삼분류 분석

Three-taxon analysis
3분류 분석(3ia).Grand A, Corvez A, Duque Vellez LM, Laurin M.[1] 2013의 그림 1에서 수정.

3종류 분석(또는 TTS, 3항목 분석, 3ia)은 클래디스트 기반의 계통 재구성 방법이다.1991년[2] 넬슨과 플래트닉이 생물의 계통 발생을 재구성하기 위해 도입한 이 방법은 생물 지리학적 영역에도 적용될 수 있다.문제를 더 단순한 덩어리로 분해하여 복잡한 계통수를 재구성하려고 합니다.모든 X 분류군의 관계를 한 번에 해결하려는 것이 아니라 한 번에 3 분류군을 고려합니다.세 가지 세금계산서(3is)를 생성하는 것은 비교적 쉽다. 즉, "A와 B는 C보다 서로 더 밀접하게 관련되어 있다."[3]라는 형식의 진술서를 생성한다.3개 분류군의 각 그룹을 검토하면, 이 방법은 가능한 [3]한 많은 3개 항목 문장과 일치하는 트리를 구축한다.

이론적인 관점에서 이 방법에는 세 가지 주요 문제가 있다. (1) 성격 진화는 돌이킬 수 없는 것으로 가정된다. (2) 논리적으로 독립적이지 않은 3is는 마치 그것인 것처럼 취급된다. (3) 특정 트리에 대한 독립적인 지지로 간주되는 3is는 그 트리에서 상호 배타적일 수 있다.[4]

3가지 분류 분석을 실행하는 컴퓨터 프로그램은 리스베스입니다[5](체계 및 생물 지리학 연구용)입니다.리스베스는 자유롭게 [6]석방되었다.최근 시뮬레이션 기반 연구에 따르면, 3종류 분석은 양호한 검정력과 질서 상태를 [1]가진 근친성과 무질서 상태를 가진 근친성 사이의 중간 오차율을 산출한다.

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레퍼런스

  1. ^ a b Grand, Anaïs; Corvez, Adèle; Duque Velez, Lina Maria; Laurin, Michel (2013). "Phylogenetic inference using discrete characters: Performance of ordered and unordered parsimony and of three-item statements". Biological Journal of the Linnean Society. 110 (4): 914–930. doi:10.1111/bij.12159.
  2. ^ Nelson, G.; Platnick, N. I. (1991). "Three-Taxon Statements: A More Precise Use of Parsimony?". Cladistics. 7 (4): 351. doi:10.1111/j.1096-0031.1991.tb00044.x. S2CID 86270478.
  3. ^ a b Zaragueta-Bagils, R.; Bourdon, E. (2007). "Three-item analysis: Hierarchical representation and treatment of missing and inapplicable data". Comptes Rendus Palevol. 6 (6–7): 527. doi:10.1016/j.crpv.2007.09.013.
  4. ^ De Laet, J.; Smets, E. (1998). "On the three-taxon approach to parsimony analysis". Cladistics. 14 (4): 363–381. doi:10.1111/j.1096-0031.1998.tb00344.x. PMID 34929915. S2CID 221583681.
  5. ^ Bagils, R. Z. E.; Ung, V.; Grand, A. S.; Vignes-Lebbe, R. G.; Cao, N. L.; Ducasse, J. (2012). "LisBeth: New cladistics for phylogenetics and biogeography". Comptes Rendus Palevol. 11 (8): 563. doi:10.1016/j.crpv.2012.07.002.
  6. ^ "LisBeth package".