소핵 RNA SNORD18
Small nucleolar RNA SNORD18| 소핵 RNA SNORD18 | |
|---|---|
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| 식별자 | |
| 기호 | SNORD18 |
| Alt. 기호 | U18 |
| Rfam | RF00093 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | Gene; snRNA; snoRNA; CD-box |
| 도메인 | 에우카리오타 |
| 바둑 | GO:0006396 GO:0005730 |
| 그렇게 | SO:0000593 |
| PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 SNORD18(U18이라고도 함)은 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 수정에서 기능하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 위치한다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.
U18은 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1]
인간과 Xenopus laevis에는 리보솜 단백질 L1의 인트로 인코딩된 U18(U18A, U18B, U18C라고 한다)의 세 가지 밀접하게 관련된 복사본이 있다.[2]효모에서 U18은 EF1-베타(EF1-베타)의 인트론에 위치한다.아라비도피스탈리아나 쌀오리자사티바의 관련 snoRNA는 각각 R63과 Z106으로 명명됐다.전자적 snoRNA의 처리에 관련된 요소들이 최근에 해명되었다.[3]
참조
- ^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (October 2002). "Purified Box C/D snoRNPs Are Able to Reproduce Site-Specific 2'-O-Methylation of Target RNA in Vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Prislei S, Michienzi A, Presutti C, Fragapane P, Bozzoni I (1993). "Two different snoRNAs are encoded in introns of amphibian and human L1 ribosomal protein genes". Nucleic Acids Res. 21 (25): 5824–30. doi:10.1093/nar/21.25.5824. PMC 310460. PMID 7507233.
- ^ Giorgi C, Fatica A, Nagel R, Bozzoni I (2001). "Release of U18 snoRNA from its host intron requires interaction of Nop1p with the Rnt1p endonuclease". EMBO J. 20 (23): 6856–65. doi:10.1093/emboj/20.23.6856. PMC 125767. PMID 11726521.
외부 링크
