miR-137
miR-137| miR-137 | |
|---|---|
 miR-137 마이크로RNA 2차 구조 및 배열 보존 | |
| 식별자 | |
| 기호. | 미르-137 |
| Rfam | RF00694 |
| miRBase 패밀리 | MIPF0000106 |
| 엔씨비 진 | 406928 |
| HGNC | 31523 |
| 기타 데이터 | |
| RNA형 | 마이크로RNA |
| 도메인 | 진핵생물; 메타조아; |
| PDB 구조 | PDBe |
분자생물학에서 miR-137(또는 microRNA-137)은 다양한 메커니즘에 의해 다른 유전자의 발현 수준을 조절하는 기능을 하는 짧은 비코드 RNA 분자이다. miR-137은 인간 염색체 1p22에 위치하며 대장암, 편평상피세포암 및 나를 포함한 여러 종류의 암에서 종양 억제제 역할을 하는 것으로 알려져 있다.세포 주기 제어를 통해 종양을 형성합니다.
최근의 게놈 전체 연관 연구(GWAS)는 MIR137 유전자 근처의 단일 뉴클레오티드 다형성이 통계적으로 정신 분열증 및 다른 정신 [1][2]질환과 관련이 있음을 시사하는 증거를 제공했다.
miR-137은 생쥐 배아줄기세포의 신경줄기세포 증식과 분화, 그리고 생쥐 성체 해마 신경로제네이터 유래 및 태아 해마 뉴런의 수지 길이, 분기점, 끝점 및 척추 밀도 조절을 포함한 신경 성숙을 조절하는 것으로 나타났다.정신분열증 환자의 배측피질에서도 척추밀도 저하가 관찰되었다.
miR-137은 miR-137 클랜에 속한다(클랜은 관련된 구조와 기능에서 파생된 단일 진화적 기원에서 발생한 2개 이상의 RNA 패밀리 그룹이다).miR-137 클랜은 miR-137과 miR-234의 두 가지 구성원을 포함하고 있으며, 총 RNA 도메인 수는 112개입니다.
염색체 위치 및 전사
miR-137은 비단백질 코드화 RNA 유전자 AK094607 [3]내의 1p22 염색체에 위치한다.비코드 1차 miRNA(pri-miRNA) 전사체로 전사되며, 이는 전구체 miRNA(pre-miRNA)로 처리되며, 최종적으로 21~25 뉴클레오티드의 성숙하고 기능적인 miRNA로 처리된다.성숙한 miRNA는 다중 표적 mRNA의 3' 미번역 영역(3' UTR)에 결합함으로써 기능한다.이 결합은 결과적으로 표적 단백질의 번역을 억제하거나 표적 메신저 RNA의 분해를 초래한다.
마이크로RNA-137의 전사 후 처리는 1차 miRNA 전사물에 15-bp 가변 뉴클레오티드 탠덤 반복이 존재하여 변경될 수 있으며, 이는 접힘 및 miR-137의 2차 구조를 변화시킨다.이러한 변화는 miR-137의 성숙한 형태로 비효율적인 처리를 야기하고 다양한 인간 흑색종 세포주에서 miR-137 발현을 하향 조절하는 메커니즘으로 작용한다고 여겨진다.
식 패턴
miR-137은 뉴런에서 농축된 것으로 보고되었다.특히 현장 교배는 상당한 가소성과 새로운 [4]뉴런의 지속적인 생산을 가진 뇌의 영역인 성인 해마의 분자층 및 치상회 내에서 miR-137의 향상된 발현을 보였다.
또한 miR-137은 [5]인간의 정상적인 대장상피에서 구성적으로 발현되는 것으로 밝혀졌다.
후생적 조절과 암
miR-137은 CpG 디뉴클레오티드의 고주파수를 포함한 게놈 영역인 CpG 아일랜드 내에 내장되어 있으며, 머리와 [6][7][8]목의 대장암, 위암, 유방암 및 편평상피암을 포함한 많은 종양 유형에서 프로모터 하이퍼메틸화에 의해 자주 침묵되는 것으로 보고되고 있다.
miR-137은 대장암 조직과 같은 정도로 대장 선종 조직에서 후생적으로 무음화되므로 miRNA의 메틸화가 대장암 [5]발암의 초기 증상임을 시사한다.
머리와 목의 편평상피암 환자의 경구 헹굼에서 프로모터 메틸화를 분석한 결과 miR-137 메틸화는 여성 성별과 관련이 있으며 체질량 [9]지수와 역관련성이 있는 것으로 나타났다.또한 miR-137의 후생유전적 변화는 환자의 구강 헹굼에서 자주 검출되는 것으로 보이며 DNA 메틸화 패널에서 미래 바이오마커 역할을 할 수 있다.
대상
miR-137의 몇 가지 표적 유전자가 문서화되어 다양한 인간 암, 세포 주기 신호 전달 및 마우스 배아 줄기세포 발달에 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다.
발라게르 외 연구진은 miR-137 감염 후 HCT 116 대장암세포의 글로벌 유전자 발현 분석과 miR-137 데이터베이스를 [5]통해 예측된 miR-137 표적 목록을 상호 참조함으로써 miR-137 표적 32개 유전자 목록을 확인했다.이들 표적 중 LSD1(리신 특이 히스톤 데메틸라아제 1A, KDM1A라고도 함)은 miR-137에 의해 3' 결합을 통해 직접 하향 조절되는 것으로 나타났다.UTR. LSD1은 전립선암과 신경아세포종의 미분화 표현형을 유지함으로써 종양 성장을 촉진하는 데 관여한다.따라서 miR-137은 LSD1 단백질 발현을 음변조함으로써 종양억제 역할을 한다고 가정한다.
류 외 연구진은 또한 대장암, 고환암 및 유방암과 같은 많은 인간 암 유형에서 상향 조절된 것으로 밝혀진 Rho GTPase 계열의 잘 알려진 구성원인 miR-137 표적이 Cdc42(세포 분열 주기 42)임을 보여주었다.특히 Cdc42 3' UTR의 miR-137 목표 부위는 사람, 침팬지, 쥐, 개, 닭 등 다양한 종에 걸쳐 보존성이 높다.miR-137은 Cdc42/PAK 신호경로를 억제함으로써 대장암세포의 [10]증식, 침입 및 G0/G1 세포주기 진행을 감소시킨다.
miR-137은 또한 CDK6(사이클린 의존성 키나제6) 발현을 직접적으로 억제하고 알려진 CDK6 하류 표적인 인산화 RB(망막아종)의 수준을 감소시키는 것으로 나타났다.이는 miR-137이 분화를 유도하고 성체 쥐 신경줄기세포, 올리고덴드로마유래줄기세포 및 인간 교아세포유래줄기세포의 [11]증식을 억제하는 메커니즘으로 제안되었다.또한 miR-137은 신경생성과 [4]신경발달에 중요한 것으로 알려진 유비퀴틴 연결효소인 Mib1(Mind Bomb-1)을 표적으로 한다.
miR-137의 또 다른 주목할 만한 대상은 인간 흑색종에서 [3]자주 잘못 조절되는 것으로 생각되는 멜라노사이트의 발달과 기능의 주요 조절 장치인 MITF(Micropthalmia Associated Transcription Factor)이다.miR-137은 또한 MITF와 CDK6를 [3][12]모두 하향 조절함으로써 흑색종 세포에서 종양 억제제 역할을 하는 것으로 제안되었다.
마우스 배아줄기세포(ESC)에서 Jarid1b(KDM5b, 히스톤 H3 Lysine 4 데메틸라아제라고도 함)는 최근 miR-137의 또 다른 직접적인 표적이 되는 것으로 나타났다.Jarid1b는 마우스 배아발달 초기에 자주 발현되며 미분화 ESC 마커의 발현을 유지하는 것으로 생각된다.Jarid1b 단백질 레벨을 억제함으로써 miR-137은 마우스 ESC의 [13]분화 상태를 변조하는 역할을 하는 것으로 생각된다.
스테판 립키 [1]외표적 스캔: (14] C6 또는 S6 또는 S6 또는 같은 단백질 화합물, N6 또는 SOC 1)의 단백질 합체(C6)를 포함하는 것으로 식별하였다.s)s)VARS(발릴-tRNA 합성효소), WBP1L(WW 도메인 결합단백질 1-like), CACNA1C(칼슘채널, 전압의존성, L형, 알파1C 서브유닛), DPYD(디히드로피리미딘탈수소효소[NADP+]), CACNB의존성 L형ne관련 포스파티딜이노시톨전달단백질 2), SBNO1(딸기노치 호몰로지 1), ZEB2(아진핑거 E박스 결합 호메오박스 2) 및 PRKD3(세린/트레오닌단백질인산화효소 D3)
Neault [15]등은 최근 miR-137을 발암성 Ras에 의해 유도되는 노화 이펙터 miRNA로 확인했다.보다 구체적으로 miR-137은 유전자 억제 및 종양유도 노화의 [16]생체내 바이패스에 관여하는 히스톤리신 데메틸라아제인 KDM4A를 억제한다.KDM4A는 CHD5, 종양 억제제 및 양성 조절기 p53 발현을 대상으로 합니다.Ras 의존성 췌장암에서는 miR-137 발현이 상실되고, 그 발현이 회복되면 췌장암세포의 세포 성장 정지 및 노화로 이어지는 것으로 관찰되었다.
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레퍼런스
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추가 정보
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외부 링크
- Rfam의 mir-137 마이크로RNA 전구체 패밀리 페이지
