스플릿트리

SplitsTree
스플릿트리
개발자다니엘 휴슨과 데이비드 브라이언트
안정적 해제
4.17.1 / 2021
릴리스 미리 보기
5.3 / 2021
운영 체제Windows, Linux, Mac OS X
유형생물정보학
면허증소유권
웹사이트uni-tuebingen.de/fakultaeten/mathematisch-naturwissenschaftliche-fakultaet/fachbereiche/informatik/lehrstuehle/algorithms-in-bioinformatics/software/splitstree/

스플릿트리(SplitsTree)는 시퀀스 정렬, 거리 매트릭스 또는 트리 세트와 같은 다양한 유형의 데이터에서 계통생성 트리, 계통생성 네트워크 또는 보다 일반적으로 그래프를 분할하는 데 사용되는 인기 있는 프리웨어 프로그램이다.[1][2]SplitsTree는 분할 분해,[3] 인접 네트워크, 컨센서스 [4]네트워크, 슈퍼 네트워크 방법 또는 혼합 네트워크 또는 단순 재조합 네트워크를 계산하는 방법과 같은 게시된 방법을 구현한다.NEXX 파일 형식을 사용한다.분할 그래프는 특수 데이터 블록(SPLITS 블록)을 사용하여 정의된다.

SplitsTree v4.6에서 생성된 인접 네트워크-넷필로제틱 네트워크의 예.

참고 항목

참조

  1. ^ Dress, A.; K. T. Huber; V. Moulton (2001). "Metric spaces in pure and applied mathematics" (PDF). Documenta Mathematica: 121–139.
  2. ^ Huson, D. H.; D. Bryant (2006). "Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies". Mol. Biol. Evol. 23 (2): 254–267. doi:10.1093/molbev/msj030. PMID 16221896.
  3. ^ Bandelt, H. J.; Dress, A. W. (1992). "Split decomposition: a new and useful approach to phylogenetic analysis of distance data". Molecular Phylogenetics and Evolution. 1 (3): 242–252. doi:10.1016/1055-7903(92)90021-8. ISSN 1055-7903. PMID 1342941.
  4. ^ Holland, Barbara; Moulton, Vincent (2003). Benson, Gary; Page, Roderic D. M. (eds.). "Consensus Networks: A Method for Visualising Incompatibilities in Collections of Trees". Algorithms in Bioinformatics. Lecture Notes in Computer Science. Springer Berlin Heidelberg. 2812: 165–176. doi:10.1007/978-3-540-39763-2_13. ISBN 9783540397632.

외부 링크