싱테닌-1

Syntenin-1
SDCBP
Protein SDCBP PDB 1n99.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭SDCBP, MDA-9, ST1, SYCL, TACIP18, MDA9, 싱데칸 결합 단백질
외부 IDOMIM: 602217 MGI: 1337026 호몰로진: 4110 GeneCard: SDCBP
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001098227
NM_016807

RefSeq(단백질)

NP_001091697
NP_058087

위치(UCSC)Cr 8: 58.55 – 58.58MbChr 4: 6.37 – 6.41Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

Syntenin-1은 인간에게 SDCBP 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5]

함수

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 처음에 싱데칸 매개 신호와 사이토스켈레톤을 연결하는 분자로 확인되었다.싱테닌 단백질은 다양한 투과성 단백질의 세포질, C-단자 영역을 묶는 반복 PDZ 도메인을 포함하고 있다.이 단백질은 또한 세포골격-기억 조직, 세포 접착, 단백질 밀매, 전사 인자의 활성화에도 영향을 미칠 수 있다.단백질은 주로 막 관련 부속물과 초점 접착제로 국부화되지만, 내소성 망막과 핵에서도 발견된다.대체 스플라이싱은 여러 개의 대본 변형이 서로 다른 ISO 양식을 인코딩하는 결과를 낳는다.[6]

상호작용

SDCBP는 다음과 상호 작용하는 것으로 나타났다.

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000137575 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000028249 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Grootjans JJ, Zimmermann P, Reekmans G, Smets A, Degeest G, Dürr J, David G (January 1998). "Syntenin, a PDZ protein that binds syndecan cytoplasmic domains". Proc Natl Acad Sci USA. 94 (25): 13683–8. doi:10.1073/pnas.94.25.13683. PMC 28366. PMID 9391086.
  6. ^ "Entrez Gene: SDCBP syndecan binding protein (syntenin)".
  7. ^ Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (February 1999). "The carboxyl terminus of B class ephrins constitutes a PDZ domain binding motif". J. Biol. Chem. 274 (6): 3726–33. doi:10.1074/jbc.274.6.3726. PMID 9920925.
  8. ^ a b Hirbec H, Francis JC, Lauri SE, Braithwaite SP, Coussen F, Mulle C, Dev KK, Coutinho V, Meyer G, Isaac JT, Collingridge GL, Henley JM, Couthino V (February 2003). "Rapid and differential regulation of AMPA and kainate receptors at hippocampal mossy fibre synapses by PICK1 and GRIP". Neuron. 37 (4): 625–38. doi:10.1016/s0896-6273(02)01191-1. PMC 3314502. PMID 12597860.
  9. ^ Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (May 2002). "The PDZ proteins PICK1, GRIP, and syntenin bind multiple glutamate receptor subtypes. Analysis of PDZ binding motifs". J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074/jbc.C200112200. PMID 11891216.
  10. ^ a b Geijsen N, Uings IJ, Pals C, Armstrong J, McKinnon M, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, Coffer PJ (August 2001). "Cytokine-specific transcriptional regulation through an IL-5Ralpha interacting protein". Science. 293 (5532): 1136–8. doi:10.1126/science.1059157. PMID 11498591. S2CID 28003281.
  11. ^ Jannatipour M, Dion P, Khan S, Jindal H, Fan X, Laganière J, Chishti AH, Rouleau GA (August 2001). "Schwannomin isoform-1 interacts with syntenin via PDZ domains". J. Biol. Chem. 276 (35): 33093–100. doi:10.1074/jbc.M105792200. PMID 11432873.
  12. ^ a b Tomoda T, Kim JH, Zhan C, Hatten ME (March 2004). "Role of Unc51.1 and its binding partners in CNS axon outgrowth". Genes Dev. 18 (5): 541–58. doi:10.1101/gad.1151204. PMC 374236. PMID 15014045.
  13. ^ Chen F, Du Y, Zhang Z, Chen G, Zhang M, Shu HB, Zhai Z, Chen D (April 2008). "Syntenin negatively regulates TRAF6-mediated IL-1R/TLR4 signaling". Cell. Signal. 20 (4): 666–74. doi:10.1016/j.cellsig.2007.12.002. PMID 18234474.
  14. ^ "Results - mentha: the interactome browser". mentha.uniroma2.it. Retrieved 2017-05-04.

추가 읽기