매크로 모델
MacroModel| 개발자 | 슈뢰딩거, LLC |
|---|---|
| 초기 릴리즈 | 전( |
| 안정된 릴리스 | 2021-3 |
| 운영 체제 | Linux, Windows, MacOS |
| 플랫폼 | x64, GPGPU |
| 이용가능기간: | 영어 |
| 유형 | 계산화학 |
| 면허증. | 독자 사양의 상용 소프트웨어 |
| 웹 사이트 | www |
MacroModel은 유기화합물과 생체고분자의 분자모델링을 위한 컴퓨터 프로그램입니다.이것은 다양한 화학력장과 더불어 [1]분자의 기하학적 구조와 상대적 배향 에너지를 예측하기 위한 에너지 최소화 알고리즘을 특징으로 합니다.MacroModel은 Schredinger, LLC에 의해 관리되고 있습니다.
분자역학이라고도 불리는 고전역학의 틀에서 시뮬레이션을 수행하고 확률역학 및 혼합 몬테카를로 알고리즘을 사용하여 유한 온도에서 시스템을 모델링하기 위해 분자역학 시뮬레이션을 수행할 수 있습니다.MacroModel은 Windows, Linux, macOS, SGI(Silicon Graphics) IRIX 및 IBM AIX를 지원합니다.
Macromodel 소프트웨어 패키지는 1990년에 [2]과학 문헌에 처음 기술되었으며,[3] 2000년에 Schredinger, Inc.에 인수되었습니다.
주요 기능
기존 버전 이력
- 2013: 버전 10.0
- 2012: 버전 9.9.2
- 2011: 버전 9.9.1
- 2010: 버전 9.8
- 2009: 버전 9.7
- 2008: 버전 9.6
- 2007: 버전 9.5
- 2006: 버전 9.1
- 2005: 버전 9.0
- 2004: 버전 8.5
- 2003: 버전 8.1
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Mohamadi F, Richard NG, Guida WC, Liskamp R, Lipton M, Caufield C, Chang G, Hendrickson T, Still WC (May 1990). "MacroModel - an Integrated Software System for Modeling Organic and Bioorganic Molecules Using Molecular Mechanics". J. Comput. Chem. 11 (4): 440–467. doi:10.1002/jcc.540110405.
- ^ Mohamadi, Fariborz; Richards, Nigel G. J.; Guida, Wayne C.; Liskamp, Rob; Lipton, Mark; Caufield, Craig; Chang, George; Hendrickson, Thomas; Still, W. Clark (1990-05-01). "Macromodel—an integrated software system for modeling organic and bioorganic molecules using molecular mechanics". Journal of Computational Chemistry. 11 (4): 440–467. doi:10.1002/jcc.540110405. ISSN 1096-987X.
- ^ "Overview Schrödinger". www.schrodinger.com. Retrieved 2017-11-30.
- ^ Still WC, Tempczyk A, Hawley RC, Hendrickson T (1990). "Semianalytical treatment of solvation for molecular mechanics and dynamics". J Am Chem Soc. 112 (16): 6127–6129. doi:10.1021/ja00172a038.
- ^ Guimarães CR, Cardozo M (May 2008). "MM-GB/SA rescoring of docking poses in structure-based lead optimization". J Chem Inf Model. 48 (5): 958–70. doi:10.1021/ci800004w. PMID 18422307.
