메신저 RNA 디코딩

Messenger RNA decapping
S. 세레비시아에서 데데닐화 독립적 디코딩의 도식적 표현

메신저 RNA 디코딩 과정은 5' 단인산염을 노출시키는 RNA의 5' 캡 구조의 가수분해로 이루어진다. eukaryotes에서 이 5' 단인산염은 5' exonuclease Xrn1의[1] 기질이며 mRNA는 빠르게 파괴된다. 캡 제거로 이어질 수 있는 상황은 여러 가지가 있으며, 그 중 일부는 아래에서 논의한다.[2]

프로카리오테스에서 초기 mRNA 대본은 박테리아 전사 후 자연적으로 5'-트리인산염 그룹을 소유하고 있다; 효소 RppH는 5'-트리인산염을 5'-모노인산염으로 변환하여 리보뉴클레아제에 의한 mRNA 저하를 유발한다.[3][4]

번역과 쇠퇴

세포 내부에는 번역 과정과 mRNA 붕괴 사이에 균형이 있다.[2] 능동적으로 번역되고 있는 메시지는 폴리솜과 진핵 시작인자 eIF-4E와 eIF-4G(진핵생물에서)에 의해 구속된다. 이것은 디코딩 효소 DCP2에 의한 캡으로의 접근을 차단하고 mRNA 분자를 보호한다. 영양분 경배 조건이나 바이러스 감염에서는 번역이 손상되고 해독이 촉진될 수 있다. 이러한 균형은 P-bides로 알려진 세포질 구조의 크기와 풍부함에 반영된다.[5][6]

특정 붕괴 경로

이상 메시지를 인식하고 디코딩을 촉진하는 많은 특정한 붕괴 경로가 존재한다. 난센스 매개 부패는 조기 정지 코돈을 인식하고 디코딩은 물론 엑소솜에 의한 부패를 촉진한다. 특정 등급의 miRNA도 디코딩을 자극하는 것으로 나타났다.

참조

  1. ^ Poole, Toni L.; Stevens, Audrey (June 1997). "Structural Modifications of RNA Influence the 5′ Exoribonucleolytic Hydrolysis by XRN1 and HKE1 ofSaccharomyces cerevisiae". Biochemical and Biophysical Research Communications. 235 (3): 799–805. doi:10.1006/bbrc.1997.6877. PMID 9207242.
  2. ^ a b Meyer, Sylke; Temme, Claudia; Wahle, Elmar (January 2004). "Messenger RNA Turnover in Eukaryotes: Pathways and Enzymes". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 39 (4): 197–216. doi:10.1080/10409230490513991. PMID 15596551. S2CID 21227254.
  3. ^ Deana, Atilio; Celesnik, Helena; Belasco, Joel G. (17 January 2008). "The bacterial enzyme RppH triggers messenger RNA degradation by 5′ pyrophosphate removal". Nature. 451 (7176): 355–358. Bibcode:2008Natur.451..355D. doi:10.1038/nature06475. PMID 18202662. S2CID 4321451.
  4. ^ Hsieh, Ping-kun; Richards, Jamie; Liu, Quansheng; Belasco, Joel G. (22 April 2013). "Specificity of RppH-dependent RNA degradation in Bacillus subtilis". Proceedings of the National Academy of Sciences. 110 (22): 8864–8869. Bibcode:2013PNAS..110.8864H. doi:10.1073/pnas.1222670110. PMC 3670361. PMID 23610425.
  5. ^ Sheth, Ujwal; Parker, Roy (2 May 2003). "Decapping and Decay of Messenger RNA Occur in Cytoplasmic Processing Bodies". Science. 300 (5620): 805–808. Bibcode:2003Sci...300..805S. doi:10.1126/science.1082320. PMC 1876714. PMID 12730603.
  6. ^ Parker, Roy; Sheth, Ujwal (March 2007). "P Bodies and the Control of mRNA Translation and Degradation". Molecular Cell. 25 (5): 635–646. doi:10.1016/j.molcel.2007.02.011. PMID 17349952.