FARS2

FARS2
사용 가능한 구조
PDB	Ortholog 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	3CMQ, 3HFV, 3TEG, 3TUP
식별자
에일리어스	FARS2, COXPD14, FARS1, HSPC320, PeRS, dJ520B18.2, 페닐알라닐tRNA합성효소2, 미토콘드리아, SPG77, MtPheRS
외부 ID	OMIM: 611592 MGI: 1917205 HomoloGene: 4788 GeneCard: FARS2
유전자 위치(인간)
크르.	6번 염색체(인간)
끝.	5,829,192 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	13번 염색체(쥐)
끝.	36,726,280 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	상완 삼두근; ; 내피 세포; ; 골격근 조직; ; 삼각근; ; 대퇴 사두근; ; 외측 광대근; ; 정자; ; 좌심실; ; 대정맥; ; 심근;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	리가아제활성; 뉴클레오티드 결합; GO:0001948 단백질 결합; 아미노아실tRNA리가수분해효소활성; ATP 결합; tRNA 결합; 페닐알라닌tRNA리가수분해효소활성;
셀룰러 컴포넌트	세포질; 미토콘드리아 매트릭스; 미토콘드리아;
생물학적 과정	tRNA아미노아실화; 단백질생합성; 페닐알라닐tRNA아미노아실화; 단백질 번역용 tRNA 아미노아실화; tRNA 처리;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	10667
	69955
	ENSG00000145982
	ENSMUSG000021420
	O95363
	문제 99M01
	NM_006567; NM_001318872
	NM_001039189; NM_024274
NP_001305801; NP_006558; NP_001361804; NP_001361805; NP_001361806;
	NP_001361807; NP_001361808; NP_001362186; NP_001362187; NP_001362188; NP_001362189
	NP_001034278; NP_077236
	위키데이터
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페닐알라닐-tRNA 합성효소, 미토콘드리아(FARS2)는 사람에게서 FARS2 ^[5]유전자에 의해 암호화되는 효소이다.FARS2에 의해 코드된 이 단백질은 미토콘드리아 단백질 번역에 역할을 하며 미토콘드리아 단백질에 국재화된다.이 유전자의 돌연변이는 Alpers nelephalopathy라고도 알려진 복합산화인산화결핍증 14, 경련성 하반신마비 77, 유아기 유발 간질 및 시토크롬c 산화효소 ^[6]^[7]결핍증과 관련이 있다. 뇌전증

구조.

FARS2는 염색체 6의 p팔 위치 25.1에 위치하며 15개의 엑손이 ^[6]있다.이 유전자는 Class-II 아미노아실-tRNA 합성효소 ^[8]^[9]패밀리의 일원을 암호화한다.FARS2는 원핵 및 진핵 세포질 형태의 (α-β)2 구조와 달리 단일 폴리펩타이드 사슬로 이루어진 미토콘드리아에 국재화된 페닐알라닌-tRNA 합성효소(PheRS)이다.구조 분석 및 촉매 특성은 미토콘드리아 PeRS가 원핵생물 및 진핵생물 ^[6]세포질에서 발견되는 효소와 다른 PeRS 클래스를 구성할 수 있음을 나타낸다.

기능.

아미노아실-tRNA 합성효소는 tRNA에 동족 아미노산을 ^[6]충전하는 효소의 한 종류이다.FARS2는 페닐알라닌으로 tRNA(Phe)를 충전하고 tRNA(Phe)에 m-Tyr(Pe의 산화판)을 직접 부착시키는 촉매 역할을 한다.이것은 미토콘드리아 번역과 리보솜으로의 미스사이클화 tRNA의 전달 그리고 ^[8]^[9]^[10]^[11]단백질로의 ROS 손상 아미노산의 결합을 중요하게 만든다.대체 스플라이싱으로 인해 여러 개의 트랜스크립트 ^[6]변형이 발생합니다.

촉매 활성

ATP + L-페닐알라닌 + tRNA(Phe) = AMP + 2인산 + L-페닐알라닐-tRNA(Phe)^[8]^[9]^[10]^[11]

임상적 의의

FARS2의 돌연변이는 복합산화인산화결핍증 14, 경련성 하반신마비 77, 유아기 간질 및 시토크롬c 산화효소 결핍증과 관련이 있다. 뇌전증복합산화성인산화결핍증 14와 경련성 하반신마비 77은 모두 상염색체 열성이며 Y144C,^[12] I329T,^[11] D391V 및 D142Y를 ^[13]포함한 여러 병원성 변이와 연결되어 있다.복합산화성인산화결핍증 14는 신생아의 전지구적 발달지연, 난치성 발작, 젖산증 및 다중 미토콘드리아 호흡효소의 결핍을 특징으로 한다.한편 경련성 하반신마비증은 하지의 완만하고 점진적인 약성과 경련이 특징인 신경변성 질환으로 환자는 종종 균형, 다리의 약함과 뻣뻣함, 근육 경련,^[8]^[9] 걸을 때 발끝을 질질 끄는 증상을 보인다.또한 FARS2 Asp325Tyr 미센스 돌연변이로 인한 유아기 수용성 뇌전증 및 시토크롬c 산화효소 결핍증 사례도 보고되었다.초기 발병 뇌전증, 신경학적 결손 및 복합 IV 결핍이 이 ^[7]돌연변이로 인한 질병의 주요 특징이다.

상호 작용

FARS2는 12개의 공복소 상호작용을 포함하여 193개의 이원 단백질-단백질 상호작용을 가진 것으로 나타났다.FARS2는 RCBTB2, KRTAP10-9, CALCOCO2, KRT40, MID2, APPL1, IKZF3, KRT13, TADA2A, STX11, TRIM27, KRTAP10-5, KRTAP10-2 , TF와 상호 작용하는 것으로 보입니다.BEX5, FHL5, MON3, DGAT2L6, ZNF438, KCTD17, ZNF655, BANP, SPERT, NFKBID, ZNF526, PCSK5, DVL3, AJUBA, PPP,

레퍼런스

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^ "193 binary interactions found for search term FARS2". IntAct Molecular Interaction Database. EMBL-EBI. Retrieved 2018-09-05.

추가 정보

Levin I, Kessler N, Moor N, Klipcan L, Koc E, Templeton P, Spremulli L, Safro M (September 2007). "Purification, crystallization and preliminary X-ray characterization of a human mitochondrial phenylalanyl-tRNA synthetase". Acta Crystallographica Section F. 63 (Pt 9): 761–4. doi:10.1107/S1744309107038651. PMC 2376306. PMID 17768348.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (June 2004). "Transcriptome characterization elucidates signaling networks that control human ES cell growth and differentiation". Nature Biotechnology. 22 (6): 707–16. doi:10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N, Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (May 2001). "Creation of genome-wide protein expression libraries using random activation of gene expression". Nature Biotechnology. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (October 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (January 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

외부 링크

핵유전자 부호화 레이 증후군 개요
미토콘드리아 DNA관련 리증후군 및 NARP
PDBe-KB에서 UniProt: O95363(페닐알라닌-tRNA 연결효소, 미토콘드리아)에 대해 PDB에서 사용 가능한 모든 구조 정보의 개요.

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000145982 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000021420 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10329163-5] Bullard JM, Cai YC, Demeler B, Spremulli LL (May 1999). "Expression and characterization of a human mitochondrial phenylalanyl-tRNA synthetase". Journal of Molecular Biology. 288 (4): 567–77. doi:10.1006/jmbi.1999.2708. PMID 10329163.

[entrez-6] "Entrez Gene: FARS2 phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial". 이 문서에는 퍼블릭 도메인에 있는 이 소스로부터의 텍스트가 포함되어 있습니다..

[:1-7] Almalki A, Alston CL, Parker A, Simonic I, Mehta SG, He L, Reza M, Oliveira JM, Lightowlers RN, McFarland R, Taylor RW, Chrzanowska-Lightowlers ZM (January 2014). "Mutation of the human mitochondrial phenylalanine-tRNA synthetase causes infantile-onset epilepsy and cytochrome c oxidase deficiency". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease. 1842 (1): 56–64. doi:10.1016/j.bbadis.2013.10.008. PMC 3898479. PMID 24161539.

[:2-8] "FARS2 - Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial precursor - Homo sapiens (Human) - FARS2 gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2018-09-05. 이 문서에는 CC BY 4.0 라이센스로 제공되는 텍스트가 포함되어 있습니다.

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[:3-10] Klipcan L, Moor N, Kessler N, Safro MG (July 2009). "Eukaryotic cytosolic and mitochondrial phenylalanyl-tRNA synthetases catalyze the charging of tRNA with the meta-tyrosine". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (27): 11045–8. Bibcode:2009PNAS..10611045K. doi:10.1073/pnas.0905212106. PMC 2700156. PMID 19549855.

[:4-11] Elo JM, Yadavalli SS, Euro L, Isohanni P, Götz A, Carroll CJ, Valanne L, Alkuraya FS, Uusimaa J, Paetau A, Caruso EM, Pihko H, Ibba M, Tyynismaa H, Suomalainen A (October 2012). "Mitochondrial phenylalanyl-tRNA synthetase mutations underlie fatal infantile Alpers encephalopathy". Human Molecular Genetics. 21 (20): 4521–9. doi:10.1093/hmg/dds294. PMID 22833457.

[12] Shamseldin HE, Alshammari M, Al-Sheddi T, Salih MA, Alkhalidi H, Kentab A, Repetto GM, Hashem M, Alkuraya FS (April 2012). "Genomic analysis of mitochondrial diseases in a consanguineous population reveals novel candidate disease genes". Journal of Medical Genetics. 49 (4): 234–41. doi:10.1136/jmedgenet-2012-100836. PMID 22499341. S2CID 5856138.

[13] Yang Y, Liu W, Fang Z, Shi J, Che F, He C, Yao L, Wang E, Wu Y (February 2016). "A Newly Identified Missense Mutation in FARS2 Causes Autosomal-Recessive Spastic Paraplegia". Human Mutation. 37 (2): 165–9. doi:10.1002/humu.22930. PMID 26553276. S2CID 46241711.

[14] "193 binary interactions found for search term FARS2". IntAct Molecular Interaction Database. EMBL-EBI. Retrieved 2018-09-05.

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