lin-4 마이크로RNA 전구체

lin-4 microRNA precursor
lin-4 마이크로RNA 전구체
RF00052.jpg
lin-4의 예측된 2차 구조 및 시퀀스 보존
식별자
기호.4라인
RfamRF00052
miRBaseMI00002
miRBase 패밀리MIPF0000303
기타 데이터
RNA형진; miRNA
도메인진핵생물
가세요GO:0035195 GO:0035068
그렇게소:0001244
PDB 구조PDBe

분자생물학에서 line-4는 선충류(Caenorhabditis elegans)[1][2]의 발생 시기 연구에서 확인된 마이크로RNA(miRNA)이다.유전자 [3]조절에 관여하는 비부호화 RNA의 일종인 miRNA 중 최초로 발견된 miRNA. miRNA는 약 70개의 뉴클레오티드 전구체로 전사되고 이후 Dicer 효소에 의해 처리되어 21개의 뉴클레오티드 생성물이 생성되었다.헤어핀 전구체의 익스텐트는 일반적으로 알려져 있지 않으며 헤어핀 예측에 기초하여 추정됩니다.제품은 mRNA에 대한 완전 또는 부분적 보완성을 통해 규제 역할을 하는 것으로 생각됩니다.lin-4 유전자는 별도의 숙주 유전자의 4.11kb 인트론 안에 있는 것으로 밝혀졌다([1] 참조).

문자 변환

lin-4는 자율 miRNA 촉진제로부터 전사되며, 배란 후 발달의 L2 단계에서 lin-4 miRNA 축적이 일어나면서 발달적으로 조절된다.이것에 추가 내인성 lin-4 1차 성적 증명서의lin-4 성숙한 형태의 용모에 대해 그 up-regulation 있다.[4]lin-4 염색체 II에 씨 선충류에lin-14 mRNA의 3'비해석 부위(UTR), 이 상호 보완적인 내신 9뉴클레오티드 코어와 함께 7바인딩 사이트를 배열에 보완적 발견된다.CUCAGGAA 요소lin-4:lin-14 듀플렉스는 비정상적인 꼬임 구조를 가지고 있는 것으로 보입니다.이는 베이스 [4]쌍의 불일치로 인해 홈 치수와 베이스 스태킹의 변화가 유발되기 때문입니다.이 lin-4:lin-14 쌍은 [5]발달의 수정과 관련하여 C. elegans의 IGF-1 경로에 연결되어 있다.

발달상의 영향

lin-4는 C. elegans에서 발육 사건의 유충 단계의 시작을 지시하는 역할을 한다.lin-4 기능 상실(lf) 돌연변이는 초기 단계부터 후기의 유충 단계까지 발달 운명의 결과적 지연을 본다.그 결과 외음부 및 성인 큐티클과 [1]같은 구조의 상실을 수반하는 헤테로크로닉 발달 패턴이 포함된다.lin-4는 lin-14의[6][7] 음의 조절제 역할을 하며 LIN-14 [8]단백질의 축적을 억제한다.또한 lin-28을 표적으로 하고 번역 [9]억제를 통해 단백질 발현을 감소시킨다.line-4와 대상 In 사이에 있는 염기쌍은 두 개의 짧은 [10]나선형으로 구성된 불연속적이다.

레퍼런스

  1. ^ a b Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V (1993). "The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14". Cell. 75 (5): 843–854. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-Y. PMID 8252621.
  2. ^ Rougvie, AE (2001). "Control of developmental timing in animals". Nat Rev Genet. 2 (9): 690–701. doi:10.1038/35088566. PMID 11533718.
  3. ^ Ambros, V (2001). "microRNAs: tiny regulators with great potential". Cell. 107 (7): 823–826. doi:10.1016/S0092-8674(01)00616-X. PMID 11779458.
  4. ^ a b Balasubramanian C, Ojha RP, Maiti S, Desideri A (2010). "Sampling the structure of the noncanonical lin-4:lin-14 microRNA:mRNA complex by molecular dynamics simulations". J Phys Chem B. 114 (49): 16443–9. doi:10.1021/jp104193r. PMID 21090710.
  5. ^ Boehm M, Slack F (2005). "A developmental timing microRNA and its target regulate life span in C. elegans". Science. 310 (5756): 1954–7. doi:10.1126/science.1115596. PMID 16373574.
  6. ^ Ambros V, Horvitz HR (1987). "The lin-14 locus of Caenorhabditis elegans controls the time of expression of specific postembryonic developmental events". Genes Dev. 1 (4): 398–414. doi:10.1101/gad.1.4.398. PMID 3678829.
  7. ^ Ambros V (1989). "A hierarchy of regulatory genes controls a larva-to-adult developmental switch in C. elegans". Cell. 57 (1): 49–57. doi:10.1016/0092-8674(89)90171-2. PMID 2702689.
  8. ^ Olsen PH, Ambros V (1999). "The lin-4 regulatory RNA controls developmental timing in Caenorhabditis elegans by blocking LIN-14 protein synthesis after the initiation of translation". Dev Biol. 216 (2): 671–80. doi:10.1006/dbio.1999.9523. PMID 10642801.
  9. ^ Bagga S, Bracht J, Hunter S, Massirer K, Holtz J, Eachus R, et al. (2005). "Regulation by let-7 and lin-4 miRNAs results in target mRNA degradation". Cell. 122 (4): 553–63. doi:10.1016/j.cell.2005.07.031. PMID 16122423.
  10. ^ Ambros V (2001). "microRNAs: tiny regulators with great potential". Cell. 107 (7): 823–6. doi:10.1016/S0092-8674(01)00616-X. PMID 11779458.

외부 링크