하이드로박테리아

Hydrobacteria
하이드로박테리아
EscherichiaColi NIAID.jpg
대장균 세포 25,000배 확대
과학적 분류
도메인:
(순위 미지정):
하이드로박테리아

Battistuzi and Hedges[1] 2009
슈퍼필라/필라

산성박테리오타속
아키피코타
브델로비브리오노타
캄필로박테로타
딜리베카테로타
의존 관계
데술포박테로타
데술푸로모나도타
엘루심미크바이오타
FCB 초문
점액구균류
니트로스피로타
프로테오박테리아
PVC 초문
스피로채토타

하이드로박테리아원핵생물 종의 약 3분의 1을 포함하는 분류군으로, 대부분 그램 음성 박테리아와 그 [1]친척들이다.그것은 훨씬 더 큰 [2][1]박테리아 그룹테라박테리아와 가장 가까운 친척으로 밝혀졌는데, 테라박테리아는 대부분 그램 양성 박테리아이다.하이드로박테리아(hydrobacteria, hydro = "물")라는 이름은 이러한 종들의 공통 조상으로 추정되는 습한 환경을 의미한다.이와는 대조적으로 테라박테리아 [2][1]종은 육지에서의 생활에 적응을 하고 있다.

하이드로박테리아의 함량은 슈퍼필라, 아퀴피코타, 브델로비브리오노타, 캄필로박테라, 딜리박테라, 데술포박테라, 데술로모나도타, 엘루시미크바이오보타, FCBocota, 니트포카테라, 미오카테라 등 슈퍼필라 및 필라로박테라까지 성장했습니다.

일부 뿌리 없는 분자 계통학[5][6] 분석에서는 테라박테리아와 하이드로박테리아라는 이분법이 뒷받침되지 않았지만,[3] 나무의 뿌리에 초점을 맞춘 것을 포함한 가장 [3][4]최근의 게놈 분석에서는 이 두 그룹이 단일통학이라는 것이 밝혀졌습니다.

Hydrobacteria과 테라 박테리아 약 3억년 전에 달라져야 할 필요가 없땅(대륙)원핵 생물들에 의해 그 당시 식민지화해 왔음을 시사해 냈다.[1]함께, Hydrobacteria과 테라 박테리아, 그리고 분류 군 Selabacteria에, 그들의 광영 양 생물의. 능력(selas) 가벼운)에 암시에 놓이는 원핵 생물의 97%박테리아와 종들 2009년까지 알려진 99%를 포함하는 큰 그룹을 형성한다.[7]현재 Hydrobacteria+테라 박테리아의 외부에 있는 세균 phyla며, 따라서 분류 군 Selabacteria을 정당화, 그리고 Fusobacteria을 포함하지 않을 수 있을지가 논란이 되고 있다.[3][4]

1978년 기븐스와 [8]머레이가 기술한 그라실리쿠테스는 때로 하이드로박테리아 대신 사용된다.그러나 "그라실리쿠테스"는 시아노박테리아(Terabacteria)를 포함했고, 현재는 일반적으로 받아들여지고 있는 3도메인 [8]체계로는 구축되지 않았다.최근에는 "Gracilicutes"의 재정의가 제안되었지만[9] 분자 계통학이나 통계 분석은 포함되지 않았다.또한, 진핵생물+고세균의 혈통은 어떤 분자 계통 발생학에서도 지원되지 않는 나무인 방선균의 가까운 친척으로서 박테리아 내에 내포되어 있다고 주장하면서, 3개의 도메인 시스템을 따르지 않았다.

계통발생학

A timetree redrawn showing the division of Hydrobacteria and Terrabacteria.
Battistuzi and Hedges(2009)에서 수정한 시간표는 하이드로박테리아와 테라박테리아의 [2][1]구분을 보여준다.

Hydrobacteria와 Terabacteria라는 두 가지 주요 분류의 정의는 주로 [2][1][3][4]게놈의 뿌리깊은 계통학적 분석에서 비롯되었다.뿌리 깊은 분석이 이 [6][5]분열을 완전히 뒷받침하지 못하여 생명의 뿌리 깊은 나무의 중요성에 관심이 모아지고 있다.

박테리아 계통발생의 최근 두 가지 분석은 모두 하이드로박테리아와 테라박테리아 [3][4]분열을 뒷받침했다.하지만, 그들은 세포벽의 진화를 다르게 해석했는데, 하나는 박테리아의 마지막 공통 조상이 단배엽(그램 양성[3] 박테리아)이고 다른 하나는 디뎀(그램 음성[4] 박테리아)이라고 결론지었다.다음 나무는 최근 [3]두 가지 연구 중 하나에서 추출한 것으로, Fusobacteria의 위치는 분해되지 않고 DST는 Terabacteria의 가장 가까운 친척인 세균 Phyla와 Superphyla의 계통 발생을 보여준다.

Coleman et al. (2021)[3]에 따른 세균성 필라 및 슈퍼필라의 계통발생.하이드로박테리아는 그 연구에서 "그라실리쿠테스"로 언급되었다.

레퍼런스

  1. ^ a b c d e f g Battistuzzi, F. U.; Hedges, S. B. (1 February 2009). "A Major Clade of Prokaryotes with Ancient Adaptations to Life on Land". Molecular Biology and Evolution. 26 (2): 335–343. doi:10.1093/molbev/msn247. PMID 18988685.
  2. ^ a b c d Battistuzzi, Fabia U; Feijao, Andreia; Hedges, S Blair (2004). "A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land". BMC Evolutionary Biology. 4 (1): 44. doi:10.1186/1471-2148-4-44. PMC 533871. PMID 15535883.
  3. ^ a b c d e f g h i Coleman, Gareth A.; Davín, Adrián A.; Mahendrarajah, Tara A.; Szánthó, Lénárd L.; Spang, Anja; Hugenholtz, Philip; Szöllősi, Gergely J.; Williams, Tom A. (7 May 2021). "A rooted phylogeny resolves early bacterial evolution". Science. 372 (6542): eabe0511. doi:10.1126/science.abe0511. PMID 33958449. S2CID 233872903.
  4. ^ a b c d e f Léonard, Raphaël R.; Sauvage, Eric; Lupo, Valérian; Perrin, Amandine; Sirjacobs, Damien; Charlier, Paulette; Kerff, Frédéric; Baurain, Denis (18 February 2022). "Was the Last Bacterial Common Ancestor a Monoderm after All?". Genes. 13 (2): 376. doi:10.3390/genes13020376. PMC 8871954. PMID 35205421.
  5. ^ a b Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. (May 2016). "A new view of the tree of life". Nature Microbiology. 1 (5): 16048. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48. PMID 27572647. S2CID 3833474.
  6. ^ a b Zhu, Qiyun; Mai, Uyen; Pfeiffer, Wayne; Janssen, Stefan; Asnicar, Francesco; Sanders, Jon G.; Belda-Ferre, Pedro; Al-Ghalith, Gabriel A.; Kopylova, Evguenia; McDonald, Daniel; Kosciolek, Tomasz; Yin, John B.; Huang, Shi; Salam, Nimaichand; Jiao, Jian-Yu; Wu, Zijun; Xu, Zhenjiang Z.; Cantrell, Kalen; Yang, Yimeng; Sayyari, Erfan; Rabiee, Maryam; Morton, James T.; Podell, Sheila; Knights, Dan; Li, Wen-Jun; Huttenhower, Curtis; Segata, Nicola; Smarr, Larry; Mirarab, Siavash; Knight, Rob (December 2019). "Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea". Nature Communications. 10 (1): 5477. Bibcode:2019NatCo..10.5477Z. doi:10.1038/s41467-019-13443-4. PMC 6889312. PMID 31792218.
  7. ^ Battistuzzi, FU; Hedges, SB (2009). "Eubacteria". In Hedges, SB; Kumar, S (eds.). The Timetree of Life. New York: Oxford University Press. pp. 106–115.
  8. ^ a b Gibbons, N. E.; Murray, R. G. E. (1 January 1978). "Proposals Concerning the Higher Taxa of Bacteria". International Journal of Systematic Bacteriology. 28 (1): 1–6. doi:10.1099/00207713-28-1-1.
  9. ^ Cavalier-Smith, Thomas (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biology Direct. 1 (1): 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC 1586193. PMID 16834776.