소핵 RNA SNORD50
Small nucleolar RNA SNORD50소핵 RNA SNORD50 | |
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식별자 | |
기호 | SNORD50 |
Alt. 기호 | U50 |
Rfam | RF00278 |
기타자료 | |
RNA형 | Gene; snRNA; snoRNA; CD-box |
도메인 | 에우카리오타 |
바둑 | GO:0006396 GO:0005730 |
그렇게 | SO:0000593 |
PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 snoRNA U50(SNORD50이라고도 함)은 다른 작은 핵 RNA(snRNA)의 수정에서 기능하는 비코딩 RNA(ncRNA) 분자다.이러한 유형의 수정 RNA는 보통 snRNA 생물 발생의 주요 부위인 진핵 세포의 핵에 있다.소핵 RNA(snoRNA)로 알려져 있으며, 가이드 RNA라고도 한다.
snoRNA U50은 C 박스(UGUGAUGA)와 D 박스(CUAGA)로 알려진 보존 시퀀스 모티브를 포함하는 snoRNA의 C/D 박스 등급에 속한다.박스 C/D 계열의 대부분의 구성원은 기질 RNA의 현장 고유 2'-O-메틸화를 지시하는 기능을 한다.[1][2]
U50은 염색체 변환 t(3;6) (q27;q15)의 중단점에서 6q15 염색체에 위치한 전자적 snoRNA 유전자다.U50HG 유전자는 6개의 엑손으로 구성되어 있는데, 이 엑손의 분할된 성분은 단백질을 코딩할 가능성이 거의 없으며, 인트론은 뉴클레오리로 국부화된 U50과 U50 유사(U50')의 snoRNA를 모두 생산한다.[3]U50 파라과이가 암의 종양 발생과 치료에 대한 민감성을 조절하는 새로운 유전자 집단을 형성한다는 증거가 있다.[4][5]
참조
- ^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (October 2002). "Purified Box C/D snoRNPs Are Able to Reproduce Site-Specific 2'-O-Methylation of Target RNA in Vitro". Molecular and Cellular Biology. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-Laszlo, Z; Henry Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Kiss T (1996). "Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs". Cell. 85 (7): 1077–1088. doi:10.1016/S0092-8674(00)81308-2. PMID 8674114. S2CID 10418885.
- ^ Tanaka, R; Satoh H; Moriyama M; Satoh K; Morishita Y; Yoshida S; Watanabe T; Nakamura Y; Mori S (2000). "Intronic U50 small-nucleolar-RNA (snoRNA) host gene of no protein-coding potential is mapped at the chromosome breakpoint t(3;6)(q27;q15) of human B-cell lymphoma". Genes Cells. 5 (4): 277–287. doi:10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x. PMID 10792466.
- ^ Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (October 2008). "GAS5, a non-protein-coding RNA, controls apoptosis and is downregulated in breast cancer". Oncogene. 28 (2): 195–208. doi:10.1038/onc.2008.373. PMID 18836484.
- ^ Dong XY, Guo P, Boyd J, et al. (August 2009). "Implication of snoRNA U50 in human breast cancer". J Genet Genomics. 36 (8): 447–54. doi:10.1016/S1673-8527(08)60134-4. PMC 2854654. PMID 19683667.
외부 링크