RNASEH2B

RNASEH2B
RNASEH2B
3puf highlight subunit B.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스RNASEH2B, AGS2, DLEU8, 리보핵산가수분해효소 H2 서브유닛 B
외부 IDOMIM: 610326 MGI: 1914403 HomoloGene: 41572 GenCard: RNACEH2B
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

79621

67153

앙상블

ENSG00000136104

ENSMUSG000021932

유니프로트

문제 5 TBB1
Q8N451

Q80ZV0

RefSeq(mRNA)

NM_001142279
NM_024570

NM_026001

RefSeq(단백질)

NP_001135751
NP_078846
NP_078846.2

NP_080277

장소(UCSC)Chr 13: 50.91 ~51.02 MbChr 14: 62.53 ~62.61 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

리보핵산가수분해효소 H2, 서브유닛 B는 인간에서 RNAESH2B [5]유전자에 의해 코드되는 단백질이다.RNase H2는 단일 촉매 서브유닛(A)과 두 개의 비촉매 서브유닛(B 및 C)으로 구성되며 RNA의 RNA를 분해합니다.DNA 혼성.RNase H2의 비촉매 B 서브유닛은 DNA [5]복제에 역할을 하는 것으로 생각된다.

이 유전자의 돌연변이는 아이카디-구티에레스 증후군 타입 2의 원인이다.[5][6]

모델 유기체

Rnaseh2b 녹아웃 마우스 표현형

모델 유기체는 RNASEH2B 기능의 연구에 사용되어 왔다.Rnaseh2b라고tm1a(EUCOMM)Wtsi[11][12] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인이 International Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일부로 생성되었습니다.이것은 질병 동물 모델을 생성하고 관심 있는 [13][14][15]과학자들에게 배포하는 높은 처리량 돌연변이 유발 프로젝트입니다.

수컷과 암컷은 표준화된 표현형 검사를 통해 [9][16]결실의 효과를 확인했습니다.돌연변이 생쥐에 대해 24개의 검사가 수행되었고 3개의 유의한 이상이 [9]관찰되었다.임신 기간 동안 동종 돌연변이 배아는 확인되지 않았고, 따라서 젖을 뺄 때까지 생존한 배아는 없었다.나머지 테스트는 헤테로 접합 돌연변이 성체 쥐를 대상으로 수행되었으며 암컷 [9]동물에서 세균 감염에 대한 감수성 증가가 관찰되었다.

DNA에 잘못 혼재된 리보뉴클레오티드는 RNAESH2에 의해 제거된다.생쥐의 RNASEH2 활성 부족은 인간의 [17]아이카디-구티에레스 증후군을 반영하는 질환인 백질 결함, 신경염증 및 소뇌 위축을 일으킨다.수리되지 않은 DNA 손상 신호는 아이카디-구티에레스 [17]증후군의 특징인 신경 퇴행성 특징의 기본 원인인 것으로 보입니다.

돌연변이 발생 연구

생쥐의 Rnaseh2b 유전자 녹아웃은 초기 배아 치사율을 유발하며, 따라서 exon7 Rnaseh2b의 조기 정지 코돈을 가진 유전자 조작 생쥐가 [18]생성되었다.성장 정지는 게놈 DNA에서 단일 RN의 축적과 관련된 p53 의존성 DNA 손상 반응의 결과라는 가설을 세웠다.

리보뉴클레오티드는 DNA 중합효소에 의한 혼입의 결과로 RNaseH2 늘세포에 축적된다.리보뉴클레오티드 혼입은 메타조안에서 일어나며 이러한 병변은 포유동물 세포에 해로우며, 쥐 배아 발달에 있어 제거가 필요하다.병변은 세포당 약 1.00.000의 빈도로 게놈 DNA에 단일 또는 diRN 공유 결합되어 포유류의 게놈에서 가장 일반적인 내인성 기저 병변이다.이러한 병변은 주요 복제 중합효소에 의한 잘못된 결합으로 가장 잘 설명된다.

RNase H2는 리보뉴클레오티드 제거에 필요한 게놈 감시 효소이다.RNaseH2null 생쥐의 게놈 DNA에서 리보뉴클레오티드 축적은 게놈 무결성 유지에 RNaseH2 복합체를 포함한다.이러한 리보뉴클레오티드 변화는 리보오스 2'-히드록실기가 가수 분해에 대한 인접 포스포디에스터 결합의 감수성을 증가시키기 때문에 해로울 수 있다.실제로 그들은 리보뉴클레오티드가 ~7.600nt마다 세포당 1개씩 결합되고 있다고 보고한다=1.300.000 병변.이는 진핵생물 복제 중합효소에 의한 시험관내 혼입률에서 예측된 규모와 동일한 순서를 가진다.

잘못 통합된 리보뉴클레오티드는 DNA 손상을 유발한다.리보뉴클레오티드가 복제를 방지하지 않는 것이 아니라, polDNA는 리보뉴클레오티드를 포함한 템플릿을 견딜 수 있으며, 정상적인 초기 발생을 가지고 있다.이 문제는 리보뉴클레오티드의 과다수치에 의해 나타난다.DNA 손상 반응 신호는 리보뉴클레오티드를 복제하기 어려운 영역이나 다른 유해한 병변 근처에 통합함으로써 활성화된다.그들은 또한 염색체 재배열을 발견했다: DNA 파괴는 복제 포크 붕괴 또는 반대되는 DNA 가닥의 RN의 가수 분해에 의해 발생할 수 있다.또한 배아의 DNA 손상 시그널링의 현저한 활성화는 null 배아의 치사성에 기여할 수 있는 p53 매개 증식 억제를 생성할 수 있다.

리보뉴클레오티드는 건강과 질병에서 혼입된다.이전의 연구들은 리보뉴클레오티드의 안정적인 결합이 있는 두 가지 맥락만 보고했습니다: 1) S. 폼베의 디리보뉴클레오티드는 상동 재조합을 시작하는 신호일 수 있습니다.2) mtDNA의 리보뉴클레오티드(Mouse 및 Hela cells.핵 게놈에서의 낮은 수준의 리보뉴클레오티드 혼입은 허용될 수 있다.실제로 비RNaseH2의존성 회복경로에 의해 생성된 이상핵산 기질(아이카디-구티에르 증후군의 감소된 RNaseH2 활성으로 인해)은 선천적 면역반응을 촉진하는 것으로 생각된다.또는 리보뉴클레오티드는 스스로 간섭자 생성을 자극할 수 있는 DNA 손상 반응 신호를 유도할 수 있다.

리보뉴클레오티드는 포유동물 세포에 매우 유해할 수 있어 게놈 불안정성을 일으킬 수 있으며, RNaseH2는 게놈 DNA의 무결성을 확보하기 위한 중요한 효소이다.또한 게놈 DNA에서 리보뉴클레오티드를 제거하는 경로, 리보뉴클레오티드 유도 DNA 손상의 부위 및 성질, 게놈 내 리보뉴클레오티드의 분포에 대한 관심과 관심을 요구한다.이것을 알면, 그것은 게놈 DNA에서 RN의 병리학적, 생리학적 역할에 대한 이해를 얻을 수 있으며, 핵산 구동 자가면역성과 발암성 모두에 중요하다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000136104 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000021932 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c "ribonuclease H2, subunit B". Retrieved 2011-12-04.
  6. ^ Crow YJ, Leitch A, Hayward BE, Garner A, Parmar R, Griffith E, et al. (August 2006). "Mutations in genes encoding ribonuclease H2 subunits cause Aicardi-Goutières syndrome and mimic congenital viral brain infection". Nature Genetics. 38 (8): 910–916. doi:10.1038/ng1842. PMID 16845400. S2CID 8076225.
  7. ^ "Salmonella infection data for Rnaseh2b". Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. ^ "Citrobacter infection data for Rnaseh2b". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  10. ^ Wellcome Trust Sanger Institute의 마우스 리소스 포털.
  11. ^ "International Knockout Mouse Consortium".
  12. ^ "Mouse Genome Informatics".
  13. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, et al. (June 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  14. ^ Dolgin E (June 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–263. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  15. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (January 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  16. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (June 2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
  17. ^ a b Downing SM, Schreiner PA, Kwak YD, Li Y, Shaw TI, Russell HR, McKinnon PJ (December 2021). "Genome instability independent of type I interferon signaling drives neuropathology caused by impaired ribonucleotide excision repair". Neuron. 109 (24): 3962–3979.e6. doi:10.1016/j.neuron.2021.09.040. PMID 34655526.
  18. ^ Reijns MA, Rabe B, Rigby RE, Mill P, Astell KR, Lettice LA, et al. (May 2012). "Enzymatic removal of ribonucleotides from DNA is essential for mammalian genome integrity and development". Cell. 149 (5): 1008–1022. doi:10.1016/j.cell.2012.04.011. PMC 3383994. PMID 22579044.

추가 정보

외부 링크