ADP 리보실레이션 계수

ADP ribosylation factor
이 기사는 작은 GTP 결합 단백질에 관한 것이다.p14용ARF 종양 억제기 유전자, p14arf 참조.
1ksg opm.png
멤브레인 결합 ADP 리보실레이션 인자 유사 단백질 2(ARL2 마우스, 빨간색), 인광체 테라제 델타(노란색) 복합체(1ksg) 파란색 점은 지질빌레이어의 탄화수소 경계를 보여준다.
식별자
기호아르프
PfamPF00025
인터프로IPR006689
스마트ARF
프로사이트PDOC01020
SCOP21hur / SCOPe / SUPFAM
OPM 슈퍼 패밀리124
OPM단백질1ksg
CDDcd00878
멤브라노메1103
골지 기구를 강조하여 살아있는 대식세포에서 ARF의 분포.

ADP 리보실레이션 인자(ARFs)는 Ras 슈퍼 패밀리의 GTP 결합 단백질 ARF 계열의 구성원이다.진핵 세포에서는 ARF 계열 단백질이 어디에나 존재하며, 포유류 세포에서는 보존도가 높은 6명의 구성원이 확인되었다.ARF는 용해성이 있지만 일반적으로 N-terminus myristoylation 때문에 막과 연관된다.그들은 Vesicular 트래픽의 규제자 역할을 하며 리모델링에 관여한다.

작은 ADP 리보실레이션 인자(Arf) GTP 결합 단백질은 세포내 트래픽에서 베실체 생물 발생의 주요 조절 물질이다.[1]이들은 아를(Arf-like), 아르프(Arf 관련 단백질) 및 원격 관련 사르(Sar(Secupation-관련 및 Ras 관련) 단백질을 포함하는 성장가정의 창립 멤버들이다.아르프 단백질은 비활성 GDP에 바인딩된 형태와 이펙터에 선택적으로 바인딩되는 활성 GTP에 바인딩된 형태 사이에서 순환한다.고전적 구조 GDP/GTP 스위치는 GTP의 감마인산염에 단단히 결합하지만 GDP 뉴클레오티드에는 전혀 결합되지 않는 소위 스위치 1과 스위치 2 지역의 순응적 변화에 의해 특징지어진다.Arf1과 Arf6의 구조 연구는 이러한 단백질들이 스위치 1과 2의 순응적 변화를 특징으로 하지만, 그들은 단백질의 한 쪽에서 다른 쪽으로 구조 정보를 전파하기 위해 추가적이고 독특한 스위치를 사용한다는 점에서 다른 작은 GTP 결합 단백질로부터 벗어난다는 것을 밝혀냈다.

인간 Arf1과 Arf6의 GDP/GTP 구조 주기는 베타2베타3 Strand 연결 스위치 1과 스위치 2(인터스위치) 및 암페타식 나선형 N-단자에도 영향을 미치는 독특한 순응적 변화를 특징으로 한다.GDP에 바인딩된 Arf1과 Arf6에서, 인터스위치는 수축되어 N단자 나선형이 결합하는 포켓을 형성하고, 후자는 비활성 순응을 유지하기 위한 분자 해프 역할을 한다.이러한 단백질의 GTP 결합 형태에서 인터스위치는 스위치 1을 당기고 스위치 2를 위로 올려 GTP를 바인딩할 수 있는 능동적 순응을 복원하는 2-residue 레지스터 시프트를 거친다.이 순응에서, 인터스위치는 단백질로부터 투영되어 결합 주머니를 밀폐하여 N단자 하스프를 압출한다.

조절단백질

ARF는 GTP/GDP 교환 촉진에 관련된 단백질과 다른 기능을 제공하는 단백질 두 가지 유형과 정기적으로 연관된다.ARF는 코팅 단백질 I(COPI)와 클래드린 코팅된 베시클에서 코팅 어셈블리를 제어하는 규제 하위 장치로 작용한다.

GTP/GDP 교환 단백질

ARF는 구아노신 뉴클레오티드(Guanosine triphosphate, GTP)와 구아노신 diphosphate(GDP)의 두 가지 형태에 결합한다.ARF 분자의 모양은 그것이 묶인 형태에 따라 달라지며, 그것이 규제 용량에서 서비스할 수 있게 한다.ARF는 GTP와의 결합과 GDP 사이의 전환을 위해 다른 단백질의 도움을 필요로 한다. GTPase 활성화 단백질(GAPs)은 ARF가 GDP에 결합한 GTP를 가수 분해하도록 강제하고, 구아닌 뉴클레오티드 교환 인자는 ARF가 바운드 GDP 대신에 새로운 GTP 분자를 채택하도록 강제한다.

기타단백질

다른 단백질들은 그것이 GTP나 GDP에 묶여있는지에 따라 ARF와 상호작용을 한다.활성 형태인 ARF*GTP는 코팅 단백질 I(COPI)와 다양한 인광물질을 포함한 베시클 코팅 단백질과 어댑터에 결합한다.그 비활성 형태는 오직 한 종류의 투과성 단백질과 결합하는 것으로 알려져 있다.다른 종류의 ARF는 특히 다른 종류의 이펙터 단백질을 결합한다.

필로제니

현재 알려진 포유류 ARF 단백질은 6개로, ARF의 세 종류로 나뉜다.

구조

ARF는 크기가 약 20 kD인 작은 단백질이다.그들은 GDP/GTP 바인딩 주기 사이의 상대적인 위치를 바꾸는 두 개의 스위치 영역을 포함한다.ARF는 N-단자 영역에서 자주 근위축되며, 이는 막 연결에 기여한다.

예

이 영역을 포함하는 단백질을 인코딩하는 인간의 유전자는 다음과 같다.

참고 항목

참조

  1. ^ Pasqualato S, Renault L, Cherfils J (2002). "Arf, Arl, Arp and Sar proteins: A family of GTP-binding proteins with a structural device for 'front-back' communication". EMBO Reports. 3 (11): 1035–1041. doi:10.1093/embo-reports/kvf221. PMC 1307594. PMID 12429613.

추가 읽기

외부 링크

이 글에는 공용 도메인 Pfam과 InterPro의 텍스트가 포함되어 있다: IPR006689