분자 설계 소프트웨어
Molecular design software분자 설계 소프트웨어는 분자 모델 개발을 특별히 지원하는 분자 모델링을 위한 소프트웨어입니다.
분자 역학 및 양자 화학과 같은 일반적인 분자 모델링 프로그램과 대조적으로, 이러한 소프트웨어는 다음을 포함한 분자 모델 구축과 관련된 측면을 직접적으로 지원합니다.
분자 설계의 주요 측면을 다루는 소프트웨어 비교
| 3D | 마우스 | 폴리 | DNA | 펩타이드 | 결정 | 솔브 | Q | 독 | 분 | 음. | 품질관리 | FF | QSAR | FBLD | FE | SN | 웹 사이트 | 평. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 전복 | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | biomolecular-modeling.com | 생체분자 그래픽스 환경: 고분자 빌더, GPU 가속 MD | |||
| 오렌지 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | ambermd.org | 고전 분자 모델링 프로그램 | ||
| 아스칼라프 디자이너 | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 민첩한 분자 | 공통 분자 모델링 스위트 | |||
| 보스 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 예일 대학교 | OPLS 발명가 | |||
| 디스커버리 스튜디오 | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | Dassault Systems BIOSVIA | 소규모 및 매크로 분자 시스템 모두를 위한 분자 모델링 환경 | |||
| 독 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 캘리포니아 대학교 | DOK 알고리즘 | |||
| Firefly (PC GAMESS) | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 모스크바 주립 대학교 | Ab initio 및 DFT 계산 화학 프로그램 | |||
| 폴드X | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 아니요. | CRG | 에너지 계산 및 단백질 설계를 위한 힘장 | |||
| 리드 파인더 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 몰테크 | 분자 도킹 패키지 | |||
| 머티리얼스튜디오 | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | Dassault Systems BIOSVIA | 소프트웨어 환경 | |||
| 분자 조작 환경(MOE) | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 케미컬 컴퓨팅 그룹 | Scientific Vector Language로 프로그래밍된 분자 모델링/약물 발견 애플리케이션을 위한 플랫폼, 애플리케이션 맞춤 및 개발 가능 | ||
| 로제타(Rosetta Commons) | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 아니요. | 로제타 커먼즈 | 고분자 모델링을 위한 스위트.단백질 구조의 모델링 및 분석을 위한 알고리즘.de novo 단백질 설계, 효소 설계, 배위자 도킹, 구조 예측의 주요 발전 | |||
| 샘슨 | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | SAMSON Connect(SAMSON Connect) | 계산나노과학(생명과학, 재료 등), 모듈러 아키텍처, 모듈명은 엘리먼트(Elements), 프리(free) | |||
| 스크리그레스 | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 네. | 후지쯔 | 범용 분자 모델링 스위트 | |||
| 스파르타어 | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 파동 함수 | 분자역학 및 양자화학엔진을 갖춘 분자모델링 툴 | |||
| 팅커 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 워싱턴 대학교 | 단백질 설계 도구, 프리웨어 | |||
| 윈모스타 | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | X-기능 | 재료 과학용 분자 모델링 및 시각화 프로그램 |
주 및 참고 자료
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외부 링크
- 분자 설계 IUPAC 용어 정의.
- 컴퓨터 보조 분자 설계 저널
- 분자 모델링 리소스
- 재료 모델링 및 컴퓨터 시뮬레이션 코드
- Click2Drug.org in silico(컴퓨터 지원) 약물 설계 도구 디렉토리.
- 화학정보 및 모델링 저널
- 컴퓨터 화학 저널