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사스-CoV-2

SARS-CoV-2
이 기사는 COVID-19를 일으키는 바이러스에 관한 것이다.사스를 일으키는 바이러스는 사스-CoV-1을 참조하십시오.두 바이러스가 모두 속하는 종에 대해서는 SARSr-CoV를 참조하십시오.
중증급성호흡기증후군 코로나바이러스2
Electron micrograph of SARS-CoV-2 virions with visible coronae
관상동맥이 보이는 SARS-CoV-2 바이러스 이온의 컬러 투과 전자 현미경
Illustration of a SARS-CoV-2 virion
SARS-CoV-2 바이러스온의 외부 구조의 원자 모델.각각의 "공"은 [1]원자입니다.
● 파란색:봉투
● 청록색: 스파이크당단백질(S)
● 빨간색:외피단백질(E)
● 녹색:막단백질(M)
● 주황색:글리칸
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 리보비리아
왕국: 오르토나비라과
문: 피수비리코타
클래스: 피소니비리세테스
주문: 니도비랄레스
패밀리: 코로나바이러스과
속: 베타코로나바이러스
하위 속: 사르베코바이러스
종류:
사스 관련 코로나바이러스
바이러스:
중증급성호흡기증후군 코로나바이러스2
주목할 만한 변종
동의어
  • 2019-nCoV
의 시리즈의 일부
COVID-19 대유행
Scientifically accurate atomic model of the external structure of SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom.
타임라인
2019
2020
2021
2022
장소
국가 및 지역별
운송으로
국제적 대응
국민 응답
의료 대응
백신
현행 백신
변종
문제의 종류
기타 변종
경제적 영향과 불황
국가별
종목별
영향
사회의
virus icon COVID-19 포털

중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2)[2]는 진행 중인 COVID-19 [3]대유행의 원인이 되는 호흡기 질환인 COVID-19(코로나바이러스 질환 2019)를 일으키는 코로나 바이러스의 일종이다.이 바이러스는 이전에 2019년 신규 코로나 바이러스(2019-nCoV)[4][5][6][7]라는 가명을 가지고 있었으며, 인간 코로나 바이러스 2019(HCoV-19 또는 hCoV-19)[8][9][10][11]로도 불렸다.중국 후베이(湖北)성 우한(武漢)[12][13]시에서 처음 확인된 세계보건기구(WHO)는 2020년 1월 30일 국제공중보건 비상사태, 2020년 3월 11일 대유행을 선포했다.사스-CoV-2는 사람에게 [15]전염되는 양성 단일가닥 RNA[14] 바이러스이다.

사스-CoV-2는 중증급성호흡기증후군 관련 코로나바이러스(SARSR-CoV)의 바이러스로 2002-2004년 사스 발병을 [2][16]일으킨 사스-CoV-1 바이러스와 관련이 있다.이용 가능한 증거는 이것이 동물성 기원이며 박쥐가 매개하는 [17]바이러스에서 나왔다는 것을 암시하는 박쥐 코로나 바이러스와 유전적 유사성을 가지고 있다는 것을 보여준다.SARS-CoV-2가 박쥐로부터 직접 발생했는지 아니면 중간 [18]숙주를 통해 간접적으로 발생했는지에 대한 연구는 진행 중이다.이 바이러스는 유전적 다양성을 거의 보이지 않아 인간에게 사스-CoV-2를 도입한 유출 사건이 2019년 [19]말에 일어났을 가능성이 높다는 것을 보여준다.

역학 연구는 2019년 12월 - 2020년 9월에 지역사회 구성원이 면역이 없고 예방 조치가 [20]취해지지 않았을 때 각 감염이 평균 2.4 - 3.4의 새로운 감염을 일으킨 것으로 추정한다.그러나 일부 후속 변종들은 더 전염성이 [21]강해졌다.이 바이러스는 주로 기침이나 [22][23]재채기에서 생기는 것뿐만 아니라 말하거나 호흡할 때 내뿜는 에어로졸과 호흡 방울을 통해 사람들 사이에 퍼진다.그것은 레닌-안지오텐신 [24][25]시스템을 조절하는 막 단백질인 안지오텐신 변환 효소 2(ACE2)와 결합함으로써 인간의 세포로 들어간다.

용어.

임시 이름 "2019-nCoV"로 서명

중국 우한에서 처음 발병했을 때, 다양한 바이러스 이름이 사용되었고, 다른 출처에서 사용된 이름 중 일부는 "코로나 바이러스" 또는 "우한 코로나 바이러스"[26][27]를 포함했다.2020년 1월 세계보건기구(WHO)는 바이러스의 임시 명칭으로 '2019년 신종 코로나바이러스'(2019-nCoV)[5][28]를 권고했다.이는 WHO가 2015년[29] 발표한 지리적 위치, 동물 종, 질병 및 바이러스 이름으로 [30][31]사람 그룹을 사용하는 것에 대한 지침을 따른 것이다.

2020년 2월 11일, 국제 바이러스 분류 위원회는 "심각한 급성 호흡기 증후군 코로나 바이러스 2"(SARS-CoV-2)[32]라는 공식 명칭을 채택했다.사스와의 혼동을 피하기 위해 세계보건기구는 공중 보건[33][34] 통신에서 사스-CoV-2를 "COVID-19 바이러스"라고 부르기도 하고 HCoV-19라는 이름도 일부 연구 [8][9][10]기사에 포함되기도 했다.COVID-19를 "우한 바이러스"라고 지칭하는 것은 WHO 관계자들에 의해 위험하다고, 그리고 버클리 캘리포니아 대학의 아시아계 미국인학 강사 [35][36][37]하비 동에 의해 외국인 혐오증이라고 묘사되어 왔다.

감염 및 전염

주요 기사:COVID-19 전염병

사스-CoV-2의 인간 대 인간 전염은 COVID-19 [15][38][39][40]대유행 기간인 2020년 1월 20일에 확인되었다.전염은 처음에는 약 1.8m(6ft)[41][42] 범위 내에서 기침과 재채기로 인한 호흡기 방울을 통해 주로 발생하는 것으로 가정했다.레이저 광산란 실험에 따르면 말하는 것은 추가적인 전송[43][44] 방식이며 공기 [46][47]흐름이 거의 없는 실내에서 멀리까지[45] 도달하는 방식입니다.다른 연구들은 에어로졸이 잠재적으로 바이러스를 [48][49][50]전염시킬 수 있는 것과 함께 바이러스가 공기 중에 있을 수도 있다는 것을 시사했다.사람에서 사람으로 전염되는 동안, 200에서 800개의 전염성 사스-CoV-2 바이러스들이 새로운 [51][52][53]감염을 일으키는 것으로 생각됩니다.확인될 경우, 에어로졸 전송은 생체 안전성에 영향을 미칩니다. 왜냐하면 실험실에서 새로운 바이러스로 작업하는 위험과 관련된 주요 우려 사항은 다양한 실험실 활동에서 에어로졸 생성이며, 이는 즉시 인식할 수 없으며 다른 [54]과학자에게 영향을 미칠 수 있기 때문입니다.오염된 표면을 통한 간접 접촉도 [55]감염의 또 다른 가능한 원인입니다.예비 조사 결과, 바이러스는 플라스틱(폴리프로필렌) 및 스테인리스강(AISI 304)에서는 최대 3일간 생존할 수 있지만, 골판지에서는 하루 이상, 구리에서는 4시간 [10]이상 생존할 수 없는 것으로 나타났습니다.그 바이러스는 비누에 의해 비활성화되어 지질 이중층을 [56][57]불안정하게 만든다.바이러스 RNA는 감염된 [58][59]사람의 대변 샘플과 정액에서도 발견되었다.

잠복기에 바이러스가 감염되는 정도는 확실하지 않지만, 인두는 감염 후 약[60][61] 4일 후 또는 증상 발생 첫 주에 최고 바이러스 부하에 도달하여 그 [62]후 감소하는 것으로 연구 결과 나타났다.SARS-CoV-2 RNA 배출 기간은 일반적으로 증상 [63]발생 후 3일에서 46일 사이이다.

노스캐롤라이나 대학 연구팀에 의한 연구는 비강이 겉으로 보기에 주요 감염부위이며 후속 흡인 매개 바이러스가 SARS-CoV-2 병인성 [64]폐로 옮겨진다는 것을 발견했다.그들은 섬모세포와 기도와 치조영역에서 [64]각각 2형 기흉세포와 원위부 폐상피 배양에서 높은 근위부에서 낮은 근위부에서 낮은 근위부로의 감염 구배가 있다는 것을 발견했다.

연구는 고양이, 족제비, 햄스터, 비인간 영장류, 밍크, 나무쥐, 너구리, 과일박쥐, 토끼와 같은 SARS-CoV-2 [65][66][67]감염에 취약하고 내성이 있는 다양한 동물들을 확인했다.일부 기관들은 사스-CoV-2에 감염된 사람들은 [68][69]동물과의 접촉을 제한한다고 권고했다.

무증상 및 전증상 전염

2020년 2월 1일, 세계보건기구(WHO)는 "증상 없는 사례로부터의 전염은 전염의 주요 동인이 아닐 것"[70]이라고 밝혔다.한 메타분석에 따르면 감염의 17%가 무증상이며, 무증상 개인은 [71]바이러스를 전염시킬 확률이 42% 낮았다.

그러나, 중국에서 발병 초기 역학 모델은 "증상 전폐가 문서화된 감염 중 전형적일 수 있다"고 제안했고, 대다수의 [72]감염의 원인이었을 수 있다.몬테비데오에 정박했던 유람선에 탑승한 217명 중 바이러스 RNA 양성반응을 보인 128명 중 24명만이 증상을 [73]보인 것은 이 때문이다.마찬가지로, 2020년 1월과 2월에 입원한 94명의 환자를 대상으로 한 연구에서는 증상이 나타나기 2~3일 전부터 바이러스 감염이 시작되었으며, "상당수의 전염은 지수 [74]사례에서 첫 증상 이전에 발생했을 것"이라고 밝혔다.저자들은 나중에 증상이 [75]나타나기 4, 5일 전에 털갈이가 처음 추정된 것보다 일찍 시작되었다는 것을 보여주는 수정 내용을 발표했다.

재감염

재감염과 장기면역에 [76]대한 불확실성이 있다.재감염이 얼마나 일반적인지는 알려지지 않았지만 보고서에 따르면 재감염이 다양한 [76]심각도로 발생하고 있습니다.

첫 번째 재감염 사례는 홍콩에서 온 33세 남성으로, 2020년 3월 26일 첫 양성반응을 보였고, 두 번의 음성반응을 거쳐 4월 15일 퇴원했으며, 2020년 8월 15일(142일 후) 다시 양성반응을 보였으며, 이는 두 사건 사이의 바이러스 게놈이 d에 속하는 것으로 확인되었습니다.균열이 있습니다.[77]이번 연구결과는 재감염이 드물지 않은 경우 집단 면역이 바이러스를 제거하지 못할 수 있으며 백신이 [77]바이러스에 대한 평생 보호를 제공하지 못할 수 있다는 것을 시사했다.

또 다른 사례 연구에서는 2020년 4월 18일과 6월 5일에 사스-CoV-2 양성 반응을 보인 네바다 주 출신의 25세 남성이 묘사되었다(2개의 음성 테스트로 분리).게놈 분석에서 두 날짜에 표본 추출한 SARS-CoV-2 변종 간의 유의한 유전적 차이가 나타났기 때문에 사례 연구 저자는 이것이 재감염이라고 [78]판단했다.남자의 두 번째 감염은 첫 번째 감염보다 증상적으로 더 심각했지만, 이것을 설명할 수 있는 메커니즘은 [78]알려지지 않았다.

저수지 및 원점

상세 정보:COVID-19의 기원에 대한 조사
생물학적 보균자로서 포유동물에서 사람에게 전염되는 SARS-CoV-1 및 SARS-CoV-2

인간을 감염시키는 병원체로 SARS-CoV-2가 등장하기 전에는 SARS-CoV-1과 MERS-CoV에 [17]의한 두 가지 동물성 코노라 바이러스 전염병이 있었다.

SARS-CoV-2에 의한 첫 번째 알려진 감염은 중국 [79]우한에서 발견되었다.바이러스가 인간에게 전염되는 원천은 불분명하며,[9][19][80] 바이러스가 확산되기 전이나 후에 병원성이 되었는지도 불분명하다.초기 감염자 중 상당수가 화난 수산물 시장 [81][82]근로자들이었기 때문에 바이러스가 시장에서 [9][83]유래한 것일 수도 있다는 주장이 제기돼 왔다.그러나 다른 연구에 따르면 방문자들이 이 바이러스를 시장에 소개했을 가능성이 있으며,[19][84] 이는 감염의 빠른 확대를 촉진시켰다.2021년 3월 세계보건기구(WHO)가 발표한 보고서에 따르면 중간 동물 숙주를 통한 인간 유출이 가장 유력한 설명이며, 박쥐로부터의 직접적인 유출이 그 다음일 가능성이 높다.식품 공급망과 화난 수산물 시장을 통한 도입도 가능하지만 가능성이 낮은 [85]또 다른 설명으로 여겨졌다.그러나 2021년 11월 한 분석에서는 가장 이른 것으로 알려진 사례가 잘못 확인되었으며, 화난시장과 관련된 초기 사례가 우세하다는 것이 [86]그 원인이라는 주장이었다.

최근 이종간 전파를 통해 감염된 바이러스는 빠른 진화가 예상된다.[87]초기 SARS-CoV-2 사례에서 추정된 돌연변이율은 사이트당 연간 [85]6.54×10이었다−4.코로나바이러스는 일반적으로 높은 유전적 [88]가소성을 가지고 있지만, SARS-CoV-2의 바이러스 진화는 복제 [89]기계의 RNA 교정 능력으로 인해 느려진다.비교를 위해 SARS-CoV-2의 생체내 바이러스 돌연변이율은 [90]인플루엔자보다 낮은 것으로 나타났다.

2002-2004년 사스(SARS중증급성호흡기증후군) 발병을 일으킨 바이러스의 천연 저장고에 대한 연구는 많은 사스 유사 박쥐 코로나바이러스를 발견하는 결과를 낳았으며, 대부분은 관박쥐에서 비롯되었다.2022년 2월 네이처(저널)에 발표된 가장 근접한 매치는 [91][92][93]라오스 푸앙의 박쥐 3종에서 수집된 바이러스 BANAL-52(사스-CoV-2와 96.8% 유사)와 BANAL-103 및 BANAL-236이었다.2020년 2월에 발행된 이전 자료에서는 중국 윈난성 모장의 박쥐에서 수집된 RaTG13 바이러스가 96.1% [79][94]유사성으로 SARS-CoV-2에 가장 가까운 것으로 확인되었다.위의 어느 것도 그것의 직계 [95]조상은 아니다.

관박쥐의 일종인 Rhinolophus sinicus에서 채취한 샘플은 사스-CoV-2와 80%가 유사하다는 것을 보여준다.

박쥐는 사스-CoV-2의 [85][96]가장 가능성이 높은 천연 저장소로 여겨진다.박쥐 코로나 바이러스와 사스-CoV-2의 차이는 인간이 중간 [83]숙주를 통해 감염되었을 수 있다는 것을 시사하지만, 인간에게 유입되는 원인은 [97][98]아직 알려지지 않았다.

처음에는 중간 숙주로서의 팡골린의 역할이 가정되었지만(2020년 7월에 발표된 연구에 따르면 팡골린은 SARS-CoV-2 유사 코로나[99][100] 바이러스의 중간 숙주이지만), 후속 연구는 확산에 [85]대한 이들의 기여를 입증하지 못했다.이 가설에 반대하는 증거는 팡골린 바이러스 샘플이 SARS-CoV-2와 너무 멀리 떨어져 있다는 사실을 포함한다: 광둥에서 포착된 팡골린으로부터 얻은 분리체는 사스-CoV-2 게놈과 순서상 92%만 동일했다(90% 이상의 매칭은 높게 들릴 수 있지만 게놈 측면에서는 매우 큰 진화적[101] 격차이다).또한, 몇 가지 중요한 [102]아미노산의 유사성에도 불구하고, 팡골린 바이러스 샘플은 인간의 ACE2 [103]수용체에 대한 결합성이 낮다.

계통학 및 분류학

게놈 정보
SARS-CoV-2 genome.svg
SARS-CoV-2의 가장 초기 염기서열 샘플인 격리 우한-후-1의 게놈 조직
NCBI 게놈 ID86693
게놈 크기29,903 베이스
완료년도2020
게놈 브라우저(UCSC)

SARS-CoV-2는 코로나바이러스로 [27]알려진 광범위한 바이러스군에 속합니다.단일 선형 RNA 세그먼트를 가진 양성 감지 단일 가닥 RNA(+ssRNA) 바이러스입니다.코로나바이러스는 인간, 가축과 반려동물을 포함한 다른 포유류, 조류 종을 [104]감염시킨다.인간 코로나바이러스는 일반적인 감기부터 중동호흡기증후군과 같은 더 심각한 질병까지 다양한 질병을 일으킬 수 있다.SARS-CoV-2는 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV,[105] 그리고 원래의 SARS-CoV에 이어 사람들을 감염시키는 것으로 알려진 7번째 코로나 바이러스이다.

2003년 사스(SARS·사스) 발생과 관련된 코로나 바이러스와 마찬가지로 사스-CoV-2는 사르베코바이러스 아속(베타-CoV 계통 B)[106][107]에 속한다.코로나바이러스는 자주 [108]재조합된다.SARS-CoV-2와 같은 분할되지 않은 RNA 바이러스의 재조합 메커니즘은 일반적으로 복제 [109]중에 유전자 물질이 한 RNA 템플릿 분자에서 다른 RNA로 전환되는 복제에 의한 것이다.SARS-CoV-2 RNA 배열은 길이가 [110]약 30,000개이며, 코로나 바이러스 치고는 비교적 길다(모든 RNA [111]계열 중 가장 큰 게놈을 가지고 있다).그것의 게놈은 거의 전적으로 다른 코로나 바이러스와 [108]공유되는 특성인 단백질 코드 배열로 구성되어 있다.

Micrograph of SARS‑CoV‑2 virus particles isolated from a patient
COVID-19 대유행 중 환자로부터 격리된 SARS-CoV-2 바이러스(빨간색)의 전파 전자 현미경

SARS-CoV-2의 특징 중 하나는 [102]퓨린에 의해 절단된 다염기 부위의 통합으로, 퓨린의 [112]독성을 높이는 중요한 요소로 보인다.SARS-CoV-2 S 단백질의 퓨린 클리비지 부위의 획득은 [113]인간에 대한 동물성 전달에 필수적이라고 제안되었다.푸린단백질가수분해효소는 분해부위가 아래쪽 화살표로 표시되고 X가 아미노산인 [114][115]표준펩타이드 배열 RX[R/K] R↓X를 인식한다.SARS-CoV-2에서 인식 부위는 아미노산 배열 PRA에 [116]대응하는 12코돈 뉴클레오티드 배열 CCT CGG CGG GCA에 의해 형성된다.이 배열은 스파이크 [117]단백질의 S1/S2 절단 부위(P RR A R↓S)를 형성하는 아르기닌 및 세린의 상류이다.이러한 부위는 Orthocoronavirinae [116]내의 다른 바이러스에서 자연적으로 발생하는 일반적인 특징이지만, 베타-CoV속의 [118]다른 바이러스에서는 거의 나타나지 않으며, 이러한 [102]부위의 하위 속에서는 특이하다.퓨린 절단 부위 PRRAR↓는 알파코로나바이러스 [119]1주인 고양이 코로나 바이러스와 동일하다.

바이러스 유전자 배열 데이터는 시간과 공간에 의해 분리된 바이러스가 역학적으로 [120]연관될 가능성이 있는지에 대한 중요한 정보를 제공할 수 있다.충분한 수의 염기서열 게놈이 있으면 바이러스군의 돌연변이 이력의 계통수를 재구성할 수 있다.2020년 1월 12일까지 5개의 사스-CoV-2 게놈이 우한에서 분리되고 중국 질병통제예방센터(CCDC)와 기타 [110][121]기관에 의해 보고되었으며, 2020년 [122]1월 30일까지 게놈 수는 42개로 증가했다.이들 샘플의 계통학적 분석 결과, "공통 조상에 비해 최대 7개의 돌연변이와 높은 관련이 있다"는 결과가 나왔으며, 이는 첫 [122]번째 인체 감염이 2019년 11월 또는 12월에 발생했음을 의미한다.대유행 초기 계통수 토폴로지를 검사한 결과 인간 분리주 [123]간에 높은 유사성이 발견되었다.2021년 8월 21일 현재, 남극 대륙을 제외한 모든 대륙에서 표본 추출된 19개 변종에 속하는 3,422개의 SARS-CoV-2 게놈이 [124]공개되었다.

2020년 2월 11일, 국제 바이러스 분류 위원회는 보존된 핵산의 5개 염기서열을 기반으로 코로나 바이러스 간의 위계관계를 계산하는 기존 규칙에 따르면, 당시 2019-nCoV라고 불렸던 것과 2003년 사스 발생에서 발생한 바이러스 사이의 차이는 만들기 불충분하다고 발표했다.바이러스 종을 분리하는 거죠따라서 그들은 2019-nCoV를 중증 급성 호흡기 증후군 관련 코로나 바이러스로 [125]식별했다.

2020년 7월, 과학자들은 스파이크 단백질 변종 G614를 가진 더 전염성이 높은 SARS-CoV-2 변종이 D614를 대체하여 [126][127]대유행의 지배적인 형태로 나타났다고 보고했다.

코로나 바이러스 게놈과 하위 유전자는 6개의 개방형 판독 프레임(ORF)[128]을 인코딩한다.2020년 10월, 연구원들은 사스-CoV-2 게놈에서 ORF3d라는 이름의 중복 유전자를 발견했다.ORF3d에 의해 생성된 단백질이 어떤 기능을 가지고 있는지는 알 수 없지만, 그것은 강한 면역 반응을 유발한다.ORF3d는 판골린을 [129][130]감염시키는 코로나 바이러스의 변종에서 이전에 확인되었다.

계통수

SARS-CoV-2 및 관련 코로나 바이러스의 전체 유전자 염기서열에 기초한 계통수는 다음과 같다.[131][132]

사스-CoV-2 관련 코로나바이러스

(Bat) Rc-o319, 일본 이와테현[133] 라이놀로퍼스 코누투스 사스-SARS-CoV-2

Bat SL-ZXC21, 88%, SARS-CoV-2, 리놀로퍼스 고름균, 저장성 주산[134]

Bat SL-ZC45, 88%, SARS-CoV-2, 리놀로퍼스 고름균, 저장성[134] 주산

Pangolin SARSr-CoV-GX, 85.3% SARS-CoV-2, 마니스 자바니카, 동남아시아에서[135] 밀수

Pangolin SARSr-CoV-GD, 90.1% SARS-CoV-2, 마니스 자바니카, 동남아시아에서[136] 밀수

Bat RshSTT182, 92.6%, 캄보디아 Stung[137] Treng, Rinolophus Shameli, SARS-CoV-2

Bat RshSTT200, 92[137].6%, 캄보디아 Stung Treng, Rinolophus Shameli, SARS-CoV-2

(Bat) RacCS203, 사스-CoV-2 91.5% 태국 차초엥사오[132] 주 라이놀로퍼스 진큐미나투스

(배트) RmYN02, 93.3%의 SARS-CoV-2, 라이놀로퍼스 말라야누스, 윈난성 멍라[138]

(배트) RpYN06, 94.4%가 SARS-CoV-2, 리놀로퍼스 고름, 윈난성[131] 시샹바나

(Bat) RaTG13, 96.1%, 사스-CoV-2, 라이놀로퍼스 아피니, 윈난성[139] 모장

(Bat) BANAL-52, 96.8%, 라오스 비엔티안[140] 주 라이놀로퍼스 말라야누스

사스-CoV-2

SARS-CoV-1, 79%는 SARS-CoV-2


변종

주요 기사:SARS-CoV-2의 변종
B.1.1.7 변종 코로나 바이러스의 거짓 색상 전송 전자 현미경 사진.이 변종의 전달성 증가는 여기 녹색으로 표시된 스파이크 단백질의 구조 변화 때문인 것으로 생각된다.

사스-CoV-2에는 훨씬 더 큰 [141]집단으로 분류될 수 있는 수천 가지의 변종들이 있다.몇 가지 다른 분류군 명명법이 제안되었다.Nextstrain은 5개의 클래스(19A, 19B, 20A, 20B, 20C)로, GISAID는 7개의 클래스(19A, O, V, S, GH, GR)[142]로 나뉩니다.

2020년 말에 몇 가지 주목할 만한 SARS-CoV-2 변종이 나타났다.세계보건기구(WHO)는 현재 다음과 [143]같은 다섯 가지 우려 사항을 선언했습니다.

  • 알파: 리니지 B.1.1.7은 2020년 9월 영국에서 출현하여 전염성과 독성이 증가하였다.주목할 만한 돌연변이는 N501Y와 P681H이다.
    • 일부 혈통 B.1.1.7 바이러스에서 E484K 돌연변이가 발견되었으며 다양한 공중 보건 기관에 의해 추적되고 있다.
  • 베타: 리니지 B.1.351은 2020년 5월 남아프리카공화국에서 출현했으며, 일부 공중 보건 관계자들은 일부 백신의 효능에 대한 영향에 대해 경종을 울렸다.주목할 만한 돌연변이는 K417N, E484K 및 N501Y이다.
  • 감마: 리니지 P.1은 항원성 변화와 함께 전염성과 독성이 증가했다는 증거와 함께 2020년 11월에 브라질에서 나타났다.백신 효능에 대한 비슷한 우려가 제기되었다.주목할 만한 돌연변이로는 K417N, E484K 및 N501Y도 있다.
  • 델타: 리니지 B.1.617.2는 2020년 10월에 인도에서 등장했습니다.또한 전염성이 증가하고 항원성이 변화한다는 증거가 있다.
  • 오미크론: 리니지 B.1.529는 2021년 11월 보츠와나에서 등장했다.

다른 주목할 만한 변종으로는 조사 중인 6개의 다른 WHO 지정 변종과 덴마크의 밍크 사이에서 출현하여 밍크 안락사 캠페인을 사실상 [144]멸종시킨 클러스터 5가 있다.

바이러스학

구조.

Figure of a spherical SARSr-CoV virion showing locations of structural proteins forming the viral envelope and the inner nucleocapsid
SARSR-CoV 바이러스군의 구조

각 SARS-CoV-2 비리온은 60-140나노미터(2.4×10-5−6)이다.지름이 [105][82]5×10인치−6)이며, 지구촌 인구 내 질량은 0.1~[145]10kg으로 추정되고 있다.다른 코로나 바이러스들처럼, SARS-CoV-2는 S, E, M, N으로 알려진 4개의 구조 단백질을 가지고 있다; N 단백질은 RNA 게놈을 고정시키고, S, E, 그리고 M 단백질은 함께 바이러스 [146]외피를 형성한다.코로나바이러스 S 단백질은 당단백질이며 I형 막 단백질이다.[113]2개의 기능부(S1과 S2)[104]로 구분된다.SARS-CoV-2에서 극저온 전자현미경을 [147][148]이용해 원자 수준에서 촬상된 스파이크 단백질은 바이러스가 [146]숙주세포의 막에 부착되어 융합되는 단백질이다. 구체적으로는 S1 서브유닛이 부착을 촉매하는 S2 서브유닛 [149]융합이다.

SARS‑CoV‑2 spike homotrimer focusing upon one protein subunit with an ACE2 binding domain highlighted
1개의 단백질 서브유닛이 강조된 SARS-CoV-2 스파이크 호모트리머.ACE2 바인딩 도메인은 마젠타입니다.

게놈

2022년 초까지 약 700만 개의 SARS-CoV-2 게놈이 배열되어 공공 데이터베이스에 저장되었고 매달 [150]80만 개 정도가 추가되었다.

SARS-CoV-2는 약 3만 염기의 [104]선형의 양성 단일 가닥 RNA 게놈을 가지고 있다.그것의 게놈은 다른 코로나 [151]바이러스들처럼 시토신(C)과 구아닌(G) 뉴클레오티드에 대한 편견을 가지고 있다.게놈은 U(32.2%), A(29.9%), G(19.6%)와 C(18.[152]3%)의 조성이 가장 높다.뉴클레오티드 편향은 구아닌과 사이토신이 각각 [153]아데노신과 우라실로 변이되면서 발생한다.CG 디뉴클레오티드의 돌연변이는 세포의 [154]아연 핑거 항바이러스 단백질 관련 방어 메커니즘을 피하고 복제 및 번역 중에 게놈을 결합 해제하는 에너지를 낮추기 위해 발생하는 것으로 생각됩니다(아데노신과 우라실 염기쌍은 2개의 수소 결합을 통해, 시토신과 구아닌은 3개를 통해).[153]게놈에서 CG 디뉴클레오티드의 고갈은 바이러스를 현저한 코돈 사용 편중으로 이끌었다.예를 들어 Arginine의 6가지 코돈은 AGA(2.67, CGU(1.46, AGG(.81, CGC 0.58, CGA.29 및 CGG(.19)[152]의 상대적인 동의어 코돈 사용을 가지고 있습니다.유사한 코돈 사용 편향 경향은 다른 사스 관련 코로나 [155]바이러스에서도 나타난다.

레플리케이션 사이클

바이러스 감염은 바이러스 입자가 숙주 표면 세포 [156]수용체에 결합하면서 시작된다.바이러스의 스파이크 단백질에 대한 단백질 모델링 실험은 곧 SARS-CoV-2가 세포 [157]진입 메커니즘으로 사용하기 위해 인간 세포의 수용체 안지오텐신 변환 효소 2(ACE2)에 충분한 친화력을 가지고 있다는 것을 시사했다.2020년 1월 22일까지 중국의 한 그룹과 미국의 한 그룹이 독립적으로 역유전학적 방법을 사용하여 ACE2가 SARS-CoV-2의 [79][158][159][160]수용체 역할을 할 수 있음을 실험적으로 입증했다.연구에 따르면 사스-CoV-2는 원래 사스 [147][161]바이러스보다 인간의 ACE2에 더 높은 친화력을 가지고 있다.사스-CoV-2는 또한 세포 [162]진입을 돕기 위해 바시진을 사용할 수 있다.

SARS-CoV-2의 [24]진입에는 막간 통과 단백질 효소인 세린2(TMPRSS2)에 의한 초기 스파이크 단백질 프라이밍이 필수적이다.호스트 단백질 neuroilin 1(NRP1)은 ACE2를 [163]사용하여 호스트 세포 진입 시 바이러스를 지원할 수 있습니다.SARS-CoV-2 비리온이 표적 세포에 부착된 후 세포의 TMPRSS2가 바이러스의 스파이크 단백질을 절단하여 S2 서브유닛의 융합펩타이드와 숙주 [149]수용체 ACE2를 노출시킨다.핵융합 후, 바이러스온 주위에 내분체가 형성되어 숙주 세포의 나머지 부분으로부터 분리된다.비리온은 엔도솜의 pH가 떨어지거나 숙주 시스테인 단백질 분해효소인 카테프신이 [149]엔도솜을 분해할 때 빠져나간다.그리고 나서 바이러스리온은 RNA를 세포에 방출하고 세포가 더 많은 [164]세포를 감염시키는 바이러스의 복사본을 만들고 퍼뜨리도록 강요한다.

사스-CoV-2는 숙주 세포에서 새로운 바이러스들의 분해를 촉진하고 면역 [146]반응을 억제하는 최소 세 가지 독성 인자를 생성한다.유사한 코로나바이러스에서 볼 수 있듯이 ACE2의 하향 조절을 포함하는지 여부는 조사 중에 있다(2020년 [165]5월 현재).

SARS-CoV-2 emerging from a human cell
SARS-CoV-2 virions emerging from a human cell
실험실에서 배양된 인간 세포에서 발생하는 SARS-CoV-2 바이러스(노란색)의 디지털 컬러 주사 전자 현미경

치료 및 약물 개발

사스-CoV-2를 효과적으로 억제하는 약은 거의 없는 것으로 알려져 있다.마시티닙은 임상적으로 안전한 약물로 최근 주요 단백질 분해효소인 3CLpro를 억제하는 것으로 밝혀졌으며 생쥐의 폐와 코에서 바이러스성 티터가 200배 이상 감소하는 것으로 나타났다.그러나 2021년 [166][needs update]8월 현재 인체에서 COVID-19 치료를 위해 승인되지 않았다.2021년 12월 미국은 바이러스 치료를 위해 Nirmatrelvir/Ritonavir에 긴급 사용을 허가했고,[168][169][170] 유럽연합, 영국 및 캐나다도 [167]곧 완전한 허가를 받았다.한 연구에 따르면 Nirmatrelvir/Ritonavir는 입원 및 사망 위험을 88%[171] 줄였다.

COVID Moonshot은 SARS-CoV-2 [172]치료를 위한 특허가 없는 경구 항바이러스제 개발을 목표로 2020년 3월에 시작된 국제 공동 오픈 과학 프로젝트이다.

역학

주요 기사: COVID-19 대유행

중국 감시 시스템 내에서 수집된 소급 테스트에서는 2019년 [85]후반기에 우한에서 SARS-CoV-2의 실질적인 인식되지 않은 순환 징후가 발견되지 않았다.

2020년 11월 메타분석에서는 바이러스의 기본 번식수( 0 를 2.39~3.[20]44로 추정했다.이것은 지역사회의 구성원이 면역이 되지 않고 예방 조치가 취해지지 않을 때 바이러스에 의한 각각의 감염이 2.39에서 3.44의 새로운 감염을 야기할 것으로 예상된다는 것을 의미한다.유람선에서 [173]볼 수 있는 것과 같이 인구 밀도가 높은 조건에서는 복제 수가 더 높을 수 있다.인간의 행동은 R0의 값에 영향을 미치므로 R0의 추정치는 다른 국가, 문화 및 사회 규범에 따라 다르다.예를 들어, 한 연구에서는 스웨덴, 벨기에, 네덜란드에서 상대적으로 낮은 R0(약 3.5)을 발견한 반면, 스페인과 미국은 R0 값(각각 5.9 [174]- 6.4)이 유의미하게 높았다.

SARS-CoV-2 변종의 생식값 R0
변종 R0 원천
기준/추골 변형률 ~2.8 [175]
알파(B.1.1.7) (이전 모델보다 40~90% 높음) [176]
델타(B.1.617.2) ~5 (3-8) [177]

중국 [178]본토에서 확인된 감염 사례는 약 96,000건이다.확인된 사례나 진단 가능한 질병으로 진행되는 감염의 비율은 [179]아직 불분명하지만, 한 수학적 모델은 2020년 1월 25일 우한에서만 75,815명이 감염되었다고 추정했다.이 때 전 세계적으로 확인된 환자 수는 2,015명에 [180]불과했다.2020년 2월 24일 이전에는 전 세계 COVID-19로 인한 사망자의 95% 이상이 우한이 [181][182]위치한 후베이성에서 발생했다.2022년 7월 29일 현재, 이 비율은 0.050%[178]로 감소하였다.

2022년 7월 29일 현재 진행 중인 [178]대유행에서 확인된 SARS-CoV-2 감염 환자는 총 574,933,734명이다.바이러스로 인한 총 사망자 수는 6,395,[178]753명이다.

「 」를 참조해 주세요.

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