는 알츠하이머병, 정신분열증 및 기타 정신질환의 유전적 위험을 이해하는 데 지속적으로 기여하는 주요 기여를 포함하여, 수많은 질병과 질환에 대한 민감성과 관련된 수백 가지의 변종들을 발견하여 발표했다. 섬유화와 다른 가장 흔한 심혈관 질환들, 그리고 약물 반응에서부터 인지, 머리카락과 눈 색깔에 이르는 특징과 표현형들.[41] 동사는 동료 검토 저널에 그 발견을 게재하고 있으며, 제2형 당뇨병의 TCF7L2 변종과 같은 많은 것들이 다세대 위험 모델링과 연구에 표준 위험 표시자로 사용된다.[42]

2019년 네이처 커뮤니케이션즈에 게재된 GWAS 시대의 리뷰는 decCODE의 현장 기여도를 정량화했다. 아이슬란드인들은 2007년에서 2017년 사이에 전세계적으로 발표된 GWAS 연구에 전체 참여자의 12%를 차지했으며, 각 시민은 그 기간 동안만 평균 19개까지 연구 결과를 발표했다.[43] Stefansson, deCODE의 연구 책임자인 Unnur Thorsteinsdottir, 통계학자 Gudmar Thorleifsson은 각각 세계 GWAS 작가 1위, 2위, 6위에 올랐다.[44]

유전자형 데이터 위에 전유전자 염기서열 분석(WGS)을 추가함으로써 deCODE의 발견 능력에 새로운 차원과 힘을 부여했다. 정의에 따르면 표준 유전자형 칩의 일반적인 SNP는 신뢰할 수 있는 위험 표지를 제공했지만 복잡한 질병의 생물학에서 결정적인 발판을 마련하지는 못했다. 그러나 유전자형 데이터와 족보를 통해 직접 염기서열화된 전체 게놈의 수가 증가함에 따라, 이 회사의 통계학자들은 전체 인구에 매우 고화질 WGS를 귀속시킬 수 있었다. 그 결과 2000만개에서 5000만개까지의 변종을 이용하여 GWAS 연구를 수행하고, 일반 표현형식의 극단적 버전을 발생시키거나 매우 높은 위험을 주는 희귀 변형을 체계적으로 검색하여 투여 약물 표적을 직접 가리킬 수 있게 되었다.[45]

이 접근방법의 가치는 PCSK9 모델에서 가장 잘 알려져 있는데, PCSK9은 콜레스테롤 수치가 매우 높고 심장질환이 초기 단계에 있는 가족에 대한 연구가 이 유전자의 주요 역할과 새로운 종류의 콜레스테롤 퇴치 약물의 개발에 대한 이해를 이끌었다. deCODE는 이제 많은 사람들에게서 그러한 희귀한 변형을 일상적으로 찾아낸다. 표현형과 그 결과는 약물 발견과 개발 프로그램의 기초를 제공했다.[46] 예를 들어, 이후 심혈관 질환에 2016년의 중요성과 기고 그것은non-HDL 콜레스테롤보다는 가장 정확하게 심장 질환의 위험을 반영할 뿐 LDL수준,[47]은 ASGR1 유전자에 관상 동맥 질환을 막아 주지 변이를 찾는 것;[48]과 지질(를)의 엄마로 역할 정의를 포함한다.jor risk 심장마비의 [49]요인

모든 deCODE의 데이터가 서버에 위치하여 동시에 쿼리할 수 있기 때문에, 또한 놀라운 속도로 쿼리할 수 있다. 2014년, 브로드 연구소의 한 단체가 핀란드에서 돌아오는 길에 deCODE에 들렀다. 그곳에서 그들은 주요 연구 노력을 통해 제2형 당뇨병에 대한 매개체를 보호하는 변종을 발견했다. 커피를 마시며 deCODE 팀은 핀란드 변종이 아이슬란드에는 존재하지 않는다고 확인했지만, 또 다른 변종이 존재했다는 것을 확인했다.[50] 브로드 그룹은 그것을 발견을 발표하는 신문에 추가했다.[51]

그것의 유일한 인구 자원들과 그것의 과학자들이 묻고 대답할 수 있는 질문들 때문에, deCODE의 가장 주목할 만한 발견들 중 많은 것들이 기초 과학에 있었다. 한 주목할 만한 초점은 게놈의 염기서열의 변화가 어떻게 발생하는지 해명하는 데 있었다. 2002년 마이크로위성 기반의 게놈 유전지도를 만든 데 이어 2010년 30만 SNP에 구축한 [52]것과 2019년 WGS 데이터를 기반으로 구축한 것 등 두 가지를 더 만들어 과학계에 공개했다.[53] 난자와 정자를 만드는 과정에서 일어나는 염색체의 재조합은 다양성을 창출하고 이러한 지도를 만드는 주요한 메커니즘이다. 15년 이상 deCODE는 실제 인구에서 성별, 나이 및 기타 특성에 따라 재조합 비율이 어떻게 달라지는지, 그리고 이러한 차이가 유전적 다양성의 생성과 많은 종류의 변동에 어떻게 영향을 미치는지를 상세히 기술하는 일련의 획기적인 논문을 발표했다. 일반적으로 나타난 그림은 게놈은 다양성을 생성하지만 일정한 범위 내에서 자연선택과 진화를 위한 역동적이지만 일반적으로 안정된 기질을 제공한다는 것이다.[54]

decode는 또한 초기부터 유전인류학 그룹을 가지고 있었다. 그것은 초기 인구의 노르웨이와 켈트족의 혼합물을 추적하기 위한 미토콘드리아와 Y-크롬 돌연변이에 대한 선구적인 연구 결과를 발표했고, 정착기부터 고대 DNA와 현대의 아이슬란드 게놈을 비교하여 유전적 표류, 전염병, 자연재해가 어떻게 현대 인구를 유전적으로 구별시켰는지 알아냈다.t 금기와 원천 인구로부터.[55] 그리고 현대 사회에서 긍정적인 자연 선택 하에 변형을 관찰했다.[56] 이 회사는 또한 특정 유전자를 잃어버린 사람들인 인간 녹아웃을 분류하고, 그의 살아있는 후손 수백 명의 순서를 분석하여 아이슬란드에서 살았던 아프리카 혈통 최초의 남성의 게놈을 재구성했다.[57] 이러한 연구들은 외국 매체와 아이슬란드 매체들이 열성적으로 따르고 있으며, deCODE가 연구 및 일하는 사회에 제공하는 또 다른 형태의 수익을 구성한다.

제품 혁신

deCODE의 과학적 리더십은 20년 이상에 걸쳐 정밀 의학의 여러 측면에 대한 새로운 형태의 파트너십, 제품 및 응용을 반복적으로 개척할 수 있게 했다. 1998년부터 2004년 사이에 제약회사 로슈, 머크, 바이엘, 와이에스 등과 높은 인지도와 혁신적인 파트너십을 체결했다. 이러한 제휴는 일반적인 질병에서 유전적으로 검증된 신약 목표의 발견, 질병의 위험을 측정하거나 약물 반응을 예측하고 약물의 혜택을 가장 많이 받을 가능성이 있는 환자를 식별할 수 있는 DNA 기반 진단 개발, 그리고 "정보가 풍부한" 임상시험을 설계하기 위한 연구 자금을 제공했다.모자는 실험이 더 작고, 더 유익하고, 더 큰 성공 가능성을 가지고, 특정한 유전적 변형을 가진 참가자들을 등록시킬 것이다.[58]

2002년, deCODE는 시카고에 본사를 둔 의약 화학 회사를 인수하여 유전학적 발견에 근거한 화합물을 발견하여 신약의 파이프라인을 자체 개발하기 시작했다.[59] 그 후 몇 년 동안 회사는 심장마비, 말초동맥질환에 대한 잠재적인 새로운 치료를 위한 몇 가지 초기 임상실험을 시작하고 완료했으며 천식 및 SMA에 대한 파트너들과 함께 연구를 수행했다.[60] 이것들은 오늘날 '정밀의학' 프로그램이라고 불릴 만한 것의 초기 예들이다: 목표 발견을 위해 유전자를 사용하고, 약물이 목표한 동일한 경로를 통해 질병 감수성을 시험함으로써 실험 참가자를 선발하는 것이다.[61]

2000년대 중반, deCODE는 주로 예방과 웰빙에 초점을 맞춘 새로운 종류의 위험 진단을 시작했다. 이러한 DNA 기반 진단 테스트는 deCODE 등에 의해 확인된 유전적 변형을 발견하였으며, 이는 심장마비,[62] 심방세동 및 뇌졸중, 타입 2 당뇨병, 일반(비 BRCA) 유방암, 전립선암, 녹내장 등 일반적인 질병의 개별 위험의 유의미한 증가와 관련이 있다.[63] 예를 들어, 제2형 당뇨병 검사는 약 10%의 사람들이 decCODE의 가장 높은 영향 위험 변종 2부를 휴대하고 있어 비만과 무관하게 당뇨병에 걸릴 확률이 평균 2배에 이른다는 발표된 연구에 근거했다. 이 검사의 의학적 목적은 "전염 당뇨로 발전할 수 있는 평균 위험보다 더 높은 당뇨병을 식별하고, 이러한 동일한 개인이 체중 감소와 특정 약물의 사용을 통해 이러한 추가 위험을 효과적으로 대응할 수 있다"[64]는 것이었다.

이러한 테스트의 또 다른 새로운 특징은 잘 검증된 여러 유전적 위험 요인의 통합이었다. 이러한 서로 다른 위험 요인의 전체적인 영향은 다세대 위험 점수라고 불리는 점수로 결합되고 계산되었으며, 개인은 다른 건강 또는 라이프스타일 위험 요인과 독립적이고 더불어 일반 모집단의 위험 범위에 놓였다.[65] 각각의 새로운 발견으로 deCODE는 시험된 위험 요인을 넓힐 수 있다. 더 높은 위험에 처한 사람들을 위해 선별과 예방 전략과 치료법을 보다 구체적이고 효과적으로 만들고, 체중 감소, 금연 등 잘 이해된 생활습관변경으로 개개인이 끝까지 따라갈 수 있는 새로운 인센티브를 제공하고자 하는 것이었다.[66] 이것이 당시 개인 맞춤 의학이라고 불리던 것의 본질이었지만, 이러한 검사들이 새로운 것이기 때문에, 그들의 의학적 유용성은 아직 증명되지 않았다. 누구나 정의상 공통 질환의 위험에 처해 있고, 의사들도 희귀질환을 지칭하는 것처럼 유전적 위험을 일반적으로 이해했기 때문에, 의료계는 회의적인 태도로 이러한 검사에 접근했다.[67] 2018년, 일반 질병의 위험성이 현저히 증가된 사람들을 식별하기 위한 다세대 위험 점수 사용 옹호 및 초기 deCODE 마커를 기반으로 구축하기 위한 전체 유전자 데이터와 새로운 알고리즘 사용 옹호 활동이 시작되었다.[68]

deCODE의 발견에 대한 언론의 집중적인 취재로 판단하기 위해, 일반 사람들은 이러한 유전적 위험 요소와 그것들이 그들의 건강과 어떻게 관련될 수 있는지에 매우 확실히 관심이 있었다. 2007년 말에는 그 회사가 효과적으로 deCODEme[69]소비자에게 직접 호소하는(DistributedTransactionCoordinator)스캔이 더 나은 사람과 건강을 유지하기 위해 이 정보를 사용하여 흔한 질병의 위험성 이해하기에. deCODEme 지금은 널리 알려진,Google-funded 23andMe.[70]deCODEme의 marke 하루 전 시장에 개인 유전체학 분야를 시작했다.전각ting그 혈통, 심각성, 그리고 과학적 엄격함을 강조하였다: "질병에 대한 유전적 위험요인의 발견에 있어서 세계 지도자에 의한 검증...[고객]이 국제적으로 유명한 연구를 수행하는 과학자의 지식과 경험에서 직접 이익을 얻을 수 있도록] (경쟁업체는 decCODE의 출판된 변형을 많은 결과의 기초로 사용), 검색이 발견된 동일한 실험실에서 처리됨. 2012년까지 deCODEME 전체 스캔은 100만 SNP를 측정하고 산모와 부계 조상에 대한 기본 정보뿐만 아니라 47개의 일반적인 질병과 특징에 대한 위험을 계산하여 그 기간의 대부분의 조계 스캔이 많은 데이터로 되돌아오지 않았음을 지적했다.[71]

deCodeme의 결과가 정보 제공 목적("건강 증진을 위한 로드맵")을 위한 것이라는 강조와 결과에 대해 의문이 있는 사용자를 위한 유전자 상담의 제공에도 불구하고, 미국 규제 당국은 질병 위험 평가가 소비자의 손에 직접 들어가는 것에 대해 재빨리 비판적인 견해를 취했다.[72] 2010년 6월, FDA는 deCODE와[73] 주요 경쟁사들에게 이러한 스캔을 FDA 승인이 필요한 의료기기라고 생각한다고 서신을 보냈다.[74] 규제 역풍과 이후 기업 재편에 직면한 deCODE는 2012년 말 deCODEme 판매를 중단했다.[75] 2017년 FDA는 소비자 테스트에서 질병에 대한 유전적 위험에 대한 특정 평가를 승인하기 시작했다.[76]

2018년, deCODE는 공중 보건에 대한 직접적인 개입과 그 종류의 첫 국가 유전자 검사 프로그램으로 새로운 장을 열었다. 이 회사는 아이슬란드에서 유방암과 전립선암에 걸릴 위험이 높은 BRCA2 유전자에서 SNP의 매개체가 될 가능성이 있는지 여부를 결정하기 위해 아이슬란드에서 누구나 무료로 자신의 게놈 서열 데이터를 검색해 줄 것을 요청할 수 있는 웹사이트를 개설했다. 몇 달 안에 인구의 10%가 BRCA2 지위를 요청했고 국립병원은 사람들이 그들의 예비 결과를 추적하고 그들의 건강을 보호하기 위해 정보를 사용할 수 있도록 돕기 위해 상담과 다른 서비스들을 구축했다.[77]

비즈니스

과학의 발전에도 불구하고, 혹은 종종 그 분야에서 훨씬 앞서 있었기 때문에, deCODE는 독립 사업으로서 변덕스러운 역사를 가지고 있었다. 2000년 7월, 나스닥에서 2억 달러의 IPO를 마쳤는데, 이는 당시로서는 큰 규모였으며, 아이슬란드 기업이 미국 거래소에 처음으로 상장하였다. 그것의 초기 제약 동맹들, 특히 Roche와 함께, 연구 첫 10년 동안 대부분의 성인들의 등록 자금, 그리고 의약품, 진단 및 개인 유전체학 분야에서 그것의 발견 능력과 제품 개발 노력의 급속한 확대에 더 많은 도움을 주었다.[78]

과학적인 관점에서 보면, 브로드 연구소의 데이비드 알츠추이어가 2004년 MIT 테크 리뷰에서 "이것은 중요한 질량이 중요한 사업이며, 그들은 비판적인 질량을 달성했다"[79]고 말한 바 있다. 그러나 그 사업도 돈에 관한 것이었다. 새로운 시장을 개척하는 혁신 기업으로서, 그 회사는 첫 10년 동안 5억 달러 이상을 R&D에 썼고 결코 이익을 얻지 못했다. 2006년경에는 완전히 새로운 전제를 기반으로 한 약물 개발 프로그램에 자금을 더 빌리고, 지지자들조차 "아직 배아"라고 부르는 시장에서 진단 테스트를 추진하고, 23andMe의 매력과 현금이 가려져 있는 개인 유전체학을 시장에 내놓기 위해 더 많은 돈을 빌리고 있었다.[80][81]

2008년 말까지는 스테판슨 자신의 말로 이 회사는 "바위와 힘든 곳 사이"가 되었다.[82] 주가가 폭락해 나스닥에서 상장폐지될 위기에 처하자 글로벌 시장이 위기에 몰리는 것처럼 자본이 더 필요했다.[83] 비록 그것의 과학자들이 놀라운 속도로 돌파구를 계속 발표했지만, 2009년 말, 그 회사의 상장된 미국 지주회사인 deCODE 유전학 회사는 11장의 파산을 선언했다.[84] 아이슬란드 유전학의 핵심인 이 회사의 핵심 자산은 이 회사의 두 주요 벤처 후원자 컨소시엄에 의해 인수되어 계속 운영되고 있다. 아치 벤처와 폴라리스 벤처스, 그리고 유전자형 칩과 염기서열 분석 장비의 지배적인 제조사인 일루미나 주식회사.[85] 그것은 마약 개발 프로그램에 대한 작업을 포기했다.[86]

기업으로서 deCODE는 어떤 의미에서 미래로 되돌아갔는데, 뉴스위크가 "세계에서 가장 성공적인 실패"라고 부른 원래의 VC에 의해 다시 한 번 뒷받침된 13년 된 회사였다.[87] 다음 기간 동안 스테판슨은 공개적으로 deCODE가 [88]6년에서 10년 사이에 설립되었다고 생각했다. 그는 충분한 세부사항으로 DNA를 정확하게 판독하는 기술은 2000년대 중반까지 도달하지 못했으며, decode는 수년간 연구개발을 해왔으나 상업적으로 설득력 있는 진단과 개발 약물을 신속하게 만들 수 있는 질병의 생물학에 대한 상세한 통찰력을 제공하지 못한 연구결과에 기초하고 있다고 설명했다.[89] 그 통찰력을 제공할 수 있는 것은 인구 규모 WGS 데이터였다. 2010년까지 Stefansson은 deCODE가 세계 최초로 이와 같은 것을 가질 수 있도록 하기 위해 수천 명의 개인들의 순서를 정하고 계보에 의해 다시 힘을 얻은 귀속법을 사용하는 방법에 대해 설명하고 있었다.[90]

Illumina를 소유주 중 한 명으로 하여 궁핍한 환경에도 불구하고 회사는 최신 염기서열 분석기와 시약을 공급받을 수 있었다. 2011년, deCODE와 Illumina는 WGS 귀책의 위력에 대한 초기 힌트를 주는 논문에서 협업하여 500개의 시퀀스를 4만 개의 데이터의 전체 게놈으로 만들었다. 이것은 다른 몇몇 집단에서 복제를 통해 검증된 희귀한 변형을 발견하기에 충분했다.[91] 일반적인 변종과는 달리 희귀병을 일으키는 돌연변이는 단백질을 암호화하는 유전자의 영역에 있는 경향이 있어 질병 생물학에 대한 직접적인 창과 약물 표적으로서의 직접적인 효용성을 모두 제공한다. 2012년 12월 미국 제약회사 암젠이 4억1500만달러에 deCODE를 인수했다.

취득의 주요 근거는 WGS 데이터를 사용하여 희귀한 코딩 변형을 발견하고 더 일반적인 질병의 극단적인 버전을 발생시키는 deCODE 고유의 능력이었다. 션 하퍼 당시 암젠의 R&D 책임자는 포브스와의 인터뷰에서 "심장질환을 위한 PCSK9과 같은 목표물에 실제로 작용하고 있었다...디코드가 세계 전문가라는 인간 유전자 분석의 종류에 의해 발견되거나 검증된 표적을 갖는다는 엄청난 가치를 실감하게 했다."[92] 보다 광범위하게, 이러한 기능은 현재 프로그램 평가에도 적용될 수 있으며, 취득한 deCODE가 수개월 이내에 Amgen의 전체 파이프라인을 검토했다. 2018년 하퍼는 "파이프라인의 절반에 대한 강력한 유전적 지원만 있으면 R&D 투자 수익률을 약 50%까지 높일 수 있다"[93]고 추정했다. 암젠은 2020년까지 decCODE 발견에 직접 기초한 심혈관신약 2종을 임상시험에 도입해 선도적인 과학저널에 지속적으로 게재하고 있다.[94]

글로벌 모델로서

2017년 미국 인간유전학회 연례총회에서 스테판슨을 조직에 소개하면서 브로드연구소의 마크 댈리는 "전체 모집단 참여, 역사적 의료등록 자료, 대규모 유전자에 대한 투자로 모집된 바이오뱅크를 포함하는 퍼베이시브 패러다임이 회의와 분야를 지배하고 있다"고 말했다.tic 데이터 수집 및 통계 방법론, 학술 및 산업 경계를 통한 협업 후속 조치...deCODE는 이 검색 엔진에 대한 템플릿을 제공했다."[95]

초기부터 deCODE의 사례는 사르디니아, 퀘벡, 뉴펀들랜드, 스웨덴 북부, 핀란드 등지의 고립된 지역사회와 소규모 개체군에서 질병 유전자를 사냥하는 다른 사람들에게 신선한 자극을 주었다. 그러나 deCODE는 희귀한 신드롬을 일으키는 변종을 찾기 위해 아이슬란드 인구의 "상대적 동질성"을 내세우는 것이 아니라, 설립자 돌연변이의 존재가 일반 질병에 영향을 미치는 변종의 발견에 힘을 실어줄 것이기 때문이다.[96] 세계적인 의료 과제와의 관련성 측면에서 아이슬란드는 희귀한 신드롬의 유행이 높은 인종이 아니라 전체적으로 연구될 수 있는 축소형 유럽 사회였다. 즉 가장 작은 인구만큼 큰 소수인구가 아니었다.

deCODE의 예를 따른 첫 번째 큰 나라는 영국이었다.[97] 세계에서 가장 다양한 인구 중 하나에 NHS의 방대한 범위와 자원을 적용하는 과학적, 의학적 가치의 이면에는 아이슬란드의 경험이 2003년[99] 영국 바이오뱅크, 2013년 게노믹스 잉글랜드의 인가를 알렸다.[98] 초기 대규모 biobank과 유전체학 노력의 주요 보건 시스템에 연결되어 그 만 재향 군인 프로그램 미국에서 2009년;[100]연구 프로그램 Genes, 환경과 보건에 캘리포니아의 카이저 퍼머넌트에서, 2007년 시작했다;그리고 중국 Kadoorie Biobank 중국 본토에서 홍콩과 2000년대 중반에 시작되었다.[101]

2014년 Illumina는 새로 X-Ten 시스템 1000달러씩을, 국가 게놈 프로젝트 미국(모든 우리의 MVP와 함께)과(CKB과 함께)에서 호주, 캐나다, 두바이, 에스토니아(원래 2000년 시작), 프랑스, 홍콩, 일본, 네덜란드, 카타르, 사우디 아라비아, S에 proliferated,[102]규모로 전체 게놈을 서열 분석할 수 있다고 발표한 후ingap광석, 한국, 스웨덴, 터키 그리고 그 밖의 다른 나라들. 비록 다양한 초점과 접근방식이 있지만, 이 모든 프로그램은 최소한 deCODE의 예에 의해 암시적으로 영감을 받았다.[103]

제약회사들이 주도하는 다른 대형 프로젝트들은 deCODE의 모델과 암젠과의 작업을 면밀히 추적해왔다. 여기에는 미국의 게이징거 건강시스템과의 리제너런스,[104] 영국의 웰컴 트러스트와의 하이브리드 공공/민간/학업 파트너십, 캘리포니아의 크레이그 벤터의 인간 장수, 헬싱키의 핀겐 등이 포함된다.[105] 브로드 인스티튜트 지도자들과 핀란드 대학, 보건부, 바이오뱅크가 마약 발견을 추진하기 위해 설립한 후자는 아이슬란드에서 deCODE의 원래 비전에 현저히 근접하지만 학계 및 정부 기관이 사업상 지분 파트너로 참여하고 있다.[106] 이 민관 협력 모델은 20년 동안 아이슬란드에서 많은 논란을 일으켰던 1998년 IHD 법의 야망을 훨씬 뛰어넘는 익명의료 기록, 사회복지 데이터 및 생체 의학 연구에 대한 생물학적 표본의 거의 도매 사용을 허가하는 2019년 핀란드 법률의 통과를 설명할 수 있다.경사의[107]

deCODE의 직접적인 관여와 혈통도 전 분야에 걸쳐 명백하다 deCODE는 모든 스칸디나비아 국가들과 아이슬란드와 에스토니아의 자원을 한데 모아 전 세계에 걸쳐 유전자 발견과 정밀 의학의 응용을 진전시키는 노르딕 인간 유전학 및 정밀 의학 협회의 창립 멤버 겸 리더다 2013년에 deCODE 동문 그룹이 다른 나라의 임상 진단 및 인구 유전체학을 지원하기 위해 아이슬란드에서 원래 개발된 정보학 및 시퀀스 데이터 관리 도구를 허가하고 추가로 개발한 스핀오프인 NextCODE Health(현 Genuity Science)를 만들었다.[108] 그것의 시스템과 도구는 영국,[109] 카타르,[110] 싱가포르의 국가 게놈 프로젝트,[111] 영국, 미국[112], 중국의 소아 희귀병 프로그램,[113] 그리고 자회사인 Genomics Medicine Areland에서 사용되어 왔다. 2019년에는 deCODE와 미국의 지역보건시스템 Intermountain이 제휴하여 50만 명의 WGS 기반 연구와 정밀의학 연구를 실시하였으며,[114] deCODE도 영국 바이오뱅크에서 22만 5천 명의 참가자의 순서 지정을 시작했다.[115]

Covid-19 전염병 대응

2020년 3월, 사스-CoV-2 바이러스가 아이슬란드에서 광범위하게 퍼지기 시작하자 deCODE는 일시적으로 임상 연구, 실험실 직원 및 운영을 전환하여 COVID-19에 대한 대규모 검사를 실시했다. 이러한 노력은 이 회사가 공중 보건에 가장 깊고 직접적인 관여를 한 것으로 기록되었으며 전 세계적인 유행병의 초기 몇 달 동안 어떤 나라든 가장 집중적이고 성공적인 봉쇄 전략의 중요한 구성요소가 되었다.[116]

전염병에 대한 아이슬란드 보건 당국의 반응은 모범 사례인 '검사, 추적, 격리' 역학관리의 초기, 투명하고 효과적인 사례로 두드러졌다. 2020년 1월 말, 국립보건원(National Director of Health of Health)은 아이슬란드에 도착하는 사람들을 고위험지역에서 검사하거나 감염의 징후를 보이기 시작했으며, 시민보호 및 응급관리부와 함께 바이러스 진단을 받은 사람을 격리하고 그들의 모든 연락처를 추적하고 격리하는 시스템을 가동했다.[117] 아이슬란드의 첫 사례는 표적검사가 시작된 지 한 달 만인 2월 28일 진단됐고, 며칠 만에 수십 명이 매일 양성반응을 보였다. 두 달이 조금 지난 후, 아이슬란드는 사실상 활성 감염으로부터 자유로워졌다.[118]

이 응답의 기초와 이를 안내하는 데이터는 테스트였습니다. 그러나 공식적인 테스트 노력은 신속하고 활력이 넘쳤지만, 감염자와 접촉했을 가능성이 높아 증상이 있거나 위험성이 높은 사람들에게 초점을 맞췄다. 3월 초, deCODE의 CEO인 Kari Stefansson은 전체 전염병을 해결하기 위한 중요한 정보인 바이러스의 확산이나 치사율을 이해할 방법이 없다고 우려했다.[119] 이" 합쳐 도와 주"순간과 노하우를, 사람들과 장비가 빠르게 그는 집행 위원회 보건 기구의 후원 하에 일반 대중들을 상영하기 일하기 위해 회사의 기능을 넣겠다고 제안했다 PCR진단 시험 facility,[120]는 회사의 유전학 연구소 옮겨진다.[121]deCODE 직원 신속하게 togethe을.r 검체 수집에서 테스트 실행, 개인 정보 보호 보고에 이르는 모든 작업 흐름과 대규모 테스트를 시작할 준비가 된 스와브 및 시약에 대한 워크플로우. 2020년 3월 12일 목요일, 이 회사는 테스트를 위한 예약을 위해 웹사이트를 열었고 몇 시간 안에 1만 2천 명이 등록했다. 시험은 다음날 아침부터 무료로 시작되었다.[122]

deCODE 노력은 하루 1000개 이상의 샘플 용량으로 빠르게 확장되었다. 인구검진 초기부터 참여자의 1% 미만이 감염되는 것으로 나타나 보건당국의 봉쇄 전략이 효과를 보고 있는 것으로 나타났다.[123][non-primary source needed] 3월 중순부터 2020년 5월말까지 하루 평균 600여건의 검사를 실시해 보건당국이 국립대병원에서 하루 250여건의 검사를 보완했다. deCODE의 선별검사에서 양성반응을 보인 사람들은 유사하게 격리되었고 그들의 연락처가 추적되어 그들 스스로를 격리시키도록 요청되었다. 6월 초까지 아이슬란드에서 총 6만 건 이상의 테스트가 실시되었는데 이는 전체 인구의 18%에 해당한다. 이러한 복합적인 테스트 전략과 추적과 격리 후속 조치에 힘입어 아이슬란드의 감염 건수는 4월 첫째 주에 정점을 찍고 이달 말에 급격히 감소했다. deCODE와 보건 당국은 새로운 발병을 감지하기 위해 매일 200건이나 되는 검사를 계속했지만 5월 중순까지 국내에는 소수의 활성 감염자만이 발생했다.[124]

decCODE는 검사 작업과 병행하여 수백 명의 감염된 개인으로부터 바이러스를 염기서열화하고, 그 나라에서 바이러스의 다른 종족의 일종의 계보를 그리기 위해 유전적 기능을 이용했다. 이것은 전염병의 초기 몇 주 동안 바이러스가 어떻게 다른 나라에서 감염된 사람들과 함께 그 나라에 들어왔는지 그리고 나서 아이슬란드 내에 퍼졌는지 보여주었다.[125][non-primary source needed] 2020년 4월 보건국장과 국립병원 동료들과 함께 이 회사는 뉴잉글랜드 저널 오브 메디슨에 COVID-19의 확산이 인구 전체에서 어떤 모습인지, 그리고 어떻게 강력한 시험, 추적, 격리 정책이 이를 효과적으로 억제할 수 있는지를 상세히 기술한 논문을 발표했다. 지난 5월 인구 내 항체검사 개발 및 실시 작업을 시작했으며, 초기 결과 감염 판정을 받지 않은 일반 인구의 1%가 바이러스용 항체를 갖고 있었다. 이는 한편으로는 바이러스가 신속하고 잘 억제되어 왔으나, 2월 말 이후 공식적으로 진단된 바와 같이 3번 가까이 감염되었고, 또한 인구는 여전히 98% 이상 순진하다는 것을 의미했다.[126] 이는 아이슬란드에 오는 시민들과 다른 사람들이 여행하기 위해 국경을 다시 개방함에 따라 대규모의 실험이 이후의 발생을 계속 감지할 필요가 있음을 시사했다.[127] 이 회사는 6월 브리티시 컬럼비아에 있는 암젠의 부대와 함께 회복된 아이슬란드 코비드 환자의 백혈구를 사용하여 바이러스에 대한 항체 제조에 착수했으며, 이는 예방적 또는 치료적으로 사용될 수 있다고 말했다.[128]

대중문화에서의 출현

deCODE의 작품은 2000년부터 Arnaldur Indriðason의 소설 Jar City에 의해 비판받고 있으며, 이 작품은 2006년 동명의 영화로 각색되었다.[129]

데코드와 카리 스테판손은 다우샨스 오비스시 티미의 바이킹DNA와 라루스 요한손 교수로 풍자된다(레이캬비크: JPV 우트가후, 2004).

deCODE와 특히 Karri Stefancsson은 Ottar M에서 괴물같은 유전적 하이브리드의 창조자로 제시된다. Norðfjörð's satirical 2007 work Jón Ásgeir & afmælisveislan (Reykjavík: Sögur, 2007), and the history of DeCODE appears both directly and in allegorised form (under the fictional name OriGenes) in the same author's novel Lygarinn: Sönn saga (Reykjavík: Sögur, 2011). deCODEX는 Sjon에 의해 CoDex 1962에 있는 CoDex 회사의 모델이다.[130][131]

참조

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추가 읽기

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  • 아이슬란드 인류학자가 수집한 아이슬란드, deCODE 및 유전체학: Palsson, Gisli, Nature, Culture and Society: 삶에 대한 인류학적 관점(캠브리지: 케임브리지 대학 출판부, 2016)
  • 2000년대 초반의 deCODE 및 상업 유전체학에 대한 시기별 비판적 견해: Fortun, Michael, Promise Genomics: 투기의 세계 속의 아이슬란드와 deCODE 유전학. 버클리: 캘리포니아 대학교 출판부, 2008.
  • '제네 광란' 아이슬란드를 뜨겁게 달군 CBS 뉴스, 2002년 광란'

외부 링크

좌표: 64°08′08″N 21°56′45″w / 64.13556°N 21.94583°W / 64.13556; -21.94583