고대 문자

고고학적 전사는 원형 DNA의 일부가 유일한 Pol II-like RNA 중합효소(RNAP)를 사용하여 새롭게 합성된 RNA 가닥에 복사되는 과정이다.이 과정은 시작, 신장, 종료의 세 가지 주요 단계로 이루어지며, 최종 결과는 단일 DNA 가닥을 보완하는 RNA 가닥입니다.많은 전사인자가 박테리아와 진핵생물 양쪽에서 호몰로그와 함께 이 과정을 지배하며, 핵심 기계는 진핵생물 ^[1][2]전사와 더 유사하다.

고세균은 박테리아처럼 막으로 둘러싸인 핵이 없기 때문에 새로 생성된 mRNA 조각에서 전사와 번역이 동시에 일어날 수 있다.오페론은 고세균에 ^[3]널리 퍼져 있다.

개시

고세균에서의 개시는 각각 진핵생물 TBP, TFIIB 및 TFIIE와 상동하는 TATA결합단백질(TBP), 고세균전사인자 B(TFB) 및 고세균전사인자 E(TFE)에 의해 제어된다.이들 인자는 부호화 영역의 상류에 있는 프로모터 코어 배열(TATA 박스, B 인식 요소)을 인식하고, 닫힌 전사 개시 복합체(PIC)^[2]를 형성하기 위해 RNAP를 모집한다.

PIC는 DNA의 템플릿 가닥을 로드하기 위해 국소 DNA 나선이 "용융"되는 개방 상태로 전환됩니다.RNAP은 상당한 길이의 트랜스크립트를 생성하기 전에 많은 짧은(2~15nt) 세그먼트를 만들고 방출하는 "abortive initiation"을 수행합니다.이는 프로모터를 지나쳐(촉진제 탈출), DNA에 대한 TBP의 파악을 느슨하게 하고 신장 인자 Spt4/5와 TFE를 교환할 때까지 계속됩니다.정확히 어떻게 이 탈출이 일어나는지 ^[2]연구해야 한다.

신장

프로모터 영역을 벗어난 후, RNAP는 신장 상태로 이행하고, 프로세스에서 새로운 RNA 가닥을 계속 성장시킨다.효소의 전면에서 들어온 이중 가닥 DNA는 RNA 합성을 위해 템플릿 가닥을 이용하기 위해 압축 해제된다.진행 중합효소에 의해 분리된 DNA 염기쌍마다 1개의 하이브리드 RNA:DNA 염기쌍이 즉시 형성된다.DNA 가닥과 초기 RNA 사슬은 별도의 채널에서 빠져나갑니다; 두 DNA 가닥은 단일 가닥 RNA가 ^[2]단독으로 나타나는 동안 전사 기포의 후행 끝에서 재결합합니다.

RNAP의 속도 및 처리능력에 도움이 되는 많은 신장계수가 있습니다.Spt4/Spt5 패밀리의 인자(Spt5의 세균 호몰로지를 NusG라고 함)는 DNA 채널 한쪽의 RNAP 클램프와 다른 한쪽의 게이트 루프에 결합함으로써 전사를 자극한다.결과적으로 DSIF는 클램프를 닫힌 상태로 잠가 신장 복합체(EC)가 분리되는 것을 방지합니다.또한 Spt5에는 두 가닥의 분리를 돕는 NGN 도메인이 있습니다.KOW 도메인은 변환과 변환이 ^[2]함께 이루어지도록 RNAP을 리보솜에 후크합니다.

일부 고세균은 신장 인자로 작용할 수 ^[2]있는 Elf1 호몰로지를 가지고 있다.

역추적

RNAP은 로드블록이나 어려운 시퀀스에 부딪히면 정지하거나 뒤로 이동하기 시작합니다.이 경우 RNA의 반응성 3' 가장자리가 활성 부위 밖에 있기 때문에 EC가 고착됩니다.TFS(TFIIS 호몰로그)는 활성 사이트에서 새로운 3' 엔드를 사용할 수 있도록 컷을 생성함으로써 이 문제를 해결하는 데 도움이 됩니다.몇몇 고고학자는 서로 다른 ^[2]기능을 가진 최대 4개의 TFS 패럴로그를 가지고 있다.

종료

고고학적 종말에 대해서는 많이 알려져 있지 않다.유리아카이얼 RNAPs는 폴리U 스트레칭이 ^[2]나타나면 저절로 종료되는 것으로 보입니다.

레퍼런스