SARS-CoV-2 세타 변종
SARS-CoV-2 Theta variant| 다음 시리즈의 일부 |
| COVID-19 전염병 |
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혈통 P.3으로도 알려진 세타 변종은 사스-CoV-2의 변종 중 하나로 COVID-19를 유발하는 바이러스다.[a]이 변종은 2021년 2월 18일 필리핀 중부 비사야에서 두 가지 돌연변이가 발견되면서 처음 확인됐다.[1]2021년 3월 12일 일본 도쿄 나리타 국제공항에 필리핀 출신 여행자가 도착하면서 감지됐다.[2]
그것은 영국, 남아프리카, 브라질에서 처음 발견된 그것들과 구별되며, 유사한 위협을 가하는 것으로 여겨진다.이 변종은 남아공과 브라질의 변종처럼 백신 접종을 통해 얻은 항체를 포함한 항체를 중화시키는 데 더 강한 저항력을 가지고 있다.[3]
세계보건기구(WHO)가 제안한 단순화된 명칭 체계에서 P.3은 테타 변종이라는 꼬리표가 붙었고, 관심의 변종(VOI)으로 여겨지지만 아직 관심의 변종은 아니다.[4]
2021년 7월 현재, 테타는 더 이상 WHO의 관심의 변종으로 간주되지 않는다.[4]
분류
이름 지정
2021년 3월 17일, PHE(Public Health England)는 리니지 P.3 VUI-21MAR-02를 명명했다.[5]
2021년 6월 1일 세계보건기구(WHO)는 혈통 P.3을 테타 변종으로 명명했다.[6]
돌연변이
SARS-CoV-2의 아미노산 돌연변이 세타 변종은 사스-CoV-2의 게놈 지도에 그 스파이크에 초점을 맞추어 표시하였다.[7]
모든 검체(아래 빨간색 라벨로 표시됨)에서 7개의 스파이크 단백질 돌연변이를 포함하여 총 14개의 아미노산 대체물이 관찰되었다.스파이크 단백질 돌연변이 중 4개는 이전에 우려 라인(즉, E484K, N501Y, D614G, P681H)과 연관되어 있었으며, 단백질 C-단자 부위(즉, E1092K, H1101Y, V1176F)를 향해 3개의 추가 교체가 관찰되었다.ORF8(즉, K2Q)의 N-단자(N-terminus)에서 단일 아미노산 대체물도 모든 검체에서 발견되었다.33개 샘플 중 32개 샘플(녹색 라벨)에서 141개에서 143개의 스파이크 단백질 위치에서 3개 아미노산을 삭제하는 등 다른 돌연변이가 관찰됐다.마지막으로 모든 사례에서 5개의 동의어 돌연변이(회색으로 표시)도 검출됐다.[8]
| 유전자 | 아미노산 |
|---|---|
| ORF1ab | F924F |
| D1554G | |
| S2433S | |
| L3201P | |
| D3681E | |
| N3928N | |
| L3930F | |
| P4715L | |
| A5692V | |
| S | LGV141_143del |
| E484K | |
| N501Y | |
| G593G | |
| D614G | |
| P681H | |
| S875S | |
| E1092K | |
| H1101Y | |
| V1176F | |
| ORF8 | K2Q |
| N | R203K |
| G204R |
| 유전자 | 아미노산 |
|---|---|
| ORF1a | D1554G |
| S2625F | |
| D2980N | |
| L3201P | |
| D3681E | |
| L3930F | |
| ORF1b | P314L |
| L1203F | |
| A1291V | |
| S | LGV141_143del |
| E484K | |
| N501Y | |
| G593G | |
| D614G | |
| P681H | |
| S875S | |
| E1092K | |
| H1101Y | |
| V1176F | |
| ORF8 | K2Q |
| N | R203K |
| G204R |
역사
필리핀 보건부는 2021년 2월 18일 환자로부터 유전자 염기서열을 받기 위해 샘플을 보낸 후 중앙 비사야에서 COVID-19 돌연변이 2개가 검출된 사실을 확인했다.이 돌연변이는 나중에 E484K와 N501Y로 명명되었는데, 50개 표본 중 37개에서 검출되었으며, 이 중 29개에서 두 돌연변이가 공존하였다.변종들의 공식 명칭은 없었고 전체 순서는 아직 밝혀지지 않았다.[1]
2021년 3월 12일, 일본은 필리핀에서 온 여행자에게서 이 변종을 발견했다.[2]
2021년 3월 13일, 보건부는 이 돌연변이가 혈통 P.3으로 지정된 새로운 변종이라고 확인했다.이날 국내 첫 혈통 P.1 사례도 확인했다.P.1과 P.3은 같은 혈통인 B.1.1.28에서 유래했지만, 그 부서는 혈통 P.3이 백신 효능과 투과능력에 미치는 영향은 아직 확인되지 않았다고 말했다.[10]
2021년 3월 17일, 영국은 처음 두 가지 경우를 확인했는데, 이 경우 PHE(Public Health England)는 이를 VUI-21MAR-02라고 불렀다.[11]
말레이시아는 2021년 4월 30일 사라왁에서 혈통 P.3 8건을 적발했다.[12]
통계
| 나라 | 팡골린[13] | outbreak.info[9] | 재생기[14] | 기타 출처 |
|---|---|---|---|---|
 필리핀 | 455 | 513 | 516 | 461[15] |
 USA | 17 | 20 | 17 | |
 독일 | 11 | 11 | 11 | |
 말레이시아 | 10 | 10 | 10 | 13[16] |
 영국 | 9 | 9 | 9 | 10[17] |
 일본 | 7 | 8 | 8 | |
 네덜란드 | 7 | 7 | 7 | 4[18] |
 캐나다 | 5 | 5 | 5 | |
 오스트레일리아 | 3 | 3 | 4 | |
 벨기에 | 3 | 3 | 3 | |
 중국[b] | 3 | 14 | 14 | |
 괌 | 3 | – | 3 | |
 뉴질랜드 | 3 | 3 | 3 | |
 노르웨이 | 3 | 3 | 3 | |
 싱가포르 | 3 | 3 | 3 | |
 앙골라 | 2 | 2 | 2 | |
 대한민국 | 2 | 2 | 2 | |
 스웨덴 | 2 | 2 | 2 | |
 브라질 | 1 | 1 | 1 | |
 핀란드 | 1 | 1 | 1 | |
| 합계 | 550 | 620 | 624 | 488 |
참고 항목
메모들
참조
- ^ a b News, CNN Philippines (February 18, 2021). "DOH confirms new COVID-19 mutations in Central Visayas". Retrieved May 2, 2021.
- ^ a b News, Kyodo (March 12, 2021). "New coronavirus variant found in traveler from Philippines: Japan". Retrieved May 2, 2021.
- ^ News, Japan Times (March 12, 2021). "Japanese authorities discover a new coronavirus variant in traveler from Philippines". Retrieved May 2, 2021.
- ^ a b "Tracking SARS-CoV-2 variants". who.int. World Health Organization.
{{cite web}}: CS1 maint : url-status (링크) - ^ "Variants: distribution of cases data". gov.uk. Government Digital Service.
- ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". June 1, 2021. Retrieved June 1, 2021.
- ^ "Spike Variants: Theta variant, aka B.1.128". covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. 1 July 2021. Retrieved 2021-07-05.
- ^ Center, Philippine Genome. "PGC SARS-CoV-2 Bulletin No. 7: Detection and characterization of a new SARS-CoV-2 lineage P.3, with spike protein mutations E484K, N501Y, P681H and LGV 141–143 deletion, from samples sequenced through the intensified UP-PGC, UP-NIH and DOH biosurveillance program". Philippine Genome Center.
- ^ a b "P.3 Lineage Report". outbreak.info.
- ^ News, ABS-CBN (March 13, 2021). "DOH confirms new COVID-19 variant first detected in PH, first case of Brazil variant". Retrieved May 2, 2021.
- ^ News, Rappler (March 17, 2021). "England reports 2 cases of new COVID-19 variant found in Philippines". Retrieved May 2, 2021.
- ^ "Covid-19: Sarawak detects variant reported in the Philippines". April 30, 2021. Retrieved April 30, 2021.
- ^ "PANGO lineages". cov-lineages.org.
- ^ "Regeneron COVID-19 Dashboard". covid19dashboard.regeneron.com. Retrieved August 27, 2021.
- ^ Lopez, Virgil (September 29, 2021). "DOH detects additional 339 Delta variant cases". GMA News. Retrieved October 1, 2021.
- ^ Pei Pei, Goh (July 8, 2021). "Delta variant detected in Sarawak". Retrieved July 13, 2021.
He said for the Theta variant, six cases had been detected in Kuching and seven in Kota Samarahan
- ^ "Variants: distribution of case data, 13 August 2021". August 13, 2021. Retrieved August 13, 2021.
- ^ "Variants in the Netherlands". rivm.nl. Retrieved July 16, 2021.
{{cite web}}: CS1 maint : url-status (링크)
