스플릿트리
SplitsTree개발자 | 다니엘 휴슨과 데이비드 브라이언트 |
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안정적 해제 | 4.17.1 / 2021 |
릴리스 미리 보기 | 5.3 / 2021 |
운영 체제 | Windows, Linux, Mac OS X |
유형 | 생물정보학 |
면허증 | 소유권 |
웹사이트 | uni-tuebingen |
스플릿트리(SplitsTree)는 시퀀스 정렬, 거리 매트릭스 또는 트리 세트와 같은 다양한 유형의 데이터에서 계통생성 트리, 계통생성 네트워크 또는 보다 일반적으로 그래프를 분할하는 데 사용되는 인기 있는 프리웨어 프로그램이다.[1][2]SplitsTree는 분할 분해,[3] 인접 네트워크, 컨센서스 [4]네트워크, 슈퍼 네트워크 방법 또는 혼합 네트워크 또는 단순 재조합 네트워크를 계산하는 방법과 같은 게시된 방법을 구현한다.NEXX 파일 형식을 사용한다.분할 그래프는 특수 데이터 블록(SPLITS 블록)을 사용하여 정의된다.
참고 항목
참조
- ^ Dress, A.; K. T. Huber; V. Moulton (2001). "Metric spaces in pure and applied mathematics" (PDF). Documenta Mathematica: 121–139.
- ^ Huson, D. H.; D. Bryant (2006). "Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies". Mol. Biol. Evol. 23 (2): 254–267. doi:10.1093/molbev/msj030. PMID 16221896.
- ^ Bandelt, H. J.; Dress, A. W. (1992). "Split decomposition: a new and useful approach to phylogenetic analysis of distance data". Molecular Phylogenetics and Evolution. 1 (3): 242–252. doi:10.1016/1055-7903(92)90021-8. ISSN 1055-7903. PMID 1342941.
- ^ Holland, Barbara; Moulton, Vincent (2003). Benson, Gary; Page, Roderic D. M. (eds.). "Consensus Networks: A Method for Visualising Incompatibilities in Collections of Trees". Algorithms in Bioinformatics. Lecture Notes in Computer Science. Springer Berlin Heidelberg. 2812: 165–176. doi:10.1007/978-3-540-39763-2_13. ISBN 9783540397632.
외부 링크
- SplitsTree 홈페이지(SplitsTree에 대한 정보를 위한 새로운 웹 사이트)
- 에버하르트 칼스 대학교 컴퓨터과학부 주최로 최신 버전(4.15)과 매뉴얼(2019년 6월)에 대한 대체 다운로드 페이지
- 생물정보학의 알고리즘, SplacesTree 및 기타 생물정보학 소프트웨어를 개발하는 Daniel Husson의 작업 그룹
- 워싱턴 대학교에서 주최하는 계통형 소프트웨어 목록
- 계보학적 네트워크 세계는 분할 그래프의 광범위한 예를 제공하며, 대부분은 분할 트리로 생성되었다.
- Phylogenetic Networks에서 Who가 Phylogenetic Networks를 다루는 소프트웨어, 연구자 및 문헌 목록을 작성