대유행 바이러스 H1N1/09

Pandemic H1N1/09 virus
이 기사는 2009년 독감 대유행을 일으킨 바이러스에 관한 것이다.발병 자체에 대해서는 2009년 신종플루 대유행을 참조한다.
대유행 바이러스 H1N1/09
H1N1 influenza virus.jpg
CDC 인플루엔자 연구소에서 촬영된 대유행 H1N1/09 인플루엔자 바이러스의 전파 전자 현미경.그 바이러스는 지름이 80~[1]120나노미터이다.
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 리보비리아
왕국: 오르토나비라과
문: 네가르나비리코타
클래스: 인스톨바이러스
주문: 북극성 비랄레스
패밀리: 오르토믹소바이러스과
속: 알파인플루엔자바이러스
종류:
인플루엔자A바이러스
혈청형:
대유행 바이러스 H1N1/09
인플루엔자(독감)
H1N1 virus
종류들
백신
치료
유행병
발생.
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대유행 H1N1/09 바이러스는 2009년 신종플루 대유행의 원인이 된 돼지 A형 인플루엔자 아형 H1N1 변종이다.이 변종은 대중매체에 의해 종종 돼지독감이라고 불린다.다른 이름은 아래의 명명법 섹션을 참조하십시오.

바이러스 특성

이 바이러스는 계절독감에 대한 기존 백신이 아무런 보호 기능을 제공하지 않는 신종 인플루엔자 [2]바이러스이다.2009년 5월에 발표된 미국 질병통제예방센터(CDC)의 연구에 따르면 아이들은 새로운 변종에 대한 기존 면역력이 없지만 성인들, 특히 60세 이상은 어느 정도 면역력이 있는 것으로 나타났다.아이들은 당시 새로운 변종에 대해 교차반응 항체 반응을 보이지 않았고, 18~64세의 성인은 6~9%, 노인은 34%[3][4]였다.초기 분석에 대한 많은 보고는 이 변종이 5가지 다른 독감 바이러스의 유전자를 포함하고 있다는 것을 반복했다.북미 돼지 인플루엔자, 북미 조류 인플루엔자, 인간 인플루엔자 및 아시아와 [5]유럽에서 일반적으로 볼 수 있는 2종류의 돼지 인플루엔자 바이러스.추가적인 분석은 바이러스의 단백질 중 몇 개가 사람에게 가벼운 증상을 일으키는 변종과 가장 유사하다는 것을 보여주었고, 바이러스학자인 웬디 바클레이는 바이러스가 대부분의 사람들에게 [6]심각한 증상을 일으키지 않을 것이라고 제안했다.다른 주요 연구진은 바이러스의 모든 부분이 여러 [7][8]번 재발견되었음에도 불구하고 사실 돼지라고 지적했다.대유행 균주의 첫 번째 완전한 게놈 배열은 2009년 4월 27일 [9]애틀랜타에 있는 미국 질병통제예방센터의 과학자들에 의해 공개 데이터베이스에 저장되었다.위니펙의 과학자들은 이후 2009년 [10]5월 6일 멕시코와 캐나다에서 온 바이러스의 완전한 유전자 염기서열 분석을 완료했다.

바이러스 발생원

다른 사례의 샘플에서 바이러스의 유전적 차이를 분석한 결과, 바이러스는 2008년 6월 이후, 늦어도 2008년 [11][12][13]9월 경에 사람에게로 확산된 것으로 나타났다.2016년 마운트 시나이 의과대학의 연구자들에 의한 보고서는 2009년 H1N1 바이러스가 멕시코 [14]중부의 아주 작은 지역에 있는 돼지들로부터 유래한 것으로 보인다고 밝혔다.

2009년 4월 17일, 질병통제예방센터(CDC)는 남캘리포니아의 인접 카운티에 거주하는 어린이에게 발생하는 열성 호흡기 질환의 두 사례가 돼지 인플루엔자 A(H1N1) 바이러스의 감염에 의해 발생했다고 결정했다.두 사례의 바이러스는 유전적으로 밀접하게 관련되어 있고 아만타딘과 리만타딘에 내성이 있으며, 미국이나 다른 지역의 돼지 또는 인간 인플루엔자 바이러스 중에서 이전에 보고되지 않았던 독특한 유전자 조합이 포함되어 있다.2009년 봄에 신종 바이러스가 출현한 후, 미국, 멕시코, 그리고 [15][16]전 세계로 빠르게 확산되었다.

세계보건기구(WHO)는 지난 4월 말 사상 첫 '국제적 우려의 공중보건 비상사태'를 선포했고 6월에는 WHO와 미국 질병통제예방센터([17]CDC)가 환자 집계를 중단하고 대유행으로 [18]선포했다.

2009년 6월 23일, 뉴욕타임스는 미국 연방 농업 관리들이 "새로운 돼지독감이 멕시코의 공장 농장에서 발생했다는 일반적인 가정과는 반대로" "아시아의 돼지에게서 나타났을 가능성이 가장 높지만, 그 후 사람을 타고 북미로 여행했다"고 믿고 있다고 보도했다.이들은 자신들의 가설을 입증할 방법이 없다고 강조하면서도 유라시아와 북미의 유전자를 결합한 이 신종 바이러스가 북미 돼지에게서 전혀 유통되지 않았다는 증거는 없다고 말했다.[19]하지만, 2016년 마운트 시나이 의과대학 연구자들에 의한 후속 보고서는 2009년 H1N1 바이러스가 멕시코 [14]중부에서 유래한 것으로 보인다고 밝혔다.

2009년 6월 초, 지난 10년 동안 개발된 계산 방법을 사용하여 국제 연구팀은 2009년 독감 대유행의 기원과 기간을 재구성하려고 시도했다.옥스포드 대학 동물학부의 올리버 파이버스와 연구팀의 일부인 그는 "우리의 결과는 이 변종이 사람에게 전염되기 전 수년 동안 돼지들 사이에서, 아마도 여러 대륙들 사이에서, 순환해왔다는 것을 보여준다"고 주장한다.이번 사건을 담당한 연구팀은 돼지 내 여러 바이러스에서 파생된 것으로 보고 발병 사실을 인지하기 몇 달 전부터 사람에게 처음 전염된 것으로 보고 있다.연구팀은 "인플루엔자 감시가 널리 퍼졌음에도 불구하고 체계적인 돼지 감시의 부재로 인해 수년 [20]동안 발견되지 않은 이 잠재적인 전염병 변종의 지속성과 진화가 가능했다"고 결론지었다.

인플루엔자 바이러스온의 구조.헤마글루티닌(HA)과 뉴라미니다아제(NA) 단백질은 입자의 표면에 나타난다.게놈을 구성하는 바이러스 RNA는 입자 내부에 붉은 코일로 나타나며 리보핵단백질에 결합되어 있다.

연구자들에 따르면 유라시아와 북미 간 살아있는 돼지들의 이동은 "다양한 돼지 인플루엔자 바이러스의 혼합을 촉진시켜 (새로운 H1N1) 변종의 발생과 관련된 여러 가지 재배치를 야기한 것으로 보인다"고 한다.그들은 또한 이 새로운 대유행은 "독감 A의 생태계에서 국내 돼지들의 역할에 대한 추가적인 증거를 제공한다"[21]고 말했다.

2009년 11월, 바이러스학 저널에 발표된 연구는, 이 바이러스가 실험실이나 백신 제조 공장에서 유전자를 교환하고, 그 후에 "탈옥"한 세 대륙의 세 가지 변종의 산물일 수 있다는 것을 시사했다.이 연구는 저자들이 세계보건기구(WHO)에 가설을 고려해 달라고 요청했던 2009년 5월 연구원들 사이의 논쟁에 뒤이어 이루어졌다.첫 번째 논문을 검토한 후 WHO와 다른 기관들은 이 유행병이 자연적으로 발생하는 바이러스이며 실험실에서 [22][23]유래한 것이 아니라고 결론지었다.

전염성

이 바이러스는 1.4에서 1.6의[24] R로0 전염되며 계절독감과 같은 방식으로 사람에게서 사람으로 전파된다.감염자의 기침과 재채기에서 나오는 비말과 바이러스에 오염된 사람의 표면이나 손을 만지고 눈, 코, [25]입을 만지는 것이 가장 흔한 메커니즘이다.2009년에 WHO는 H1N1/09가 계절 [26]독감보다 더 전염성이 있는 것으로 보인다고 보고했다.하지만, 뉴잉글랜드 의학 저널 보고서는 가정에서 2009년 H1N1 인플루엔자 바이러스의 전염성이 과거 [27]유행병에서 보였던 것보다 낮다고 말했다.미국 질병통제센터는 열이 내린 후 적어도 하루 이상(보통 증상이 나타난 후 3~4일 후) 정상 활동을 재개할 것을 권고했지만 며칠 [28]더 바이러스를 계속 배출할 수 있는 것으로 나타났다.

독성

돼지 독감 바이러스의 독성은 경미하고 사망률은 매우 [29][30]낮다.

2009년 중반, 미국 질병통제센터는 대부분의 감염이 계절성 독감과 유사하게 경미하며 회복이 매우 [31]빠른 경향이 있다고 언급했다.2009년 9월 현재 사망자는 계절독감으로 [32]인한 연간 사망자의 극히 일부라고 한다.그러나 계절성 인플루엔자와의 인간 사망률 수치 [33]비교는 대유행의 영향을 과소평가하는 경향이 있으며, 대유행 H1N1/09 바이러스는 사실 2009/10년 독감 [34]시즌에 질병을 일으키는 독감의 주요 변종이었다.

임페리얼 칼리지[35] 런던에서의 연구는 계절독감과 달리 H1N1/09는 폐 깊숙이 있는 세포를 감염시킬 수 있다는 것을 보여주었다.계절성 독감은 전형적으로 코와 목에 위치한 수용체 타입 a2-6 세포만 감염시킬 수 있지만 H1N1/09는 수용체 타입 a2-3 세포도 감염시킬 수 있다.이것은 왜 일부 환자들이 심각한 호흡기 증상을 경험하는지를 설명할 수 있다.(H5N1 바이러스는 또한 수용체 타입 a2-3으로 폐 깊숙이 있는 세포를 감염시킬 수 있지만 수용체 타입 a2-6으로 세포를 감염시킬 수 없기 때문에 H1N1/09보다 전염성이 낮다.)

2009년 9월 현재, 이 독감에 감염된 대부분의 사람들은 가벼운 병을 앓고 있지만, 병원에 입원한 소수의 사람들은 종종 심각한 병을 앓고 있었다.캐나다 위니펙 매니토바 대학의 중환자실 전문가인 아란드 쿠마르는 "이 유행병은 두 가지 질병과 같다; 며칠 동안 일을 쉬거나 병원에 가거나, 종종 중환자실에 간다.타협은 없습니다.남반구에서는 2009년 7월과 8월에 입원환자의 15~33%가 ICU에 갔다.H5N1 조류독감이나 사스와 달리 H1N1/09는 폐포의 폐포를 파괴하고 종종 급성 호흡곤란증후군을 일으키는데, 이는 전체 사례의 절반을 사망에 이르게 한다.예비 연구는 심각도가 면역 체계에서 [36]유전적 변이와 관련이 있다는 것을 보여준다.

2009년 4월부터 2009년 11월까지 미국에서는 3900명이 신종플루로 사망했는데,[37] 이는 매년 3만6000명이 겨울철에 주로 사망하는 것과 비교되기도 한다.미국의 [38]H1N1 사망률은 CDC의 2009년 11월 수치에서 0.02% 미만으로 계산되었으며,[39] 영국에서는 0.026%로 명시적으로 계산되었다.

백신

2,500명의 사람들이 갤버스턴 카운티 보건부에서 H1N1 백신을 받기 위해 텍사스의 한 쇼핑몰에 줄을 서 있다.
주요 기사: 2009년 독감 대유행 백신

2009년 5월에 발표된 미국 질병통제예방센터의 연구에 따르면 아이들은 새로운 변종에 대한 기존 면역력이 없지만 성인들, 특히 60세 이상 노인들은 어느 정도 면역력이 있는 것으로 나타났다.아이들은 새로운 변종에 대해 교차반응 항체 반응을 보이지 않았고, 18세에서 60세 사이의 성인은 6-9%, 노인은 33%[40][41]였다.이러한 연구결과는 노인의 부분 면역이 유사한 계절 인플루엔자 바이러스에 대한 이전의 노출에 의한 것일 수 있다고 생각되어 왔지만, 2009년 11월 중국의 한 농촌의 미백신 인구에 대한 연구는 H1N1 변종에 대한 단지 0.3%의 교차 반응 항체 반응을 발견했고, 이는 계절에 대한 이전의 백신 접종이 있었다는 것을 암시한다.독감과 노출되지 않은 것이 노인 미국 [42]인구에서 발견되는 면역성을 야기했을 수 있다.생산량은 당초 추정치인 50억개가 [43]아닌 연간 30억회분일 수 있다.

진화 가능성

2009년 5월 22일, 세계보건기구(WHO)의 마가렛 찬 사무총장은 이 바이러스가 일반적인 계절 독감과 섞이고 예측할 수 없는 방식으로 [citation needed]변할 수 있기 때문에 남반구에서 면밀히 관찰되어야 한다고 말했다.New England Journal of Medicine의 7월호에 기고한 전문가들은 역사적으로 유행성 바이러스는 계절마다 진화해왔으며, 현재 변종은 앞으로 몇 달 안에 더 심각해지거나 전염될 수 있다고 언급했다.따라서 그들은 바이러스의 행동 변화를 감시하는 데 도움이 되는 적절한 감시에 참여하기 위한 국제 협력의 중요성을 강조했다.[44] 이는 2009년 가을 "백신 표적화"와 질병 패턴 해석에 도움이 될 것이다.

2009년의 다른 전문가들 또한 새로운 바이러스 변종이 앞으로 몇 달 동안 변이될 수 있다고 우려했다.예를 들어, 홍콩 대학의 주요 바이러스학자인 관이는 신종 H1N1 인플루엔자 바이러스가 "매우 불안정하다"고 설명했는데, 이는 다른 바이러스에 노출되었을 때 유전 물질을 혼합하고 교환할 수 있다는 것을 의미한다.인터뷰에서 그는 H1N1과 H5N1은 모두 불안정하기 때문에 유전물질을 교환할 가능성이 높은 반면 안정적인(계절독감) 바이러스는 유전물질을 흡수할 가능성이 낮다고 말했다.H5N1 바이러스는 대부분 조류에 한정되지만 드물게 사람에게 감염되면 사망률이 60~70%[45]에 이른다.전문가들은 특히 2009년 신종 돼지 A/H1N1 변종(Swine flu라고 표기된 매체)과 같은 더 많은 인간 전염성이 있는 인플루엔자 A/H5N1 변종(특히 "Swine flu"라고 표기된 매체)의 교배지 출현을 우려하고 있다.([45][46]자세한 내용은 H5N1 기사 스위트 참조)

다른 연구들은 이 바이러스가 사람에게 잘 적응하고 계절독감에 비해 뚜렷한 생물학적 이점을 가지고 있으며 복제와 [47]전염이 쉽기 때문에 재보존이 불가능하다고 결론지었다.하지만, 미국 연방 보건 관계자들은 미국에서만 수십만 명의 목숨을 앗아간 끔찍한 1918년 독감 전염병이 봄에 가벼운 "헤럴드" 환자 물결로 이어졌고,[48] 가을에는 치명적인 질병의 물결이 뒤따랐다고 지적했다.2009년 7월 말 현재, 미국 보건 당국은 신종플루가 아직 더 위험해질 정도로 변이하고 있지는 않지만, 바이러스가 계속해서 [49]전 세계를 돌아다니고 있기 때문에, 그들은 그것을 면밀히 추적하고 있다고 말했다.

2009년 10월 현재, Taubenberger의 연구는 2009년 H1N1 바이러스의 구조가 1918년 독감 [50]대유행과 관련된 H1N1의 변종과 유사하기 때문에 A(H1N1)의 진화가 상대적으로 더디다는 것을 보여주었다.홋카이도 대학의 연구에 의하면, 1918년의 초기 변종으로부터 발견된 헤마글루티닌 항원 아미노산 잔기와 2009년의 H1N1 변종과의 배열 상동성이 발견되었다.이는 1918년에 감염된 개인과 그 초기 후손들에게 2009년 H1N1 바이러스에 대한 더 강한 특이적 면역력을 보이는 데 영향을 미쳤을 수 있다.이 발견은 H1N1 바이러스의 미래 모니터링과 인체 [51]내에서의 진화에 대한 통찰력을 제공했다.

돌연변이

2013년 11월 20일 노르웨이 공중보건연구소는 H1N1 인플루엔자 변종에서 잠재적으로 중요한 돌연변이를 발견했다고 성명을 발표했다. H1N1 인플루엔자 변종은 감염된 사람들 사이에서 가장 심각한 증상을 일으킬 수 있다.성명에서 그들은 "변이가 바이러스의 호흡계 깊숙이 침투하는 능력에 영향을 미쳐 더 심각한 질병을 일으킬 수 있다"[52]고 말했다.

세계보건기구(WHO)는 노르웨이에서 이 돌연변이가 확산되지 않은 것으로 보이며 변이된 형태의 바이러스는 여전히 항바이러스제와 대유행 백신에 민감하다고 밝혔다.비슷한 돌연변이가 중국과 미국을 포함한 몇몇 다른 나라에서 유통되고 있는 H1N1 바이러스에서 심각한 경우뿐만 아니라 일부 경미한 경우에서도 발견되었다.더 많은 조사가 진행 중이지만, 현재 이러한 돌연변이가 신종플루 감염의 비정상적인 증가나 더 많은 심각하거나 치명적인 [52]사례로 이어지고 있다는 증거는 없습니다.

2009년 12월 2일, WHO는 최근 2개의 오셀타미비르 내성 H1N1 바이러스에 감염된 환자 클러스터를 통보받았다고 발표했다.영국(웨일스 포함)과 노스캐롤라이나에서 검출된 두 클러스터 모두 단일 병동에서 발생했으며 면역체계가 심각하게 손상되거나 억제된 환자를 포함했다.한 환자에서 다른 환자로의 내성 바이러스 전염은 두 발병 모두에서 의심된다.

저항

2010년 12월 현재, WHO는 전 세계에서 테스트된 2009년 대유행 H1N1 독감 샘플 314개가 오셀타미비르(타미플루)[53]에 대한 내성을 보였다고 보고했다.테스트된 계절성 H1N1 독감 균주의 99.6%가 아만타딘과 리만타딘에 [54]대한 내성을 나타냈기 때문에 이는 완전히 예상된 것은 아니었다.2009년 8월 현재, 다른 [55]항바이러스제인 자나미비르(Relenza)에 대한 내성을 보이는 순환 인플루엔자는 아직 없다.

영향을 받는 종

돼지

H1N1형 바이러스는 사람에게 전염되기 전에 돼지에서 순환한 것으로 알려져 있다.2007년 8월, 약 25명의 사람과 160마리의 돼지가 오하이오 주 박람회에서 독감에 걸렸다.분석 결과, 그들은 인간, 조류, 돼지 기원의 유전자를 포함한 H1N1 타입의 같은 변종에 감염되었다.2004년 한 연구에 따르면 아이오와에서는 돼지 수의사의 20퍼센트와 육류 포장업자의 3%가 대학 근로자를 제외하고 혈액에 돼지 인플루엔자에 감염된 것으로 보이는 항체를 가지고 있었다.804명의 시골 Iowan을 대상으로 한 또 다른 연구에서는 돼지 농부가 대학 근로자보다 돼지 독감 [56]항체를 가지고 있을 확률이 50배, 그들의 배우자가 약 30배 더 높다는 것을 발견했다.돼지도 사람에 [57]의해 감염된 것으로 알려져 있다.

인간

인간은 2009년 초부터 영향을 받아왔다.유엔 세계보건기구(WHO)의 2009년 11월 27일 전 세계 업데이트에는 "207개 이상의 국가 및 해외 영토 또는 커뮤니티가 7,820명 이상의 사망자를 포함하여 H1N1 2009 대유행 인플루엔자 사례를 보고했다"고 명시되어 있다.WHO는 또한 실험실에서 확인된 62만 2,482건 이상의 H1N1 [58]사례를 추적했다.이 바이러스의 증상은 계절성 인플루엔자의 증상과 동일하다.

새들

2009년 8월 하순, 칠레 정부는 인간 H1N1/09 바이러스가 새들에게 돌연변이를 일으키지 않고 "세계 전염병의 새로운 장을 열었다"는 것을 발견했다.WHO와 CDC의 최고 독감 및 동물 건강 전문가들은 이 상황을 면밀히 관찰하고 있었다.그들은 감염된 칠면조들이 가벼운 영향을 받았을 뿐이어서 잠재적으로 위험한 상황에 대한 우려를 완화시켰다고 말했다.칠레산 칠면조 고기는 안전하게 먹을 수 있으며 아직까지 잠재적으로 위험한 [59]돌연변이의 징후는 없다고 그들은 말했다.바이러스 전문가들은 H1N1/09가 조류 독감과 다시 결합하면 더 위험하고 쉽게 전염될 수 있다고 우려했다. 조류 독감은 훨씬 더 치명적이지만 사람에게 덜 전염된다.2009년 10월까지 캐나다 [60]온타리오의 칠면조 사육업자에서 또 다른 발병 사례가 확인되었다.

기타 동물

2009년 10월에는 오리건주에 사는 [61]페럿이 H1N1 바이러스에 감염된 것으로 확인됐다.2009년 11월, 가정용 [62][63][64]고양이에서 신종플루 사례가 확인되었다.비록 미국에서 H1N1 바이러스로 인한 가장 이른 고양이 사망률이 펜실베니아에서 [65]발생했지만, 오리건 수의사협회가 미국에서 고양이 사망률을 처음으로 확인했다.협회는 독감 증상이 있는 고양이 주인들은 아플 때 고양이의 눈, 코, 입을 만지지 말 것을 권고했다.그들은 고양이가 사람에게 바이러스를 전염시킬 가능성이 있기 때문에 아픈 애완동물을 치료한 후 손을 깨끗이 씻을 것을 권고했다.이것은 미국에서 고양이에게서 확인된 세 번째 H1N1 사례이다; 다른 사례들은 유타와 [66]아이오와에서 발생했다.H1N1에 감염된 개의 첫 번째 사례는 2009년 [67]12월에 보고되었다.2011년 7월 22일 노르웨이 수의학연구소는 [68]밍크에서 2009-H1N1 인플루엔자 바이러스가 처음으로 발생했다고 보고했다.

명명법

2009년 신종플루[2] 대유행과 이를 일으킨 바이러스 변종은 많은 이름으로 불렸다.2009년 7월 WHO 전문가들은 다양한 계절성 H1N1 바이러스 변종과 1918년 유행했던 H1N1 바이러스 변종과 구별하기 위해 이 바이러스를 "팬데믹 H1N1/09 바이러스"라고 명명했다.

일부 당국은 이 독감의 발생을 "스위인 플루"라고 부르는 것에 반대했다.톰 빌삭 미 농무장관은 돼지고기가 [69]소비하기에 안전하지 않다는 오해를 불러일으킬 수 있다고 우려했다.CDC는 이를 '신종플루 A(H1N1)'라고 부르기 시작했다.때로는 'A/H1N1'이 [2][70]사용되기도 한다.CDC는 "Novel H1N1"이라는 명명법의 사용을 중지하고 "2009 H1N1 독감"으로 변경된 내용을 반영하여 다양한 웹 페이지를 업데이트했습니다.네덜란드에서는 원래 돼지 독감이라고 불렸지만, 후에 국립 보건 연구소와 언론에서 "멕시코 독감"이라고 불렸습니다.한국과 이스라엘은 이것을 "멕시코 바이러스"[71]라고 부르는 것을 잠시 고려했다.나중에 한국 언론은 "Swine influe"의 줄임말인 "SI"를 사용했다.대만은 대부분의 현지 언론이 채택한 [72]신종 플루라는 이름을 제시했다.세계동물보건기구는 "북미 인플루엔자"[73]라는 이름을 제안했다.유럽위원회는 "신종플루 바이러스"[74]라는 용어를 채택했다.

A(H1N1) pdm09라는 이름은 이후 널리 사용되었으며, 때로는 A/California/7/2009(H1N1) pdm [75][76]등으로 인정되기도 했다.

위의 명명법에서 pdm09는 멕시코 대유행병 2009를 의미합니다.

유전학

2009년 신종플루[77] 바이러스의 유전적 기원
2009 H1N1 influenza virus genetic-num.svg
HA 헤마글루티닌 돼지(H1) 북미
나디아 뉴라미니다아제 돼지(N1) 유럽
PA RNA중합효소 서브유닛PA[78][79] 조류 북미
PB1 RNA중합효소 서브유닛[80] PB1 인간적인 1993년 H3N2형
PB2 RNA중합효소 서브유닛[81] PB2 조류 북미
NP 핵단백질[82] 돼지 북미
M 매트릭스 단백질 M1, M2 돼지 유라시아
NS/NEP 비구조 단백질 NS1,
핵수출단백질([83][84]NEP) 		돼지 북미
출처:"The identity card of a composite virus" (in French). Le Monde. 2009-04-29.

2009년 4월 24일, 미국 CDC는 멕시코에서 발생한 의심 사례의 7개 샘플이 텍사스와 캘리포니아에서 동물이나 다른 동물과의 연관성이 없는 환자들을 감염시킨 변종과 일치한다고 결정했다. 이 변종은 사람에서 [85][86]사람으로 확산되는 것으로 보인다.CDC는 이 변종이 북미 돼지 인플루엔자, 북미 조류 인플루엔자, 인간 인플루엔자, 돼지 인플루엔자 바이러스 등 4가지 다른 독감 바이러스의 유전자를 포함하고 있는 것을 확인했다.이는 "유전자 [5]배열이 비정상적으로 뒤섞인 것"이다.CDC 조사팀은 2009년 4월 25일 멕시코시티에 도착해 멕시코 담당자들과 함께 바이러스를 [87]연구했다.

돼지는 사람과 조류에 모두 감염될 수 있는 인플루엔자 바이러스에 취약하기 때문에 여러 [88][89]종의 독감 바이러스 사이에서 재협상이 일어날 수 있는 "혼합 용기" 역할을 할 수 있다.재배치는 두 종류의 인플루엔자 바이러스가 하나의 세포에 감염되어 새로운 인플루엔자를 발생시킬 수 있을 때 일어나는 과정이다.이것은 바이러스 게놈이 8개의 독립된 RNA 조각들 사이에서 분리되기 때문인데, 이것은 다른 바이러스의 RNA 조각들이 새로운 바이러스 입자들이 [90]조립될 때 섞여서 새로운 종류의 바이러스를 형성할 수 있게 해준다.이 새로운 변종은 북미산 [91]돼지 인플루엔자 바이러스와 유럽산 돼지 인플루엔자 바이러스의 재배치의 결과로 보인다.그러나 북미 돼지 변종 자체는 이전 재협상의 산물이며,[92] 1993년부터 최소 10년간 조류 PB2 유전자와 인간 PB1 유전자를 가지고 있었다.이 유전자들은 새로운 바이러스에 [93][94]유전되었다.

모든 바이러스 유전자의 유전자 배열은 GISAID([95][96]Global Initiative on Sharing Aviron Influe Data)를 통해 이용 가능해졌다.헤마글루티닌(HA) 유전자는 1999년 이후 미국 돼지에 존재하는 신종플루 바이러스와 유사하지만 뉴라미니다아제(NA)와 매트릭스단백질(M) 유전자는 유럽 돼지독감 분리제와 유사하다는 예비 분석 결과가 나왔다.이런 유전자 구조를 가진 바이러스가 사람이나 돼지에서 유통되는 것으로 밝혀진 적은 없지만 미국에서는 [97]돼지에 어떤 바이러스가 유통되는지를 판별하는 공식적인 국가 감시 시스템이 없다.예비 분석은 또한 바이러스의 병태 생리학에 관련된 단백질들 중 몇 개가 사람에게 가벼운 증상을 일으키는 변종과 가장 유사하다는 것을 보여주었다.이는 1918년 대유행 독감 바이러스나 H5N1 조류 [98]인플루엔자에 의한 것과 유사한 심각한 감염을 일으킬 가능성은 낮다는 것을 시사한다.

2009년 5월 6일 늦게 캐나다 국립미생물연구소(National Microbiology Laboratory)는 멕시코 바이러스 샘플의 염기서열 분석을 완료하고 그 결과를 GenBank에 A/Mexico/InDRE4487/2009(H1N1)[99]로 발표했습니다.이는 이후 CDC가 [9]4월 27일 시퀀싱 및 발표한 캘리포니아산 변종인 A/California/07/2009(H1N1)와 거의 동일한 것으로 나타났다.멕시코, 노바스코샤, 온타리오에서 채취한 샘플은 동일한 염기서열을 가지고 있어 멕시코 사례의 [100][101]심각성에 대한 유전적 설명은 배제되었다.

다른 사례의 샘플에서 바이러스의 유전적 차이는 2008년, 아마도 6월 이후, 늦어도 [11]11월 말 이전에 바이러스가 인간에게 퍼졌다는 것을 발견한 국제 협력에 의해 분석되었다.이 연구는 또한 바이러스가 발병 전 몇 달 동안 돼지에게 잠복해 있었다는 것을 나타내며,[20] 향후 발생을 막기 위해 농업 감시를 강화할 필요가 있음을 시사했다.

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외부 링크