네오무라

Neomura
할로박테리움 sp. 균주 NRC-1 세포군, 고고학자

네오무라(Neomura)는 고세아에우카리오타의 두 가지 삶의 영역으로 구성된 가능한 쇄골이다. 이 그룹은 2002년에 토마스 캐벌리어-스미스에 의해 이름 지어졌다.[1] 이름은 '세균'에서 진화했다는 그의 가설을 반영해 '새로운 벽'을 의미하며, 주요한 변화 중 하나는 펩티도글리칸 세포벽을 다른 당단백질(glycoprotein)으로 대체하는 것이었다. 2017년 8월 현재, 네오무란 가설은 대부분의 노동자들에게 받아들여지지 않고 있다; 분자 계통생식들은 진핵생물이 모든 고고학자들과의 쇄골을 형성하기 보다는 한 그룹의 고고학자와 가장 밀접하게 연관되어 있고 그것들로부터 진화되어 있다고 제안한다.

형태학

쇄설로 간주되는 네오무라는 다세포 종은 물론 극초음파 종까지 모두 포함하는 매우 다양한 집단이지만 모두 일정한 분자 특성을 공유하고 있다. 모든 네오무란들은 염색체 포장에 도움이 되는 히스톤을 가지고 있고, 대부분은 인트론을 가지고 있다. 모두 메티오닌 분자를 단백질 합성을 위한 이니시에이터 아미노산으로 사용한다(박테리아는 포밀메티오닌을 사용한다). 마지막으로, 박테리아는 오직 하나만 사용하는 반면, 모든 신무란은 여러 종류의 RNA 중합효소를 사용한다.

필로제니

고고학자와 진핵생물 사이의 계통생성 관계에 대한 가설은 여러 가지가 있다.

3도메인뷰

우즈가 1990년 처음 3개 영역 시스템을 발표했을 때,[2][3] 박테리아, 아르케아, 유카리오타 영역은 똑같이 오래되었고 생명의 나무와 동등하게 연관되어 있다고 믿어졌다. 그러나 확실한 증거는 유카리오타와 고세라가 박테리아 둘 중 어느 쪽보다 서로 더 밀접하게 연관되어 있다는 것을 암시하기 시작했다. 이 증거는 대부분의 박테리아에서 발견되지 않는 복잡한 분자인 콜레스테롤프로테아솜의 공통적인 사용을 포함시켜, 한편으로는 생명의 뿌리가 박테리아 사이에 놓여 있다는 추론, 즉 LUCA – 박테리아와 에우카리오타 사이에 존재한다는 추론을 낳았다. 네오무라(이 이름으로 부르지 않음).

박테리아

(네오무라)

에우카리오타

아르케아

"세 가지 주요 영역"(3D) 시나리오는 2010년 진핵생물의 기원에 대한 검토에서 타당하다고 간주된 두 가지 가설 중 하나였다.[4]

파생 클래드 뷰

토마스 카발리에-스미스와 동료들은 2002년 논문과 그 이후 논문에서 네오무라가 악티노박테리아를 자매그룹으로 한 에우박테리아와 깊이 내포되어 있다는 가설을 공표했다. 그는 "유카리오테스와 고고학박테리아가 쇄골 네오무라를 형성하고 자매로, 고고학에서만 파편화된 유전자와 많은 서열 나무에서 결정적으로 보여진다"고 썼다. 이 자매결연은 진핵생물이 고고박테리아와 α-단백질박테리아를 합병하면서 생겨났다는 모든 이론을 반박하는데, 진핵생물과 액티노박테리아가 구체적으로 공유하는 수많은 특징도 설명하지 못하고 있다.[1]

여기에는 네오무라뿐만 아니라 악티노박테리아에도 콜레스테롤프로테아솜의 존재가 포함된다. 이 복잡성의 특징은 별도의 가지에서 이상 진화할 것 같지 않기 때문에, 그 두 가지 경로의 수평이전이 있었거나, 네오무라가 박테리아 나무의 이 특정한 가지에서 진화했다.

루카

클로로박테리아

하도박테리아

시아노박테리아

그라실리쿠테스

에우리박테리아

엔도박테리아

악티노박테리아

네오무라

아르케아

에우카리오타

두 도메인 보기

2010년 초에 eukaryotes의 기원에 대한 3개 도메인 시나리오의 주요 경쟁자는 eukaryotes가 고고학 내에서 출현한 "2개의 도메인"(2D) 시나리오였다.[4] 진핵생물이 다른 고고학자들과 유전적으로 더 유사한 고고학 내 주요 집단인 로키아카게오타(Lokiarchaeota)의 발견은 네오무라 가설과 일치하지 않는다. 대신, 그것은 진핵생물이 고고학자의 한 집단 내에서 출현했다는 가설을 뒷받침한다.[5]

박테리아

에우카리오타

고고학자

고고학자

아르케아

16개의 보편적으로 보존된 리보솜 단백질을 사용한 2016년 연구는 2D 관점을 뒷받침한다. 이것의 "생명의 나무에 대한 새로운 견해"는 진핵생물을 아르케아, 특히 TACK 슈퍼필름 내에 중첩된 작은 집단으로 보여준다. 그러나 eukaryotes의 기원은 미해결 상태로 남아 있고, 2개의 도메인과 3개의 도메인 시나리오가 실행 가능한 가설로 남아 있다.[6]

참고 항목

참조

  1. ^ a b Cavalier-Smith T (March 2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142.
  2. ^ Woese CR, Fox GE (November 1977). "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 74 (11): 5088–90. Bibcode:1977PNAS...74.5088W. doi:10.1073/pnas.74.11.5088. PMC 432104. PMID 270744.
  3. ^ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (June 1990). "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. doi:10.1073/pnas.87.12.4576. PMC 54159. PMID 2112744.
  4. ^ a b Gribaldo, Simonetta; Poole, Anthony M.; Daubin, Vincent; Forterre, Patrick & Brochier-Armanet, Céline (2010-10-01). "The origin of eukaryotes and their relationship with the Archaea: are we at a phylogenomic impasse?". Nature Reviews Microbiology. 8 (10): 743–752. doi:10.1038/nrmicro2426. PMID 20844558. S2CID 12111029.
  5. ^ López-García, Purificación & Moreira, David (2015). "Open Questions on the Origin of Eukaryotes". Trends in Ecology and Evolution. 30 (11): 697–708. doi:10.1016/j.tree.2015.09.005. PMC 4640172. PMID 26455774.
  6. ^ Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C. & Banfield, Jillian F. (2016-04-11). "A new view of the tree of life". Nature Microbiology. 1 (5): 16048. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48. PMID 27572647.

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