2번 염색체
Chromosome 22번 염색체 | |
---|---|
특징들 | |
길이(bp) | 242,440,529 bp (GRCh38)[1] |
No. 유전자의 | 1,194(CCDS)[2] |
유형 | 오토썸 |
동원체 위치 | 서브메트릭[3] (93.9 Mbp[4]) |
완전한 유전자 리스트 | |
CCDS | 유전자 리스트 |
HGNC | 유전자 리스트 |
유니프로트 | 유전자 리스트 |
엔씨비 | 유전자 리스트 |
외부 지도 뷰어 | |
앙상블 | 2번 염색체 |
엔트레즈 | 2번 염색체 |
엔씨비 | 2번 염색체 |
UCSC | 2번 염색체 |
완전한 DNA 배열 | |
참조 | NC_000002(FASTA) |
GenBank | CM000664(FASTA) |
2번 염색체는 인간의 23쌍의 염색체 중 하나이다.사람들은 보통 이 염색체를 두 개 복제한다.2번 염색체는 2억4천2백만 개 이상의[5] 염기쌍에 걸쳐 있고 인간 세포 내 총 DNA의 거의 8%를 차지하는 두 번째로 큰 인간 염색체이다.
2번 염색체는 HOXD 호메오박스 유전자 [6]클러스터를 포함한다.
염색체
인간은 23쌍의 염색체를 가지고 있는 반면, 다른 모든 현존하는 인간들은 24쌍의 [7]염색체를 가지고 있다.네안데르탈인과 데니소반은 23쌍을 [7]가지고 있었다고 여겨진다.
인간 2번 염색체는 두 조상 [8][9][10]염색체의 종단간 융합의 결과이다.이에 대한 근거는 다음과 같습니다.
- 2번 염색체와 2개의 유인원 염색체의 대응.인간의 가장 가까운 친척인 침팬지는 인간의 2번 염색체와 거의 동일한 DNA 서열을 가지고 있지만, 그들은 두 개의 분리된 염색체에서 발견됩니다.더 멀리 있는 고릴라와 [11][12]오랑우탄에게도 마찬가지다.
- 흔적적 동원체의 존재.보통 염색체는 하나의 동원체만을 가지고 있지만, 2번 염색체에서는 q21.3–q22.1 [13]영역에 두 번째 동원체의 잔재가 있다.
- 흔적 텔로미어의 존재.이것들은 보통 염색체의 끝에서만 발견되지만, 2번 염색체에서는 염색체의 [14]양쪽 끝에서 멀리 떨어진 q13 밴드에 추가적인 텔로미어 배열이 있다.
우리는 우주체 c8.1과 c29B에서 복제된 궤적은 고대 텔로미어-텔로미어 융합의 유물로 두 개의 조상 유인원 염색체가 융합되어 인간 염색체 2가 탄생한 지점을 나타낸다.
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유전자
유전자수
다음은 인간 2번 염색체의 유전자 수 추정치입니다.연구자들이 게놈 주석을 달기 위해 다른 접근 방식을 사용하기 때문에 각 염색체의 유전자 수에 대한 그들의 예측은 다양하다.다양한 프로젝트 중 CCDS(협업적 합의 코딩 시퀀스 프로젝트)는 매우 보수적인 전략을 취합니다.따라서 CCDS의 유전자 수 예측은 인간의 단백질을 코드하는 [15]유전자 수의 하한선을 나타냅니다.
추정자 | 단백질 코드화 유전자 | 비부호화 RNA 유전자 | 유사 유전자 | 원천 | 발매일 |
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CCDS | 1,194 | — | — | [2] | 2016-09-08 |
HGNC | 1,196 | 450 | 931 | [16] | 2017-05-12 |
앙상블 | 1,292 | 1,598 | 1,029 | [17] | 2017-03-29 |
유니프로트 | 1,274 | — | — | [18] | 2018-02-28 |
엔씨비 | 1,281 | 1,446 | 1,207 | [19][20][21] | 2017-05-19 |
유전자 목록
다음은 인간 염색체 2번 유전자의 일부 목록입니다.전체 목록은 오른쪽 정보 상자에 있는 링크를 참조하십시오.
p-arm
인간 염색체 2의 p-arm(짧은 팔)에 위치한 유전자의 부분 목록:
- ACTR2: Actin 관련 단백질 2를 코드화한다.
- ADI1: 1,2-디히드록시-3-케토-5-메틸티오펜텐디옥시게나아제 코드화
- AFF3: 단백질 AF4/FMR2 패밀리멤버 3의 부호화
- AFPH: Aftiphilin 단백질 코드화
- ALMS1: 알스트롬 증후군 1
- ABCG5 및 ABCG8: ATP결합 카세트, 서브패밀리 A, 멤버 5 및 8
- ASXL2: 2, 전사 조절기와 같은 추가 섹스 빗
- ATRAID: 단백질 아포토시스 관련 단백질 3을 코드화한다.
- BCYRN1: BC200 lncRNA
- C2orf16: 알 수 없는 단백질 C2orf16
- CAPG: 활성 단백질 캡
- CCDC104: 104를 포함하는 코일 코일 도메인
- CCDC142: 142를 포함한 코일 도메인
- CCDC142: 142를 포함하는 코일 코일 도메인
- CTLA4: 세포독성 T림프구 항원 4
- 세포골격조절RNA
- DHX57: DExH 박스 헬리케이스57
- DPYSL5: 5와 같은 디히드로피리미다아제
- ERLEC1: 소포체 렉틴 1
- EVA1A: 부호화 단백질 Eva-1 호몰로지 A (C. elegans)
- FAM49A: 시퀀스 유사성이 있는 패밀리49 멤버A
- FAM98A: 배열 유사성 98 멤버A 패밀리
- FAM136A: 시퀀스 유사성 136 멤버A 패밀리
- FBXO11: F박스단백질11
- 단백질 GEN1, 홀리데이 접합 5' 플랩 핵산가수분해효소를 코드하는 GEN1
- GCKR: 글루코키나아제조절제
- GFPT1: 글루타민-과당-6-인산트랜스아미나아제1
- GKN1: 가스트로킨 1
- GPATCH11: 단백질을 함유한 G패치 도메인 11
- GTF2A1L: 일반 전사인자 IIA 서브유닛1과 같은
- 하다: 히드록시아실-코엔자임A탈수소효소/3-케토아실-코엔자임A티오라아제/에노일-코엔자임A 가수분해효소(삼관능단백질), 알파 서브유닛
- HADHB: 히드록시아실-코엔자임A탈수소효소/3-케토아실-코엔자임A티오라아제/에노일-코엔자임A 가수분해효소(삼관능단백질), 베타 서브유닛
- HSPC159: 갈렉틴 관련 단백질
- ID2-AS1: 단백질 Id2 안티센스 rna 1(머리부터 머리까지)을 코드화
- LEPQTL1: 렙틴, 혈청 수준
- 메모 1: 셀 이동성의 중개자 1
- MPHOSP10:M상인산단백질10
- MSH2: mutS homolog 2, 대장암, 비용종증 타입 1(대장균)
- MSH6: mutS homolog 6 (대장균)
- MTHFD2: 2관능성 메틸렌테트라히드로폴산탈수소효소/시클로히드로라아제, 미토콘드리아
- MTF2: 미토콘드리아 번역개시인자2
- NDUFAF7: 단백질 아르기닌메틸전달효소 NDUFAF7, 미토콘드리아
- NRBP1: 핵수용체결합단백질 1
- ODC1: 오르니틴탈탄산화효소
- OTOF: otoperlin
- PAIP2B: 폴리결합단백질 상호작용단백질 2b
- 단백질 파킨슨병 3을 코드하는 PARK3(자염색체 우성, 루이체)
- PCBP1-AS1: 단백질 PCBP1 안티센스 RNA1을 코드화한다.
- PCYOX1: 프레닐시스테인산화효소1
- PELI1:유비퀴틴리가수분해효소
- PLGLB2: 플라스미노겐 관련 단백질 B
- POLR1A: DNA 유도 RNA 중합효소 I 서브유닛 RPA1
- PREPL: 프롤릴엔도펩티드가수분해효소유사
- PXDN: Peroxidasin 호몰로그
- QPCT: 글루타미닐펩티드시클로전달효소
- RETSAT: 올트랜스-레티놀13,14-환원효소
- SH3YL1: SH3 및 SYLF 도메인 포함 1
- SLC35F6: 단백질 Transmembrane 단백질 SLC35F6 코드화
- TGOLN2 : Trans-Golgi 네트워크 일체막 단백질 2
- THADA: 갑상선종 관련 단백질 코드화
- TIA1 : TIA1 세포독성 과립관련 RNA결합단백질
- TMEM150 : 막투과단백질 150a
- TP53I3: 추정 퀴논옥소레두캣세
- TPO: 갑상선 과산화효소
- TTC7A: 가족성 다장폐쇄증
- WBP1: WW 도메인 결합 단백질 1
- WDCP: 단백질을 함유한 WD 반복 및 코일 코일
q-arm
인간 염색체 2의 q-arm(장팔)에 위치한 유전자의 부분 목록:
- ABCA12: ATP결합 카세트, 서브패밀리 A(ABC1) 멤버 12
- ACTR1B: 단백질 베타센트릭틴 코드화
- AGXT: 알라닌글리옥실산아미노전달효소(옥살루스I, 과산화알루뇨I, 글리콜리산뇨, 세린피루브산아미노전달효소)
- ALS2: 근위축성 측삭경화증 2(청소년)
- ALS2CR8: 단백질 근위축성 측삭경화증 2염색체 영역 후보 유전자 8단백질 칼슘반응인자(CaRF)로 알려져 있다.
- ARMC9: 단백질 LisH 도메인 함유 단백질 ARMC9를 코드한다.
- B3GNT7: 단백질 UDP-GlcNAc: 베타갈 베타-1, 3-N-아세틸글루코사미닐전달효소7
- BCS1L : Gracile (핀란드 유산병)관련 유전자
- BMPR2: 골형태생성단백질수용체, 타입II(세린/트레오닌인산화효소)
- C2orf54:2번 염색체 개방 판독범위 54
- CCDC138: 코일 코일 도메인 함유 단백질 138
- CCDC74A: 74a를 포함한 코일 도메인
- CCDC88A: 코일 코일 도메인 함유 단백질 88A
- CCDC93: 코일 코일 도메인 함유 단백질 93
- CDCA7: 세포분열주기 관련 단백질 1
- CHPF: 콘드로이틴 황산합성효소 2
- COL3A1: 콜라겐, III형, 알파1(엘러스-단로스 증후군 IV형, 상염색체 우성)
- COL4A3: 콜라겐, IV형, 알파3(양분 항원)
- COL4A4: 콜라겐, 타입 IV, 알파4
- COL5A2: 콜라겐, V형, 알파2
- DES: 데스민 단백질
- DIS3L2: DIS3 유사분열 제어 호몰로지 2
- ECEL1: 엔도셀린 변환효소 1과 같은 것
- EPC2: 폴리콤 호몰로지2의 인핸서
- EPB41L5: 단백질 적혈구막 단백질 밴드 4.1을 5와 같이 코드화
- ERICH2: 단백질 글루탐산염 농후 단백질 2
- FASTKD1: FAST인산화효소 도메인함유단백질1
- IMP4: U3 소핵 리보핵단백질
- INPP1: 이노시톨폴리인산1-인산가수분해효소
- INPP4A: 이노시톨폴리인산-4-포스파타아제A형
- ITM2C: 일체막단백질 2C
- KANSL3: KAT8 규제 NSL 복합 서브유닛 3
- KIAA1211L: 특징 없는 단백질 KIAA1211- 라이크
- LANCL1: LANC는 1과 같다
- LINC00607: RNA 607을 코드하는 긴 유전자간 비단백질 코드
- LOC100287387: LOC100287387
- MALL: MAL양단백질
- MGAT5: 만노실(α-1,6--글리코단백질β-1,6-N-아세틸-글루코사미닐전달효소)
- MIR561: 단백질 MicroRNA 561 부호화
- NABP1 : 핵산결합단백질 1
- NELL3: 단백질 Neuralized E3 유비퀴틴 단백질 연결효소 3
- NCL: 뉴클레오린
- NR4A2: 핵수용체 서브 패밀리 4, 그룹 A, 멤버 2
- OLA1: Obg 유사 ATPase 1
- PARD3B 부호화 단백질 분할 결함 3 호몰로그 B
- PAX3: 쌍상자 유전자 3(바르덴부르크 증후군 1)
- PAX8:쌍상자유전자8
- PID1: 1을 포함한 포스포티로신 상호작용 도메인
- POLR1B: DNA 유도 RNA 중합효소 I 서브유닛 RPA2
- PRR21: 프롤린이 풍부한 단백질 21
- PRSS56: 추정세린단백질가수분해효소56
- RBM44:Rna결합모티브단백질44
- RFX8: Rfx 패밀리멤버 8, rfx DNA 바인딩 도메인이 없음
- RIF1: 레플리케이션 타이밍 규제 팩터 1
- RNU4ATAC: RNA, U4atac 소형핵(U12의존성 스플라이싱)
- RPL37A: 단백질 60S 리보솜 단백질 L37a 코드화
- SATB2: 호메오박스 2
- SCARNA5: 소형 카잘체 특이 RNA 5
- SDPR: 혈청 결핍 반응 단백질
- SGOL2: 슈고신 라이크 2
- SH3BP4: SH3 도메인 결합 단백질 4
- SLC9A4: 용질 캐리어 패밀리9 멤버 A4
- SLC40A1: 용질 캐리어 패밀리 40(철 규제 트랜스포터), 부재 1
- SMPD4: 스핑고미에린포스포디에스테라아제4
- SP140: 단백질 SP140 핵체 단백질 코드화
- SPATS2L: 정자형성과 관련된 세린이 풍부한 2종 단백질
- SSB: 쇼그렌 증후군 항원 B
- SSFA2: 정자특이항원2
- TBR1: T박스, 브레인, 1
- THAP4: THAP 도메인 함유 단백질 4
- TMBM1 : 막간 BAX 억제제 모티브 함유 단백질 1
- TNRC15: GYF 도메인 함유 단백질 2가 풍부한 PERQ 아미노산
- 단백질을 코드하는 TSGA10 Testis 특이 10
- TTN: 타이틴
- TUBA4B : Tubulin α4b 단백질 코드화
- UBXD2: UBX 도메인 함유 단백질 4
- UXS1: UDP-글루쿠론산탈탄산화효소1
- XIRP2: 신액틴결합 반복함유단백질2
- ZNF142: 아연핑거단백질 142
관련 장애 및 특성
이 섹션은 확인을 위해 추가 인용문이 필요합니다.(2015년 9월 (이 및 ) |
다음 질병과 특성은 2번 염색체에 위치한 유전자와 관련이 있습니다.
- 2p15-16.1 미세결손증후군
- 자폐증[22]
- 알포트 증후군
- 알스트롬 증후군
- 근위축성 측삭경화증
- 팔수체 D형
- 갈라진 턱[23]
- 선천성 갑상선 기능 저하증
- 크리글러-나자르형 I/II
- 루이즈한 몸을 가진 치매
- 엘러스-단로스 증후군
- 엘러스-단로스 증후군, 고전형
- 엘러스-단로스 증후군, 혈관형
- 섬유이형성골진행증
- 길버트 증후군
- 할리퀸형 어류증
- 혈색소증
- 혈색소증 4형
- 유전성 비용종성 대장암
- 영유아-상행성 유전성 경련성 마비
- 소아성 원발성 측삭경화증
- 유당불내증
- 긴사슬 3-히드록시아실-코엔자임A탈수소효소결핍증
- 로우우드 증후군[24]
- 청년 6형 당뇨병
- 미토콘드리아 삼관능성 단백질 결핍증
- 비신드롬성 난청
- 광재채기 반사[25]
- 원발성 고산소뇨
- 원발성 폐고혈압
- 시토스테롤혈증(ABCG5 또는 ABCG8 중 하나의 녹아웃)
- 센센브레너 증후군
- 공감각
- 바덴부르크 증후군
세포유전대
크르. | 팔[30] | 밴드[31] | ISCN 개시하다[32] | ISCN 멈추다[32] | 베이스 페어 개시하다 | 베이스 페어 이제 그만 | 얼룩[33] | 밀도 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
2 | p | 25.3 | 0 | 388 | 1개 | 4,400,000 | 불량품 | |
2 | p | 25.2 | 388 | 566 | 4,400,001 | 6,900,000 | gpos | 50 |
2 | p | 25.1 | 566 | 954 | 6,900,001 | 1,200,000 | 불량품 | |
2 | p | 24.3 | 954 | 1193 | 12,000,001 | 1,650,000 | gpos | 75 |
2 | p | 24.2 | 1193 | 1312 | 16,500,001 | 1,900,000 | 불량품 | |
2 | p | 24.1 | 1312 | 1565 | 1,900,001 | 23,800,000 | gpos | 75 |
2 | p | 23.3 | 1565 | 1789 | 23,800,001 | 27,700,000 | 불량품 | |
2 | p | 23.2 | 1789 | 1908 | 27,700,001 | 29,800,000 | gpos | 25 |
2 | p | 23.1 | 1908 | 2027 | 29,800,001 | 31,800,000 | 불량품 | |
2 | p | 22.3 | 2027 | 2296 | 31,800,001 | 36,300,000 | gpos | 75 |
2 | p | 22.2 | 2296 | 2415 | 36,300,001 | 3,830,000 | 불량품 | |
2 | p | 22.1 | 2415 | 2609 | 38,300,001 | 41,500,000 | gpos | 50 |
2 | p | 21 | 2609 | 2966 | 41,500,001 | 47,500,000 | 불량품 | |
2 | p | 16.3 | 2966 | 3220 | 47,500,001 | 5,260,000 | gpos | 100 |
2 | p | 16.2 | 3220 | 3294 | 52,600,001 | 54,700,000 | 불량품 | |
2 | p | 16.1 | 3294 | 3548 | 54,700,001 | 6100,000 | gpos | 100 |
2 | p | 15 | 3548 | 3757 | 61,000,001 | 63,900,000 | 불량품 | |
2 | p | 14 | 3757 | 3935 | 63,900,001 | 68,400,000 | gpos | 50 |
2 | p | 13.3 | 3935 | 4114 | 68,400,001 | 71,300,000 | 불량품 | |
2 | p | 13.2 | 4114 | 4248 | 71,300,001 | 73,300,000 | gpos | 50 |
2 | p | 13.1 | 4248 | 4353 | 73,300,001 | 74,800,000 | 불량품 | |
2 | p | 12 | 4353 | 4860 | 74,800,001 | 83,100,000 | gpos | 100 |
2 | p | 11.2 | 4860 | 5307 | 83,100,001 | 91,800,000 | 불량품 | |
2 | p | 11.1 | 5307 | 5545 | 91,800,001 | 93,900,000 | acen | |
2 | q | 11.1 | 5545 | 5724 | 93,900,001 | 96,000,000 | acen | |
2 | q | 11.2 | 5724 | 6022 | 96,000,001 | 102,100,000 | 불량품 | |
2 | q | 12.1 | 6022 | 6261 | 102,100,001 | 105,300,000 | gpos | 50 |
2 | q | 12.2 | 6261 | 6395 | 105,300,001 | 106,700,000 | 불량품 | |
2 | q | 12.3 | 6395 | 6559 | 106,700,001 | 108,700,000 | gpos | 25 |
2 | q | 13 | 6559 | 6812 | 108,700,001 | 1,12,200,000 | 불량품 | |
2 | q | 14.1 | 6812 | 7036 | 112,200,001 | 118,100,000 | gpos | 50 |
2 | q | 14.2 | 7036 | 7334 | 118,100,001 | 121,600,000 | 불량품 | |
2 | q | 14.3 | 7334 | 7602 | 121,600,001 | 129,100,000 | gpos | 50 |
2 | q | 21.1 | 7602 | 7826 | 129,100,001 | 131,700,000 | 불량품 | |
2 | q | 21.2 | 7826 | 8050 | 131,700,001 | 134,300,000 | gpos | 25 |
2 | q | 21.3 | 8050 | 8169 | 134,300,001 | 136,100,000 | 불량품 | |
2 | q | 22.1 | 8169 | 8437 | 136,100,001 | 141,500,000 | gpos | 100 |
2 | q | 22.2 | 8437 | 8497 | 141,500,001 | 143,400,000 | 불량품 | |
2 | q | 22.3 | 8497 | 8646 | 143,400,001 | 147,900,000 | gpos | 100 |
2 | q | 23.1 | 8646 | 8735 | 147,900,001 | 149,000,000 | 불량품 | |
2 | q | 23.2 | 8735 | 8795 | 149,000,001 | 149,600,000 | gpos | 25 |
2 | q | 23.3 | 8795 | 9078 | 149,600,001 | 154,000,000 | 불량품 | |
2 | q | 24.1 | 9078 | 9361 | 154,000,001 | 158,900,000 | gpos | 75 |
2 | q | 24.2 | 9361 | 9585 | 158,900,001 | 162,900,000 | 불량품 | |
2 | q | 24.3 | 9585 | 9928 | 162,900,001 | 168,900,000 | gpos | 75 |
2 | q | 31.1 | 9928 | 10435 | 168,900,001 | 177,100,000 | 불량품 | |
2 | q | 31.2 | 10435 | 10599 | 177,100,001 | 179,700,000 | gpos | 50 |
2 | q | 31.3 | 10599 | 10733 | 179,700,001 | 182,100,000 | 불량품 | |
2 | q | 32.1 | 10733 | 11091 | 182,100,001 | 188,500,000 | gpos | 75 |
2 | q | 32.2 | 11091 | 11225 | 188,500,001 | 191,100,000 | 불량품 | |
2 | q | 32.3 | 11225 | 11538 | 191,100,001 | 196,600,000 | gpos | 75 |
2 | q | 33.1 | 11538 | 11925 | 196,600,001 | 202,500,000 | 불량품 | |
2 | q | 33.2 | 11925 | 12060 | 202,500,001 | 204,100,000 | gpos | 50 |
2 | q | 33.3 | 12060 | 12283 | 204,100,001 | 208,200,000 | 불량품 | |
2 | q | 34 | 12283 | 12641 | 208,200,001 | 214,500,000 | gpos | 100 |
2 | q | 35 | 12641 | 13014 | 214,500,001 | 220,700,000 | 불량품 | |
2 | q | 36.1 | 13014 | 13237 | 220,700,001 | 224,300,000 | gpos | 75 |
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2 | q | 36.3 | 13297 | 13595 | 225,200,001 | 230,100,000 | gpos | 100 |
2 | q | 37.1 | 13595 | 13893 | 230,100,001 | 234,700,000 | 불량품 | |
2 | q | 37.2 | 13893 | 13998 | 234,700,001 | 236,400,000 | gpos | 50 |
2 | q | 37.3 | 13998 | 14400 | 236,400,001 | 242,137,529 | 불량품 |
레퍼런스
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- ^ gpos: G 밴딩에 의해 긍정적으로 염색된 영역, 일반적으로 AT가 풍부하고 유전자가 부족한 영역, gneg: G 밴딩에 의해 음성적으로 염색된 영역, 일반적으로 CG가 풍부하고 유전자가 풍부한 영역, acen Centromere.var: 가변 영역; 줄기: 줄기.
외부 링크
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