세린/아르긴이 풍부한 스플라이싱 인자 1

Serine/arginine-rich splicing factor 1
SRSF1
Protein SFRS1 PDB 1x4a.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스SRSF1, ASF, SF2, SF2p33, SFRS1, SRp30a, ASF/SF2, 세린/아르기닌이 풍부한 스플라이싱 계수 1, 세린 및 아르기닌이 풍부한 스플라이싱 계수 1
외부 IDOMIM: 600812 MGI: 98283 HomoloGene: 31411 GeneCard: SRSF1
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

6426

110809

앙상블

ENSG00000136450

ENSMUSG000018379

유니프로트

Q07955

Q6PDM2

RefSeq(mRNA)

NM_001078166
NM_006924

NM_001078167
NM_173374

RefSeq(단백질)

NP_001071634
NP_008855

NP_001071635
NP_775550

장소(UCSC)Chr 17: 58 ~58.01 MbChr 11: 87.94 ~87.94 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
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대체 스플라이싱 인자 1(ASF1), 프리mRNA 스플라이싱 인자 SF2(SF2) 또는 ASF1/SF2라고도 불리는 세린/아르긴이 풍부한 스플라이싱 인자 1(SRSF1)은 SRSF1 [5]유전자에 의해 인체 내에서 코드되는 단백질이다.ASF/SF2는 사전 mRNA [6][7][8]스플라이싱과 관련된 필수 배열별 스플라이싱 인자입니다.SRSF1은 ASF/SF2를 코드하는 유전자로 17번 염색체에서 발견된다.결과 스플라이싱 인자는 약 33kDa의 [10]단백질입니다. ASF/SF2는 모든 스플라이싱 반응이 일어나는데 필요하며 농도 의존적인 방식으로 스플라이스 부위 선택에 영향을 미치므로 대체 [7]스플라이싱이 발생합니다.ASF/SF2는 스플라이싱 프로세스에 관여할 뿐만 아니라 mRNA 핵 수출 및 [11]번역과 같은 포스트 스플라이싱 활동도 중개합니다.

구조.

ASF/SF2는 SR단백질이며, 따라서 ASF/SF2 조절의 대부분이 이루어지는 아르기닌-세린 리치 영역(RS 도메인)과 ASF/SF2가 RNA 및 기타 스플라이싱 [12][13]인자와 상호작용하는 2개의 RNA 인식 모티브(RRM)를 포함한다.이러한 모듈은 일반적인 스플라이싱 계수 [13]기능 내에서 서로 다른 기능을 가집니다.

  • NMR structure of the second RRM domain of ASF/SF2 based on the PDB: 2O3D​ coordinates.[14]

    PDB: 2O3D [14]좌표에 기반한 ASF/SF2의 두 번째 RRM 도메인의 NMR 구조.

  • ASF/SF2 (left: red/orange/yellow) complexed with SRPK1 (right: blue/green/yellow) based on the 3BEG​ crystallographic coordinates.[12]

    ASF/SF2(왼쪽: 빨간색/주황색/노란색)는 3BEG [12]결정 좌표를 기준으로 SRPK1(오른쪽: 파란색/녹색/노란색)과 복합되어 있습니다.

스플라이싱

ASF/SF2는 스플라이싱 프로세스의 수많은 컴포넌트의 필수 요소입니다.ASF/SF2는 5' 스플라이스 부위의 분할 및 선택에 필요하며, 암호 스플라이스 [10]부위와 진짜 스플라이스 부위의 구별이 가능합니다.프리 mRNA 스플라이싱의 첫 번째 화학적 단계에서의 후속 라리아 형성에도 ASF/[10]SF2가 필요합니다.ASF/SF2는 5' 스플라이스 부위로의 U1 snRNP의 신병을 촉진하고, 5' 및 3' 스플라이스 부위의 교량을 [8]촉진하여 스플라이싱 반응을 촉진합니다.또한 ASF/[15]SF2는 U2 snRNP와 관련되어 있습니다.반응 중에 ASF/SF2는 인트론 근위부 사이트의 사용을 촉진하고 인트론 원위부 사이트의 사용을 방해하여 대체 스플라이싱에 [16][17]영향을 미칩니다.대체 스플라이싱은 ASF/SF2의 농도에 따라 영향을 받습니다. ASF/SF2의 농도가 다르면 대체 스플라이싱 조절 메커니즘으로 제품 아이소폼의 [6]양이 달라집니다.ASF/SF2는 엑소닉 스플라이싱 인핸서(ESE) 시퀀스에 [16]대한 직접 또는 간접 결합을 통해 이 조절을 달성합니다.

포스트 스플라이싱

ASF/SF2는 elF4E의 존재 하에서 4E-BP의 활성을 억제하고 [11]번역의 추가 조절을 위한 분자를 모집함으로써 리보솜 결합 mRNA의 번역 개시를 촉진한다.ASF/SF2는 핵 수출 단백질 TAP과 규제 방식으로 상호작용하여 [18]핵에서 성숙한 mRNA의 수출을 통제한다.세포 ASF/SF2의 증가는 또한 난센스 매개 mRNA 붕괴(NMD)의 효율성을 증가시켜 mRNA가 핵에서 세포질로 [19]수출된 후 발생하는 NMD보다 핵에서 방출되기 전에 발생하는 NMD를 선호한다.ASF/SF2의 증가로 인한 NMD의 변화는 elF4E 결합 mRNA 번역과 그에 따른 번역 활성 리보솜을 통해 개척자 번역 라운드의 전반적인 강화, 개척자 번역 개시 복합체와 ASF/SF2의 연관성 증가 및 활성 [19]TAP의 수준 증가를 수반한다.

인산화 조절

ASF/SF2는 SR특이 단백질인산화효소, SRPK1 [13]및 ASF/[12][18]SF2에 의해 RS 도메인의 세린에서 인산화되는d 능력을 가진다.SRPK1은 방향성 및 진행 메커니즘을 통해 ASF/SF2의 RS 도메인에서 최대 12개의 세린을 선택적으로 인산화하여 C 말단에서 N [13]말단으로 이동시킨다.이 다인산화는 ASF/SF2를 핵으로 유도하여 [13]스플라이싱과 관련된 많은 단백질-단백질 상호작용에 영향을 미칩니다.핵에서 성숙한 mRNA를 수출하는 ASF/SF2의 기능은 인산화 상태에 따라 달라지며, ASF/SF2의 탈인화는 [13]TAP와의 결합을 촉진하는 반면, 인산화 작용은 ASF/SF2를 핵 [18]반점으로 유도한다.ASF/SF2의 인산화 및 탈인산화 모두 중요하며 적절한 스플라이싱이 일어나려면 스플라이싱 [20]과정에서의 단계 간 전이가 표시되기 때문에 필요하다.또한 Clk/Sty에 의한 ASF/SF2의 저인산화 및 과인산화로 스플라이싱 [13]저해를 초래할 수 있다.

생물학적 중요성

안정성 및 충실도

ASF/SF2는 게놈 안정성에 관여한다. RNA 중합효소는 돌연변이 유발 DNA의 형성을 방해하기 위해 ASF/SF2에서 초기 RNA 전사를 모집하는 것으로 생각된다.전사물과 템플릿 [8]DNA 사이의 RNA 하이브리드 R-루프 구조.이와 같이 ASF/SF2는 전사 [8]자체의 잠재적 유해 효과로부터 세포를 보호합니다.또한 ASF/SF2는 Exon 스킵을 방지하고 스플라이싱이 정확하고 [10]정확하게 발생함을 보장하는 세포 메커니즘과 관련이 있습니다.

개발과 성장

ASF/SF2는 일반적으로 심장 발달,[12] 발생, 조직 형성, 세포 운동성,[21][22] 세포 생존력에서 중요한 기능을 가지고 있는 것으로 나타났다.

임상적 의의

SFRS1은 원종 유전자이므로 ASF/SF2는 온코프로틴으로 작용할 수 있으며 중요한 세포 주기 조절 유전자와 억제 [13]유전자의 스플라이싱 패턴을 바꿀 수 있습니다.ASF/SF2는 다양한 종양 억제 유전자, 키나아제 및 키나아제 수용체의 스플라이싱을 제어하며, 이들 모두는 종양 유발 [23]동질체로 대체적으로 스플라이싱될 가능성이 있다.따라서 ASF/SF2는 많은 [13]종양에서 과잉 발현되어 암 치료의 중요한 대상이다.

대체 스플라이싱 경로의 변경과 결함은 다양한 인간 [24]질병과 관련이 있다.

ASF/SF2는 HIV-1의 복제에 관여하고 있습니다.HIV-1은 바이러스 [25]DNA의 스플라이스 형태와 비스플라이스 형태의 섬세한 균형을 필요로 하기 때문입니다.HIV-1의 복제에 있어서의 ASF/SF2의 작용은 HIV 치료의 잠재적인 [25]타겟입니다.ASF/SF2는 대체 스플라이싱을 [26][27]통해 T세포 수용체의 특이적 연쇄 발현을 변화시키면서 전신성 루푸스 에리테마토수스의 T세포 수용체 생성에도 관여한다.

상호 작용

ASF/SF2는 다음 제품과 상호 작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

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외부 링크

  • PDB for UniProt: Q07955(Serine/arginine이 풍부한 스플라이싱 계수 1)에서 PDBe-KB에 제공되는 모든 구조 정보의 개요.