직접 반복

Direct repeat

직접반복은 특정 염기서열의 두 개 이상의 반복으로 구성된 유전적 염기서열의 일종이다.[1]즉, 직접적인 반복은 게놈의 여러 복사본에 존재하는 뉴클레오티드 시퀀스다.일반적으로 다운스트림에서 동일한 패턴으로 시퀀스를 반복할 때 직접 반복이 발생한다.[1]직접 반복과 관련된 반전[clarification needed] 및 역보완은 없다.그것은 뉴클레오티드를 개입시킬 수도 있고 그렇지 않을 수도 있다.굵은 글씨로 쓰여진 뉴클레오티드 순서는 반복된 순서를 나타낸다.null

5" TTACGnnnnnnnnnnnn.TTACG 3.
3"AATGCnnnnnnnnnnnn.AATGC 5.

언어학적으로, 전형적인 직접적인 반복은 "안녕"이라고 말하는 것과 비슷하다.[1]null

종류들

반복 시퀀스에는 다음과 같은 몇 가지 유형이 있다.

  • 간분해(또는 분산된) DNA 반복(간분해 반복 시퀀스)은 게놈 전체에 걸쳐 분산된 전이 가능한 원소들의 복제품이다.
  • 플랭킹(또는 단자) 반복(단자 반복 시퀀스)은 시퀀스의 양 끝에 반복되는 시퀀스로서, 예를 들어 역행 시 롱 단자 반복(LTR)이 있다.직접 단자 반복은 같은 방향이고 반전 단자 반복은 서로 반대 방향이다.
  • 탠덤 반복(tandem repeat sequence, tandem repeat sequence)은 서로 인접해 있는 반복 복사다.이러한 반복은 직접 또는 반전 반복일 수도 있다.[citation needed]리보솜 RNA와 전이 RNA 유전자는 중간 반복 DNA 등급에 속한다.

참고 항목

참조

  1. ^ a b c Ussery, David W.; Wassenaar, Trudy; Borini, Stefano (2008-12-22). "Word Frequencies, Repeats, and Repeat-related Structures in Bacterial Genomes". Computing for Comparative Microbial Genomics: Bioinformatics for Microbiologists. Computational Biology. Vol. 8 (1 ed.). Springer. pp. 133–144. ISBN 978-1-84800-254-8.


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