XPC(제네)

XPC (gene)
XPC
Protein XPC PDB 2A4J.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭XPC, RAD4, XP3, XPCC, p125, Xeroderma 색소, 보완 그룹 C, XPC 복합 서브 유닛, DNA 손상 인식 및 수리 계수
외부 IDOMIM: 613208 MGI: 103557 HomoloGene: 3401 GeneCard: XPC
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001145769
NM_004628

NM_009531

RefSeq(단백질)

NP_004619
NP_001341655
NP_001341656
NP_001341658
NP_001341659

NP_033557

위치(UCSC)n/aChr 6: 91.47 – 91.49Mb
PubMed 검색[2][3]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

Xeroderma antexosum, 보완 그룹 C, 또한 XPC라고도 알려진, 인간에서 XPC 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.XPC는 뉴클레오티드 절연 수리에 있어 부피가 큰 DNA 유도체의 인식에 관여한다.[4]그것은 3번 염색체에 위치한다.[5]

함수

이 유전자는 뉴클레오티드 분리수리(NER) 경로의 구성요소를 인코딩한다.NER 경로에는 제로데르마 색소(XP) A-G와 V, 코카인 증후군(CS) A와 B, 트리코티오디스트로피(TTD) 그룹 A 등 여러 성분이 관여하고 있다.이 성분인 XPC는 글로벌 게놈 NER의 초기 단계에 중요한 역할을 하며, 특히 손상인식, 개방성 복합형성, 단백질 복합형성 회복에 중요한 역할을 한다.[4]

글로벌 게놈의 뉴클레오티드 절제 수선(GG-NER)에 XPC-RAD23B의 이 단지는 처음 손상을 인식 요소이다.[6]XPC-RAD23B는 열역학으로 DNAduplexes의 정치 불안의UV-induced한 광합성 물(cyclopyrimidine dimers고 6-4가능한 광합성 물), 어덕트 환경 mutagens로 형성된를 비롯한 다양한 인식하고 있다.벤조[a]피렌 또는 다양한 방향족으로서, 시스플라틴과 같은 암 화학 요법 치료제에 의해 형성된 사이클로푸린과 같은 산화성 내생성 병변과 유도체 같은 특정한 병변이다.XPC-RAD23B의 존재는 다른 핵심 NER 요인의 조립과 체외 및 체외 NER 경로를 통한 진행에 필요하다.[7]대부분의 연구가 XPC-RAD23B로 수행되었지만, 칼모듈린 계열의 칼슘 결합 단백질인 센트린-2를 가진 트리머 콤플렉스의 일부다.[7]

임상적 유의성

이 유전자나 다른 NER 성분의 돌연변이는 희귀한 자가 열성 장애인 제로데르마 색소증을 유발하는데, 이 증상은 어린 나이에 발암물질의 발달과 함께 햇빛에 대한 민감도를 증가시키는 것이 특징이다.[4]

DNA 손상은 암의 주요 원인인 것으로 보이며,[8] DNA 수리 유전자의 결핍은 많은 형태의 암의 기초가 될 가능성이 있다.[9][10]DNA 수리가 부족하면 DNA 손상이 누적되는 경향이 있다.그러한 과도한 DNA 손상은 오류가 발생하기 쉬운 전이 합성 때문에 돌연변이를 증가시킬 수 있다.과도한 DNA 손상은 또한 DNA 수리 중 오류로 인한 후생유전적 변화를 증가시킬 수 있다.[11][12]그러한 돌연변이와 후생적 변화는 을 유발할 수 있다.

DNA 수리 유전자의 발현 감소(일반적으로 촉진자 하이퍼메틸화와 같은 후생유전자의 변경에 의해 야기됨)는 암에서 매우 흔하며, 일반적으로 암에서 DNA 수리 유전자의 돌연변이 결함보다 훨씬 더 빈번하다.[citation needed]아래 표는 방광암과 비소세포폐암에서도 XPC표현이 후생유전적으로 자주 감소하였음을 보여주고 있으며, 또한 이러한 암의 보다 진전된 단계에서 XPC표현이 더 자주 감소하였음을 보여준다.

암의 단계가 별도로 표시된 암에서 XPC의 감소된 발현 빈도
빈도 참조
방광암 50% [13]
낮은 악성전위의 유두신경종양 35% [13]
저급 유두방광암 42% [13]
고등급 유두방광암 65% [13]
비소세포폐암(NSCLC) 70% [14]
NSCLC Stage I 62% [14]
NSCLC 단계 II-III 77% [14]

XPC 유전자의 촉진자 부위의 후생유전적 하이퍼메틸화가 XPC의 낮은 발현과 관련이 있는 것으로 나타난 반면,[13] 다른 후생유전적 억제 모드는 마이크로RNA miR-890의 과잉 발현에 의해서도 발생할 수 있다.[15]

상호작용

XPC(gene)는 ABCA1, [16]CETN2[17]XPB상호작용하는 것으로 나타났다.[18]

참조

  1. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000030094 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ a b c "Entrez Gene: XPC xeroderma pigmentosum, complementation group C".
  5. ^ "OMIM Entry - # 278720 - XERODERMA PIGMENTOSUM, COMPLEMENTATION GROUP C; XPC". Retrieved 12 December 2014.
  6. ^ Sugasawa K, Ng JM, Masutani C, Iwai S, van der Spek PJ, Eker AP, Hanaoka F, Bootsma D, Hoeijmakers JH (1998). "Xeroderma pigmentosum group C protein complex is the initiator of global genome nucleotide excision repair". Mol. Cell. 2 (2): 223–32. doi:10.1016/s1097-2765(00)80132-x. PMID 9734359.
  7. ^ a b Schärer OD (Oct 2013). "Nucleotide excision repair in eukaryotes". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 5 (10): a012609. doi:10.1101/cshperspect.a012609. PMC 3783044. PMID 24086042.
  8. ^ Kastan MB (2008). "DNA damage responses: mechanisms and roles in human disease: 2007 G.H.A. Clowes Memorial Award Lecture". Mol. Cancer Res. 6 (4): 517–24. doi:10.1158/1541-7786.MCR-08-0020. PMID 18403632.
  9. ^ Harper JW, Elledge SJ (2007). "The DNA damage response: ten years after". Mol. Cell. 28 (5): 739–45. doi:10.1016/j.molcel.2007.11.015. PMID 18082599.
  10. ^ Dietlein F, Reinhardt HC (2014). "Molecular pathways: exploiting tumor-specific molecular defects in DNA repair pathways for precision cancer therapy". Clin. Cancer Res. 20 (23): 5882–7. doi:10.1158/1078-0432.CCR-14-1165. PMID 25451105.
  11. ^ O'Hagan HM, Mohammad HP, Baylin SB (2008). "Double strand breaks can initiate gene silencing and SIRT1-dependent onset of DNA methylation in an exogenous promoter CpG island". PLOS Genetics. 4 (8): e1000155. doi:10.1371/journal.pgen.1000155. PMC 2491723. PMID 18704159.
  12. ^ Cuozzo C, Porcellini A, Angrisano T, Morano A, Lee B, Di Pardo A, Messina S, Iuliano R, Fusco A, Santillo MR, Muller MT, Chiariotti L, Gottesman ME, Avvedimento EV (Jul 2007). "DNA damage, homology-directed repair, and DNA methylation". PLOS Genetics. 3 (7): e110. doi:10.1371/journal.pgen.0030110. PMC 1913100. PMID 17616978.
  13. ^ a b c d e Yang J, Xu Z, Li J, Zhang R, Zhang G, Ji H, Song B, Chen Z (2010). "XPC epigenetic silence coupled with p53 alteration has a significant impact on bladder cancer outcome". J. Urol. 184 (1): 336–43. doi:10.1016/j.juro.2010.03.044. PMID 20488473.
  14. ^ a b c Yeh KT, Wu YH, Lee MC, Wang L, Li CT, Chen CY, Lee H (2012). "XPC mRNA level may predict relapse in never-smokers with non-small cell lung cancers". Ann. Surg. Oncol. 19 (3): 734–42. doi:10.1245/s10434-011-1992-9. PMID 21861227. S2CID 19154489.
  15. ^ Hatano K, Kumar B, Zhang Y, Coulter JB, Hedayati M, Mears B, Ni X, Kudrolli TA, Chowdhury WH, Rodriguez R, DeWeese TL, Lupold SE (2015). "A functional screen identifies miRNAs that inhibit DNA repair and sensitize prostate cancer cells to ionizing radiation". Nucleic Acids Res. 43 (8): 4075–86. doi:10.1093/nar/gkv273. PMC 4417178. PMID 25845598.
  16. ^ Shimizu Y, Iwai S, Hanaoka F, Sugasawa K (January 2003). "Xeroderma pigmentosum group C protein interacts physically and functionally with thymine DNA glycosylase". EMBO J. 22 (1): 164–73. doi:10.1093/emboj/cdg016. PMC 140069. PMID 12505994.
  17. ^ Araki M, Masutani C, Takemura M, Uchida A, Sugasawa K, Kondoh J, Ohkuma Y, Hanaoka F (June 2001). "Centrosome protein centrin 2/caltractin 1 is part of the xeroderma pigmentosum group C complex that initiates global genome nucleotide excision repair". J. Biol. Chem. 276 (22): 18665–72. doi:10.1074/jbc.M100855200. PMID 11279143.
  18. ^ Yokoi M, Masutani C, Maekawa T, Sugasawa K, Ohkuma Y, Hanaoka F (March 2000). "The xeroderma pigmentosum group C protein complex XPC-HR23B plays an important role in the recruitment of transcription factor IIH to damaged DNA". J. Biol. Chem. 275 (13): 9870–5. doi:10.1074/jbc.275.13.9870. PMID 10734143.

추가 읽기

외부 링크