엡스타인-바르 바이러스로 인코딩된 소형 RNA

Epstein–Barr virus-encoded small RNAs
EBER1
EBER SScons.png
EBER1의 보존된 이차 구조.
식별자
기호EBER1
RfamRF01789
기타자료
RNA형유전자
도메인엡스타인-바르 바이러스
PDB 구조PDBe

엡스타인-바르 바이러스에 인코딩된 작은 RNA(EBER)는 엡스타인-바르 바이러스(EBV)에 감염된 인간 세포의 핵에 국부화된 작은 비코딩 RNA이다.1981년에 처음 발견된 EBER는 감염된 세포에 존재하는 가장 풍부한 RNA이다.[1]EBER는 리보핵단백질(RNP) 복합체를 형성하기 위해 여러 숙주 단백질과 상호작용한다.EBERs에 대한 정확한 기능이 아직 명확하지 않지만, 변환과 종양생성에서의 역할이 제안된다.

배경

EBER1과 EBER2는 각각 길이가 짧고, 167과 172개의 뉴클레오티드가 있으며, 핵농축 비코딩 RNA이다.이 두 개의 RNA는 EBV의 잠복 감염 시 숙주의 RNA 중합효소 III에 의해 전사된다.[2][3]

EBER 1과 2는 자연에서 삭제된 적은 없지만 뚜렷한 표현형 변화 없이 바이러스 게놈에서 삭제할 수 있다.[2]EBER 발현만으로도 심각한 결합 면역 결핍 생쥐에서 종양을 유발할 수 있다.[4][5]

EBER1

EBER1은 인간의 리보솜 단백질 L22와[6] 연관되어 이 단백질이 뉴클레오플러스에서 뉴클레오플라즘으로 이동하게 한다.[7]또한 EBER1은 최소 3개의 호스트 hnRNP(A1, A2/B1 및 D/AUF1)와 상호 작용한다.[8]

EBER2

EBER2에 대한 합의 2차 구조

EBER1과 유사하게 EBER2는 주로 감염된 세포에서 매우 높게 표현된다.EBER1과 달리 EBER2의 순서는 관련 대상포진(약 50% 보존)에서 보존이 덜 된다.그러나 EBER2의 2차 구조는 보존성이 높다(그림 1 참조).EBER2는 오직 세포단백질(특히 La 도메인)을 반복된 요람의 말단부에 결합하는 것으로 알려져 있다. 그러나 EBER2의 다른 특징들, 특히 오래 보존되어 있는 두 개의 줄기 루프는 아직 알려지지 않은 단백질의 결합 부위가 될 수 있다고 믿는다.[9]

참조

  1. ^ Lerner MR, Andrews NC, Miller G, Steitz JA (February 1981). "Two small RNAs encoded by Epstein-Barr virus and complexed with protein are precipitated by antibodies from patients with systemic lupus erythematosus". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 78 (2): 805–809. doi:10.1073/pnas.78.2.805. PMC 319891. PMID 6262773.
  2. ^ a b Conrad NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). "The challenge of viral snRNPs". Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 71: 377–384. doi:10.1101/sqb.2006.71.057. PMID 17381320.
  3. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (2014). "RNA families in Epstein-Barr virus". RNA Biology. 11 (1): 10–17. doi:10.4161/rna.27488. PMC 3929418. PMID 24441309.
  4. ^ Komano J, Maruo S, Kurozumi K, Oda T, Takada K (December 1999). "Oncogenic role of Epstein-Barr virus-encoded RNAs in Burkitt's lymphoma cell line Akata". Journal of Virology. 73 (12): 9827–9831. doi:10.1128/JVI.73.12.9827-9831.1999. PMC 113031. PMID 10559294.
  5. ^ Yamamoto N, Takizawa T, Iwanaga Y, Shimizu N, Yamamoto N (November 2000). "Malignant transformation of B lymphoma cell line BJAB by Epstein-Barr virus-encoded small RNAs". FEBS Letters. 484 (2): 153–158. doi:10.1016/S0014-5793(00)02145-1. PMID 11068051. S2CID 35288002.
  6. ^ Fok V, Mitton-Fry RM, Grech A, Steitz JA (May 2006). "Multiple domains of EBER 1, an Epstein-Barr virus noncoding RNA, recruit human ribosomal protein L22". RNA. 12 (5): 872–882. doi:10.1261/rna.2339606. PMC 1440895. PMID 16556938.
  7. ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (April 1994). "The Epstein-Barr virus (EBV) small RNA EBER1 binds and relocalizes ribosomal protein L22 in EBV-infected human B lymphocytes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (8): 3463–3467. doi:10.1073/pnas.91.8.3463. PMC 43597. PMID 8159770.
  8. ^ Lee N, Pimienta G, Steitz JA (November 2012). "AUF1/hnRNP D is a novel protein partner of the EBER1 noncoding RNA of Epstein-Barr virus". RNA. 18 (11): 2073–2082. doi:10.1261/rna.034900.112. PMC 3479396. PMID 23012480.
  9. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (20 Dec 2013). "RNA families in Epstein-Barr virus". RNA Biology. 11 (1): 10–17. doi:10.4161/rna.27488. PMC 3929418. PMID 24441309.

외부 링크