산성박테리오타속

Acidobacteriota
산성박테리오타속
Acidobacterium.jpg
아세도박테륨 cf. capsulatum
과학적 분류 e
도메인: 박테리아
문: 산성박테리오타속
스래시 앤 코트[1] 2021
표준속
산성박테륨
기시모토 외 1991년
클래스[3]
동의어
  • "Acidobaceria" Thrash and Coates[4] 2010
  • "Acidobacteraeota" 오렌 외 2015
  • "Acidobacteriota" 휘트먼 외 2018년

산성박테리오타는 그람음성세균의 문이다.그 구성원들은 생리적으로 다양하고, 특히 토양에 흔하지만,[5][6][7] 문화에서는 충분히 대표되지 않는다.

묘사

이 문의 구성원은 생리학적으로 다양하며 토양, [8]부패하는 목재, 온천, 해양, 동굴, 금속에 오염된 [9]토양 등 다양한 환경에서 발견된다.이 문(문)의 구성원은 특히 전체 박테리아 [10]군집의 52%를 차지하는 토양 서식지에 풍부하다.pH와 영양소와 같은 환경적 요인들이 산성박테리오타 [11][12][13]역학을 촉진하는 것으로 나타났다.많은 산도박테리오타는 호산성인데, 여기에는 최초로 기술된 문인 산도박테륨 [14]캡술라툼이 포함된다.

다른 주목할 만한 종으로는 Holophaga foetida,[15] Geothrix fermentans,[16] Acanthopleuribacter pedis[17], Bryobacter [18]aggregatus 등이 있다.이들은 최근에야 발견됐고 대부분 배양되지 않아 생태와 신진대사가 제대로 [6]파악되지 않고 있다.하지만,[19] 이 박테리아들은 특히 토양에 풍부하기 때문에 생태계에 중요한 기여를 할 수 있다.1, 4, 6번 구역의 구성원은 [20]특히 토양에 풍부한 것으로 밝혀졌다.

자연 토양 서식지뿐만 아니라, 미분류 2인 산성박테리오타도 DNA 추출 키트 시약의 오염물질로 확인되었으며, 이로 인해 마이크로바이오타 또는 메타게노믹 [21]데이터 세트에 잘못 나타날 수 있다.

서브섹션 1의 구성원은 낮은 [22][11]pH 조건에서 지배적인 것으로 밝혀졌다.또한 산성 광산 배출의 산성 박테리오타는 잠재적으로 세포 분화와 효소 안정성 [11]때문에 [23]토양에서의 산성 박테리오타에 비해 산성 pH 조건(pH 2-3)에 더 잘 적응하는 것으로 밝혀졌다.

Acidobacteria 게놈의 G+C 함량은 세분류 내에서 일관된다. 즉, V그룹 단편의 경우 60%, III그룹 [6]단편의 경우 약 10% 낮다.

산도박테리오타의 대부분은 [24][25]곡예비행으로 여겨진다.제8과[16] [26]제23과에는 혐기성 균으로 간주되는 산도박테리오타가 있다.토양에서 유래한 Acidobacteriota의 일부 변종은 대기 및 대기 중 [25]농도에서 산소를 호흡할 수 있는 게놈 잠재력을 가지고 있는 것으로 밝혀졌다.

산성박테리오타 문(Acidobacteriota phylam)의 구성원들은 낮은 유기탄소 환경에서 [11]높은 함량 때문에 영양부족 박테리아로 여겨져 왔다.그러나, 이 문(문)의 변화는 그들이 같은 [11]생태학적 전략을 가지고 있지 않을 수도 있다는 것을 나타낼 수 있다.

역사

이 문중의 첫 번째 종인 Acidobacterium capsulatum은 [27]1991년에 발견되었다.그러나,[14] 산도박테리오타는 1997년까지 뚜렷한 분지군으로 인식되지 않았고,[28] 2012년까지 문으로 인식되지 않았다.첫 번째 게놈은 [29]2006년에 배열되었다.

대사

카본

서브섹션 1의 일부 구성원은 [11]탄소원으로서 D-포도당, D-xylos, 유당을 사용할 수 있지만 푸코스나 소르보스를 [30]사용할 수 없다.서브섹션 1의 구성원은 또한 [11]당분 분해에 사용되는 갈락토시다아제 등의 효소를 포함한다.소분류 4의 구성원들은 키틴을 탄소원으로 [31][32][11]사용하는 것으로 밝혀졌다.

질소

Acidobacteriota가 질화, 탈질 또는 질소 [11]고정과 같은 질소 순환 과정에 관여한다는 명확한 증거는 없다.그러나 지오트릭스 페르만탄은 질산염을 감소시킬 수 있고 norB [11]유전자를 포함하고 있는 것으로 나타났다.NorB 유전자는 Koribacter verstailis와 Solibacter [33][11]usitatus에서도 확인되었다.또한 서브섹션 1의 멤버에서 nirA [11]유전자의 존재가 관찰되었다.또한 지금까지 모든 게놈은 암모늄 채널 트랜스포터 패밀리 [25][11]유전자를 통해 암모늄을 직접 흡수하는 것으로 기술되어 왔다.산성박테리오타는 무기질소와 유기질소를 질소원으로 사용할 수 있다.

계통발생학

현재 승인된 분류법은 명명법에 있는[3] 원핵생물 이름 목록을 기반으로 하며, 계통 발생은 16S rRNA [34]염기서열을 기반으로 한다.번호가 매겨진 계급에는 아직 교양있는 대표가 없다.

산성박테리오타속

'아시도박테리아'

블라스토 위성

클래스 1-2

클래스 6-1

클래스 1-3

클래스 6-2

클래스 1~4

비시나미박테리아

클래스 1~6

홀로파게과

클래스 1~10

클래스 4-1

테르모아나에로바큘리아

클래스 4-3

클래스 1~11

칸디다투스 아미니케난테스

칸디다투스 피셔박테리아

니트로스피로타(아웃그룹)

레퍼런스

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외부 링크