FYVE 도메인

FYVE domain
FYVE 아연 핑거
1joc.png
지질에 [1]의한 조기 엔도솜 항원 1(EEA1) 이합체.
식별자
기호.회계연도
PF01363
인터프로IPR000306
프로 사이트PDOC50178
SCOP21 vfy / SCOPe / SUPFAM
OPM 슈퍼 패밀리59
OPM단백질1평방식의
CDDcd00065

분자생물학에서 FYVE 아연 핑거 도메인은 시스테인이 풍부한 4가지 단백질의 이름을 따서 명명되었다.Fab 1(PIKfyve의 효모 직교), YOTB, Vac 1(소체 수송 단백질), EEA1.FYVE 도메인은 포스파티딜이노시톨 3-인산[2]금속 이온 배위 및 염기성 아미노산에 의존하는 방식으로 결합한다.FYVE 도메인은 pH 의존적인 [3]방식으로 세포막에 삽입됩니다.FYVE 도메인은 액포 단백질 선별 및 엔도솜 [4]기능과 연결되어 있습니다.

구조.

FYVE 도메인은 두 개의 작은 베타 헤어핀(또는 아연 너클)과 알파 [5]나선으로 구성됩니다.FYVE 핑거는 2개의 아연 이온을 결합합니다.FYVE 핑거는 8개의 잠재적 아연 좌표 시스테인 위치를 가지며 시스테인 주위에 염기성 아미노산이 있는 것이 특징이다.이 패밀리의 많은 구성원은 시퀀스 모티브에 두 개의 히스티딘을 포함합니다.

R+HHC+XCG. 여기서 +는 대전 잔류물을 나타내고 X는 잔류물을 나타냅니다.

FYVE 핑거는 구조적으로 RING 도메인 PHD 핑거와 유사합니다.

다음은 이 도메인을 포함하는 인간 단백질 목록입니다.

레퍼런스

  1. ^ Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (November 2001). "Multivalent endosome targeting by homodimeric EEA1". Mol. Cell. 8 (5): 947–58. doi:10.1016/S1097-2765(01)00385-9. PMID 11741531.
  2. ^ Gaullier JM, Simonsen A, D'Arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (July 1998). "FYVE fingers bind PtdIns(3)P". Nature. 394 (6692): 432–3. doi:10.1038/28767. PMID 9697764. S2CID 4385768.
  3. ^ He J, Vora M, Haney RM, et al. (September 2009). "Membrane insertion of the FYVE domain is modulated by pH". Proteins. 76 (4): 852–60. doi:10.1002/prot.22392. PMC 2909462. PMID 19296456.
  4. ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (April 1999). "Signalling through phosphoinositide 3-kinases: the lipids take centre stage". Curr. Opin. Cell Biol. 11 (2): 219–25. doi:10.1016/S0955-0674(99)80029-5. PMID 10209156.
  5. ^ Misra S, Hurley JH (May 1999). "Crystal structure of a phosphatidylinositol 3-phosphate-specific membrane-targeting motif, the FYVE domain of Vps27p". Cell. 97 (5): 657–66. doi:10.1016/S0092-8674(00)80776-X. PMID 10367894. S2CID 15448444.

추가 정보