펩타이드 라이브러리
Peptide library |
펩타이드 라이브러리는 단백질을 연구하는 도구입니다.펩타이드 라이브러리는 일반적으로 아미노산의 체계적인 조합을 가진 많은 수의 펩타이드를 포함합니다.일반적으로 펩타이드 라이브러리는 주로 수지 위에서 고체상으로 합성되며, 이는 평평한 표면이나 구슬로 만들어질 수 있습니다.펩타이드 라이브러리는 약물 설계, 단백질-단백질 상호 작용 및 기타 생화학 및 의약 분야에 널리 사용되는 도구입니다.
합성 펩타이드 라이브러리는 파지 또는 다른 생물학적 시스템을 사용하지 않고 합성됩니다.이러한 라이브러리는 적어도 5개의 하위 유형이 존재하며, 구별되는 특징은 각 라이브러리의 합성 방법입니다.하위 유형은 다음과 같습니다.
- 중첩 펩타이드 라이브러리
- 절단 펩타이드 라이브러리
- 랜덤 라이브러리
- 알라닌 검색 라이브러리
- 위치 또는 스크램블된 펩타이드 라이브러리.[1]
이러한 형태의 펩타이드 합성은 약 70개의 아미노산의 펩타이드 사슬 길이로 제한되며 일반적으로 더 큰 단백질 연구에 적합하지 않습니다.20개의 아미노산에 대해, 이것은 사전에 설치된 번역 후 수정된 사용 가능한 아미노산의 과잉을 고려하지 않고 20개의 가능한 조합의70 상한을 초래합니다.이러한 총 조합의 수에서 펩타이드 라이브러리의 범위는 사슬의 각 지점에서 원하는 아미노산을 선택함으로써 보다 구체적인 목적을 위해 좁혀질 수 있습니다.
예를 들어, 길이가 10개인 펩타이드 사슬은 더 큰 재조합적으로 발현된 단백질과의 천연 화학 결합에 사용됩니다.
- 잔여물 1: 알라닌
- 잔류물 2: 글루타민, 글리신, 아르기닌, 글루탐산, 세린 또는 메티오닌 중 하나
- 잔류물 3: 20개의 아미노산 중 하나
- 잔기 4: 아세틸리신
- 잔여물 5: 알라닌
- 잔기 6: 이소류신
- 잔류물 7: 아스파르트산
- 잔기 8: 페닐알라닌
- 잔기 9: 아세틸리신
- 잔기 10: 카르복시 말단 티오에스테르가 있는 아르기닌
잔여물 2에서 7개의 가능성과 잔여물 3에서 20개의 가능성으로 총 20 × \ 20 \ 7 또는 라이브러리의 140개의 서로 다른 폴리펩타이드가 될 것입니다.
이 펩타이드 라이브러리는 양전하를 중화하는 라이신에 대한 번역 후 변형 아세틸화의 효과를 분석하는 데 유용할 것입니다.나머지 2와 3에 서로 다른 펩타이드의 라이브러리를 갖는 것은 연구자가 결합된 단백질의 N 말단 꼬리에서 화학적 특성의 일부 변화가 단백질을 다른 방식으로 더 유용하거나 유용하게 만드는지 볼 수 있게 해줍니다.
대규모 랜덤 펩타이드 라이브러리는 고친화성 펩타이드 바인더의 발견을 위한 초대형 [2]화학 라이브러리와 같은 특정 펩타이드 분자의 합성에 종종 사용되며, 라이브러리 크기의 증가는 합성 규모, 라이브러리 구성원의 수와 같은 파라미터에 심각한 영향을 미칩니다.시퀀스 디콘볼루션 및 펩타이드 구조 설명.이러한 기술적 과제를 완화하기 위해 펩타이드 라이브러리 설계에 대한 알고리듬 지원 접근 방식은 질량 분석법을 사용할 때 복잡한 혼합물에서 힘든 순열 식별을 단순화하기 위해 분자 질량 및 아미노산 다양성을 사용할 수 있습니다.이 접근 방식은 대량 [3]중복을 방지하기 위해 사용됩니다.
펩스캔,[4] 젠스크립트와 같은 일부 회사는 맞춤형 펩타이드 [5]라이브러리를 제조합니다.
레퍼런스
- ^ Poh CL, Lalani S (January 2021). "Strategies to identify and develop antiviral peptides". Vitamins and Hormones. Academic Press. 117: 17–46. doi:10.1016/bs.vh.2021.06.008. ISBN 9780323907316. PMID 34420580. S2CID 237269893.
- ^ Quartararo AJ, Gates ZP, Somsen BA, Hartrampf N, Ye X, Shimada A, et al. (June 2020). "Ultra-large chemical libraries for the discovery of high-affinity peptide binders". Nature Communications. 11 (1): 3183. Bibcode:2020NatCo..11.3183Q. doi:10.1038/s41467-020-16920-3. PMC 7311396. PMID 32576815.
- ^ Kalafatovic D, Mauša G, Todorovski T, Giralt E (March 2019). "Algorithm-supported, mass and sequence diversity-oriented random peptide library design". Journal of Cheminformatics. 11 (1): 25. doi:10.1186/s13321-019-0347-6. PMC 6437963. PMID 30923940.
- ^ Zwinkels J. "Custom peptide libraries". Pepscan. Retrieved 2022-07-21.
- ^ "Peptide Library services". www.genscript.com. Archived from the original on 2022-03-14. Retrieved 2022-07-21.
