FYVE 도메인
FYVE domainFYVE 아연 핑거 | |||||||||
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식별자 | |||||||||
기호. | 회계연도 | ||||||||
팜 | PF01363 | ||||||||
인터프로 | IPR000306 | ||||||||
프로 사이트 | PDOC50178 | ||||||||
SCOP2 | 1 vfy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
OPM 슈퍼 패밀리 | 59 | ||||||||
OPM단백질 | 1평방식의 | ||||||||
CDD | cd00065 | ||||||||
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분자생물학에서 FYVE 아연 핑거 도메인은 시스테인이 풍부한 4가지 단백질의 이름을 따서 명명되었다.Fab 1(PIKfyve의 효모 직교), YOTB, Vac 1(소체 수송 단백질), EEA1.FYVE 도메인은 포스파티딜이노시톨 3-인산을 [2]금속 이온 배위 및 염기성 아미노산에 의존하는 방식으로 결합한다.FYVE 도메인은 pH 의존적인 [3]방식으로 세포막에 삽입됩니다.FYVE 도메인은 액포 단백질 선별 및 엔도솜 [4]기능과 연결되어 있습니다.
구조.
FYVE 도메인은 두 개의 작은 베타 헤어핀(또는 아연 너클)과 알파 [5]나선으로 구성됩니다.FYVE 핑거는 2개의 아연 이온을 결합합니다.FYVE 핑거는 8개의 잠재적 아연 좌표 시스테인 위치를 가지며 시스테인 주위에 염기성 아미노산이 있는 것이 특징이다.이 패밀리의 많은 구성원은 시퀀스 모티브에 두 개의 히스티딘을 포함합니다.
FYVE 핑거는 구조적으로 RING 도메인 및 PHD 핑거와 유사합니다.
예
다음은 이 도메인을 포함하는 인간 단백질 목록입니다.
- ANKFY1, EEA1, FGD1, FGD2, FGD3, FGD4, FGD5, FGD6, FYCO1, HGS, MTM3, MMR4, PIKFYVE, PLEKHF1, PLEKHF2 PLKHF1
- RUFY1, RUFY2, WDFY1, WDFY2, WDFY3, ZFYVE1, ZFYVE16, ZFYVE19, ZFYVE20, ZFYVE21, ZFYVE1,
레퍼런스
- ^ Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (November 2001). "Multivalent endosome targeting by homodimeric EEA1". Mol. Cell. 8 (5): 947–58. doi:10.1016/S1097-2765(01)00385-9. PMID 11741531.
- ^ Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (July 1998). "FYVE fingers bind PtdIns(3)P". Nature. 394 (6692): 432–3. doi:10.1038/28767. PMID 9697764. S2CID 4385768.
- ^ He J, Vora M, Haney RM, et al. (September 2009). "Membrane insertion of the FYVE domain is modulated by pH". Proteins. 76 (4): 852–60. doi:10.1002/prot.22392. PMC 2909462. PMID 19296456.
- ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (April 1999). "Signalling through phosphoinositide 3-kinases: the lipids take centre stage". Curr. Opin. Cell Biol. 11 (2): 219–25. doi:10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156.
- ^ Misra S, Hurley JH (May 1999). "Crystal structure of a phosphatidylinositol 3-phosphate-specific membrane-targeting motif, the FYVE domain of Vps27p". Cell. 97 (5): 657–66. doi:10.1016/S0092-8674(00)80776-X. PMID 10367894. S2CID 15448444.
추가 정보
- Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (September 1996). "Endosomal localization of the autoantigen EEA1 is mediated by a zinc-binding FYVE finger". J. Biol. Chem. 271 (39): 24048–54. doi:10.1074/jbc.271.39.24048. PMID 8798641.
- Stenmark H, Aasland R (December 1999). "FYVE-finger proteins--effectors of an inositol lipid". J. Cell Sci. 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636.