에코사이크
EcoCyc | |
|---|---|
| 내용 | |
| 설명 | 대장균 생물학의 종합적인 데이터베이스 |
| 유기체 | 대장균 |
| 연락처 | |
| 리서치센터 | 스리 인터내셔널 |
| 실험실 | 스리 인터내셔널 |
| 작가들 | 피터 카프 외[1] |
| 1차 인용 | 케셀러 & 앨. (2011년)[1] |
| 접근 | |
| 웹사이트 | ecocyc |
생물정보학에서 EcoCyc는 대장균 K-12 박테리아를 위한 생물학적 데이터베이스다.에코사이크 프로젝트는 대장균 게놈의 문헌 기반 큐레이션과 대장균 전사 조절, 전달체, 대사 경로 등을 수행한다.EcoCyc는 36,000개 이상의 과학 논문에서 증명한 대장균 유전자의 서면 요약을 포함한다.에코사이크는 과학자들이 컴퓨터 분석을 수행할 수 있도록 지원하는 대장균의 게놈과 세포망에 대한 설명이기도 하다.[2]null
EcoCyc 데이터베이스의 데이터 개체는 각각의 대장균 유전자와 유전자 제품을 설명한다.데이터베이스 오브젝트는 또한 대사 경로, 운반 사건 및 유전자 발현 조절을 포함한 분자 상호작용을 설명한다.EcoCyc는 유전자 발현 또는 대사물학 데이터를 대장균의 전체 규제 네트워크에 도색하는 것과 같은 여러 가지 게놈 스케일 시각화 도구를 제공한다.null
EcoCyc는 EcoCyc 웹 사이트를 통해 다운로드 가능한 파일 세트로 액세스할 수 있으며, Macintosh, PC/Windows, PC/리눅스 컴퓨터에 로컬로 설치할 수 있는 Pathway Tools 소프트웨어와 함께 액세스할 수 있다.다운로드 가능한 소프트웨어는 EcoCyc의 웹 버전을 훨씬 뛰어넘는 기능을 제공한다.null
참조
- ^ a b Keseler, Ingrid M; Collado-Vides Julio; Santos-Zavaleta Alberto; Peralta-Gil Martin; Gama-Castro Socorro; Muñiz-Rascado Luis; Bonavides-Martinez César; Paley Suzanne; Krummenacker Markus; Altman Tomer; Kaipa Pallavi; Spaulding Aaron; Pacheco John; Latendresse Mario; Fulcher Carol; Sarker Malabika; Shearer Alexander G; Mackie Amanda; Paulsen Ian; Gunsalus Robert P; Karp Peter D (Jan 2011). "EcoCyc: a comprehensive database of Escherichia coli biology". Nucleic Acids Res. England. 39 (Database issue): D583–90. doi:10.1093/nar/gkq1143. PMC 3013716. PMID 21097882.
- ^ Karp PD, Riley M, Paley SM, Pelligrini-Toole A (1996). "EcoCyc: an encyclopedia of Escherichia coli genes and metabolism". Nucleic Acids Res. 24 (1): 32–9. doi:10.1093/nar/24.1.32. PMC 145574. PMID 8594595.
 | 이 생물학적 데이터베이스 관련 기사는 단조롭다.위키피디아를 확장하여 도울 수 있다. |
