초이차 구조

Supersecondary structure

2차 구조는 단백질 도메인 또는 서브 유닛보다 작은 2차 구조의 여러 인접 요소의 콤팩트한 3차원 단백질 구조이다.초2차 구조는 단백질 접힘 과정에서 핵으로 작용할 수 있다.

예

나선형 초이차 구조

나선형 머리핀 이미지

나선형 머리핀

알파 알파 헤어핀이라고도 불리는 나선형 헤어핀은 2개 이상의 잔류물의 루프로 연결된 2개의 역평행 알파 헬리크로 구성된다.이름 그대로 머리핀을 닮았다.루프가 길수록 설정 가능한 수가 많아집니다.짧은 가닥이 나선을 연결하면 개별 나선은 소수성 잔류물을 통해 함께 채워집니다.나선 머리핀의 기능은 알려지지 않았지만, 4개의 나선 다발은 중요한 리간드 [1]결합 부위를 가진 2개의 나선 머리핀으로 구성되어 있다.

나선 코너

알파-알파 코너라고도 불리는 나선형 코너는 짧은 '루프'에 의해 서로 거의 직각으로 연결된 두 개의 알파 나선형 코너를 가지고 있습니다.이 루프는 소수성 잔류물로 형성됩니다.나선 모서리의 기능은 알려져 [1]있지 않습니다.

나선-루프

참고 항목: 기본 helix-loop-helix

나선-루프-나선 구조는 '루프'에 의해 연결된 두 개의 나선 구조를 가지고 있다.이것들은 꽤 흔하고 보통 결합 리간드이다.예를 들어 칼슘은 나선 [1]사이의 루프 영역 내에서 측쇄의 카르복실기와 결합한다.

나선형 나선형

다음 항목도 참조하십시오.나선형 나선형

나선-돌기-나선 모티브는 DNA 결합에 중요하므로 많은 DNA 결합 단백질에 존재한다.[1]

베타 시트 초보조 구조

베타 머리핀 이미지

베타 머리핀

다음 항목도 참조하십시오.베타 머리핀

베타 머리핀은 루프로 연결된 두 개의 반평행 베타 가닥으로 구성된 일반적인 초 2차 모티브입니다.그 구조는 머리핀을 닮았고 구상 단백질에서 종종 발견된다.

베타 가닥 사이의 루프는 2 ~ 16개의 잔류물 범위에 있을 수 있습니다.그러나 대부분의 루프에는 7개 미만의 [2]잔류물이 포함되어 있습니다.2, 3, 4의 루프를 가진 베타 헤어핀의 잔류물은 뚜렷한 형태를 가지고 있다.그러나 '랜덤 코일'이라고도 하는 긴 루프에서 광범위한 구성을 볼 수 있습니다.β-meander는 헤어핀에 [3]의해 연결된 연속된 반팔레알-베타 가닥으로 구성된다.

두 개의 잔류 루프를 베타 턴 또는 역회전이라고 합니다.타입 I'와 타입 II의 역회전 발생 빈도는 타입 I과 타입 II의 턴보다 입체적인 장애가 적기 때문에 가장 많이 발생한다.베타 헤어핀의 기능은 [2]알려져 있지 않습니다.

베타 코너

베타 헤어핀은 서로 약 90도의 각도에 있는 2개의 역평행 베타 가닥을 가지고 있다.한쪽 가닥에는 글리신 잔기가 있고 다른 한쪽 가닥에는 베타 팽대부가 있는 베타 헤어핀이 방향을 바꿔 형성된다.베타 코너에는 정상적인 [2]기능이 없다.

그리스어 키 모티브

그리스어 키 모티브는 4개의 베타 스트랜드로 구성되어 있습니다.

그리스어 키 모티브에는 다음 4가지 특징이 있습니다.

  1. 순차적으로 연결된 4개의 베타 가닥이 서로 인접하지만 반드시 기하학적으로 정렬될 필요는 없습니다.
  2. 베타 시트는 반평행이며, 서로 다른 가닥이 반대 방향으로 진행됩니다.
  3. 첫 번째 가닥과 마지막 가닥은 서로 옆에 있고 수소 결합에 의해 결합됩니다.
  4. 연결 루프는 길고 다른 보조 구조를 포함할 수 있습니다.

그리스 열쇠 모티브는 그리스 항아리에서 볼 수 있는 무늬처럼 생겼기 때문에 그 이름을 가지고 있다.이 모티브는 알려진 기능이 없습니다.

다른.

β-프로세서(복수의 수소 결합 개별 β-프로세서)는 2차 또는 2차 구조로 간주되기도 한다.

혼합 초2차 구조

베타 알파 베타 모티브

두 개의 로스만은 크립토스폴리듐 파르붐 락트산탈수소효소에서 NAD+ 결합으로 접힙니다.

베타 알파 베타 모티브는 연결 루프를 통해 알파 나선에 의해 결합된 2개의 베타 스트랜드로 구성된다.베타 가닥은 평행하며, 나선도 가닥과 거의 평행합니다.이 구조는 평행한 가닥을 가진 거의 모든 단백질에서 볼 수 있다.베타 가닥과 알파 나선을 연결하는 루프는 길이가 다를 수 있으며 종종 배위자를 결합합니다.

베타 알파 베타 나선은 왼손잡이 또는 오른손잡이일 수 있습니다.한 가닥이 다른 가닥 위에 오도록 베타 가닥의 N 말단에서 보았을 때, 왼손 베타 알파 베타 모티브는 베타 가닥의 왼쪽에 알파 나선을 가진다.더 일반적인 오른손 모티브는 베타 [4]가닥을 포함하는 평면의 오른쪽에 알파 나선이 있을 것이다.

로스만 폴드

Michael Rossman의 이름을 딴 Rossman 접힘은 베타 가닥, 나선, 베타 가닥, 나선, 베타 가닥 등 3개의 베타 가닥과 2개의 나선으로 번갈아 구성되어 있습니다.이 모티브는 단백질 내에서 사슬의 방향을 반대로 하는 경향이 있습니다.로스만 접힘은 대부분의 [4]탈수소효소 내에서 NAD와 같은 뉴클레오티드를 결합하는 중요한 생물학적 기능을 가지고 있다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c d "Helix Supersecondary Structures". biomedapps.curtin.edu.au. Retrieved 2020-01-31.
  2. ^ a b c "Beta sheet supersecondary structures". biomedapps.curtin.edu.au. Retrieved 2020-01-31.
  3. ^ Cooper, J. (1995-01-26). "Supersecondary Structure". VSNS-PPS Course Material. Retrieved 2020-03-14.{{cite web}}: CS1 maint :url-status (링크)
  4. ^ a b "Mixed Beta Strand and Helix Structures". biomedapps.curtin.edu.au. Retrieved 2020-01-31.

추가 정보

  • Chiang YS, Gelfand TI, Kister AE, Gelfand IM (2007). "New classification of supersecondary structures of sandwich-like proteins uncovers strict patterns of strand assemblage". Proteins. 68 (4): 915–921. doi:10.1002/prot.21473. PMID 17557333.